Les éliminatoires du championnat de football de la division III de la NCAA 2012 étaient le 40e tournoi annuel à élimination directe pour déterminer le champion national du football universitaire masculin de la division III de la NCAA . Le match de championnat Stagg Bowl a eu lieu au Salem Football Stadium de Salem, en Virginie, pour la 20e fois.
Qualification
Vingt-quatre conférences ont répondu aux exigences d'une offre automatique (« Pool A ») pour les séries éliminatoires. Outre le NESCAC, qui ne participe pas aux séries éliminatoires, deux conférences (la SAA et l'UAA) n'avaient pas de candidature pour la poule A, ni l'une ni l'autre ne répondant à l'exigence de sept membres.
Les écoles ne faisant pas partie des conférences du pool A étaient éligibles pour le pool B. Le nombre de candidatures du pool B a été déterminé en calculant le ratio des conférences du pool A aux écoles de ces conférences et en appliquant ce ratio au nombre d'écoles du pool B. Les 24 conférences du groupe A contenaient 214 écoles, soit une moyenne de 8,9 équipes par conférence. Quinze écoles étaient dans la poule B, assez pour une seule offre.
Les sept places restantes en séries éliminatoires étaient des équipes en liberté (« Pool C »).