Le repêchage d'expansion de la MLB de 1961 a été organisé par la Major League Baseball le 10 octobre 1961 pour remplir les listes des Mets de New York et des Houston Colt .45 , les nouvelles franchises qui entreraient dans la ligue lors de la saison 1962. Le bassin de joueurs parmi lesquels ils pouvaient sélectionner était limité aux clubs de balle existants de la Ligue nationale .
En raison de la mauvaise performance des Mets et Colt .45 après deux saisons, un autre repêchage a été organisé pour les équipes. Les autres clubs de la Ligue nationale existants ont mis à disposition quatre joueurs de leur liste de 40 joueurs à 30 000 $ chacun. Seuls huit joueurs ont pu être sélectionnés entre les deux clubs.