Système APG III - APG III system

Le système APG III de classification des plantes à fleurs est la troisième version d'un système moderne, principalement moléculaire , de taxonomie des plantes développé par l' Angiosperm Phyogeny Group (APG). Publié en 2009, il a été remplacé en 2016 par une nouvelle révision, le système APG IV .

En plus de la publication décrivant le nouveau système, il y avait deux publications d'accompagnement dans le même numéro du Botanical Journal of the Linnean Society . La première, par Chase & Reveal, était une classification phylogénétique formelle de toutes les plantes terrestres (embryophytes), compatible avec la classification APG III. Comme l'APG a choisi d'éviter les rangs au-dessus de l'ordre, cet article était destiné à intégrer le système dans la hiérarchie linnéenne existante pour ceux qui préfèrent une telle classification. Le résultat a été que toutes les plantes terrestres ont été placées dans la classe Equisetopsida, qui a ensuite été divisée en 16 sous-classes et une multitude de super-ordres. La seconde, par Haston et al. , était une séquence linéaire de familles suivant le système APG III (LAPG III).

Cela a fourni une liste numérotée aux 413 familles d'APG III. Une séquence linéaire est particulièrement utile aux conservateurs d' herbier et à ceux travaillant sur des ouvrages floristiques souhaitant organiser leurs taxons selon l'APG III.

Organisation

Le système APG III a reconnu l'ensemble des 45 commandes du système précédent, ainsi que 14 nouvelles. L'ordre Ceratophyllales a été marqué à tort comme un nouvel ordre, car il avait été reconnu dans les deux systèmes APG précédents . Les commandes nouvellement reconnues étaient :

Amborellales , Nymphaeales , Chloranthales , Petrosaviales , Trochodendrales , Buxales , Vitales , Zygophyllales , Picramniales , Huerteales , Berberidopsidales , Escalloniales , Bruniales et Paracryphiales .

La désignation de « familles crochetées » alternatives a été abandonnée dans l'APG III, car son inclusion dans le système précédent avait été impopulaire. L'APG III a reconnu 413 familles , 43 de moins que dans le système précédent. Quarante-quatre des 55 « familles entre crochets » ont été supprimées, et 20 autres familles ont également été supprimées.

Les familles entre parenthèses abandonnées étaient :

Illiciaceae , alliacées , Agapanthaceae , Agavaceae , Aphyllanthaceae , Hesperocallidaceae , Hyacinthaceae , Laxmanniaceae , Ruscaceae , Themidaceae , Asphodelaceae , Hemerocallidaceae , Kingdoniaceae , Fumariaceae , Pteridophyllaceae , Didymelaceae , Tetracentraceae , pterostemonaceae , Hypseocharitaceae , francoaceae , Memecylaceae , Lepuropetalaceae , Rhoipteleaceae , Medusagynaceae , quiinaceae , Malesherbiaceae , Turneraceae , Bretschneideraceae , Diegodendraceae , Cochlospermaceae , Peganaceae , Tetradiclidaceae , Nyssaceae , Ternstroemiaceae , Pellicieraceae , Aucubaceae , Donatiaceae , Lobeliaceae , Desfontainiaceae , Diervillaceae , Dipsacaceae , Linnaeaceae , morinaceae et Valerianaceae .

Les autres familles abandonnées étaient :

Limnocharitaceae , luzuriagaceae , Sparganiaceae , Ixerbaceae , ledocarpaceae , Heteropyxidaceae , Psiloxylaceae , Oliniaceae , Rhynchocalycaceae , parnassiaceae , Maesaceae , Myrsinaceae , theophrastaceae , Eremosynaceae , Polyosmaceae , Tribelaceae , Sphenostemonaceae , Aralidiaceae , Mackinlayaceae et Melanophyllaceae .

21 familles ont été acceptées dans le système APG III qui n'avait pas été dans le système précédent, et quelques familles ont été déplacées vers une position différente. Les familles nouvellement reconnues sont :

Cynomoriaceae , Haptanthaceae , Petermanniaceae , schoepfiaceae , Limeaceae , lophiocarpaceae , montiaceae , talinaceae , anacampserotaceae , centroplacaceae , calophyllaceae , Guamatelaceae , Gerrardinaceae , Dipentodontaceae , Capparidaceae , Cleomaceae , cytinaceae , Mitrastemonaceae , Metteniusaceae , linderniaceae et Thomandersiaceae .

Le nombre de familles non classées dans aucun ordre a été réduit de 39 à 10. Les Apodanthacées et les Cynomoriaceae ont été placées parmi les angiospermes , incertae sedis , c'est-à-dire dans aucun groupe au sein des angiospermes. Huit autres familles ont été placées incertae sedis dans divers groupes supra-ordinaux au sein des angiospermes. Les familles non classées dans aucun ordre étaient :

Apodanthaceae , Cynomoriaceae , Dasypogonaceae , Sabiacées , Dilleniaceae , Icacinaceae , Metteniusaceae , Oncothecaceae , Vahliaceae et Boraginaceae .

Le paragraphe ci-dessous indique le nombre de familles dans chaque ordre et le placement de ces familles qui n'ont été incluses dans aucun ordre. Ces chiffres ont été produits en comptant simplement les familles dans le texte du document qui a établi l'APG III.

COMMANDES : Amborellales (1), Nymphaeales (3), Austrobaileyales (3), Chloranthales (1), Canellales (2), Piperales (5), Magnoliales (6), Laurales (7), Acorales (1), Alismatales (13 ), Petrosaviales (1), Dioscoreales (3), Pandanales (5), Liliales (10), Asparagales (14), Arecales (1), Poales (16), Commelinales (5), Zingiberales (8), Ceratophyllales (1 ), Ranunculales (7), Proteales (3), Trochodendrales (1), Buxales (2), Gunnerales (2), Saxifragales (14), Vitales (1), Zygophyllales (2), Celastrales (2), Oxalidales (7 ), Malpighiales (35), Fabales (4), Rosales (9), Fagales (7), Cucurbitales (7), Geraniales (3), Myrtales (9), Crossosomatales (7), Picramniales (1), Sapindales (9 ), Huerteales (3), Brassicales (17), Malvales (10), Berberidopsidales (2), Santalales (7), Caryophyllales (34), Cornales (6), Ericales (22), Garryales (2), Gentianales (5 ), Solanales (5), Lamiales (23), Aquifoliales (5), Asterales (11), Escalloniales (1), Bruniales (2), Apiales (7), Paracryphiales (1), Dipsacales (2).

GROUPES SUPRA-ORDINAUX : commelinidae (1), eudicots basaux (1), Pentapetalae (1), lamiidae incertae sedis (3), core lamiidae (2), angiospermes incertae sedis (2).

La circonscription de la famille des Icacinaceae reste particulièrement douteuse. Apodytes et son proche parent, Rhaphiostylis , ainsi que Emmotum , Cassinopsis , et quelques autres genres ont été provisoirement retenues dans jusqu'à ce que d' autres études peuvent déterminer si elles appartiennent bien là.

Trois genres ( Gumillea , Nicobariodendron et Petenaea ) ont été placés dans les angiospermes incertae sedis. Gumillea avait été déclassé dans l'APG II . Nicobariodendron et Petenaea ont été récemment ajoutés à la liste. Ce dernier a ensuite été placé dans sa propre famille Petenaeaceae dans l'ordre Huerteales

La classification est présentée ci-dessous en deux versions. La version courte va au niveau des commandes et des familles non placées dans une commande. La version détaillée montre toutes les familles. Les commandes de même niveau dans la classification sont classées par ordre alphabétique. Notez que les commandes ne peuvent pas contenir les mêmes familles que dans les versions antérieures du système APG ( système APG , système APG II ). De plus amples détails sur les relations peuvent être vus dans l'arbre phylogénétique ci-dessous.

Version courte

Version détaillée

Légende:

* = nouveau placement familial;
= commande nouvellement reconnue pour le système APG ;
§ = nouvelle circonscription familiale décrite dans le texte ;
$ = familles qui représentent la circonscription plus large des options disponibles dans APG II et privilégiées ici ;
$$ = familles qui étaient entre crochets dans APG II, les circonscriptions plus étroites favorisées ici.

Angiospermes

Magnoliides

Monocotylédones

Commelinides

Probable soeur des eudicots

Eudicots

Eudicots de base

Rosides

Fabids ( eurosids I )

malvides ( eurosidés II )

Astérides

lamiidés ( euastéridés I )

campanulidés ( euastéridés II )

Taxons de position incertaine

Phylogénie

Le système APG III était basé sur un arbre phylogénétique pour les angiospermes qui comprenait tous les 59 ordres et 4 des familles non placées. Les positions systématiques des 6 autres familles non placées étaient si incertaines qu'elles ne pouvaient être placées dans aucune des polytomies de l'arbre. Ils sont indiqués dans le tableau de classification intitulé "Version détaillée" ci-dessus, 4 dans les Euastéridés I et 2 dans les Taxons de position incertaine.

L'arbre phylogénétique présenté ci-dessous a été publié avec le système APG III, mais sans certaines des étiquettes ajoutées ici.

angiospermes 

Amborellales

Nymphéales

Austrobaleyales

Chloranthales

magnoliides 

Canellales

Piperales

Magnoliales

Laurales

monocotylédones 

Acorales

Alismatales

Petrosaviales

Dioscoreales

Pandanales

Liliales

Asperges

commelinides 

Dasypogonacées

Arecales

Poales

Commelinales

Zingibérales

Ceratophyllales

eudicots 

Renoncules

Sabiacées

Proteaux

Trochodendrales

Buxales

eudicots de base 

Gunnerales

Dilléniacées

Saxifragales

rosides 

Vitales

eurosides 
fabids 

Zygophyllales

Celastrales

Oxalidales

Malpighiales

Fabales

Rosales

Fagales

Cucurbitales

malvides 

Géraniales

Myrtales

Crossosomatales

Picramniales

Sapindales

Huerteales

Brassicales

Malvales

Berberidopsidales

Santalales

Caryophyllales

astérides 

Cornales

Ericales

euastéridés 
lamiidés 

Garryales

Boraginacées

Gentianes

Solanales

Lamiales

campanulides 

Aquifoliales

Astérales

Escalloniales

Bruniales

Apiales

Paracryphiales

Dipsacales

Sous-familles remplaçant les familles abandonnées

Un certain nombre de sous-familles ont été proposées pour remplacer certaines des familles qui étaient facultatives (c'est-à-dire entre crochets) dans l'APG II, mais ont été abandonnées dans l'APG III. Ceux-ci sont indiqués dans le tableau ci-dessous.

Sous-familles remplaçant les familles entre parenthèses APG II
Famille de supports APG II Famille APG III : sous-famille
Agapanthacées Amaryllidacées : Agapanthoideae
Agavacées Asparagacées : Agavoideae
Alliacées Amaryllidacées : Allioideae
Amaryllidacées Amaryllidacées : Amaryllidoideae
Aphyllanthacées Asparagacées : Aphyllanthoideae
Asparagacées Asparagacées : Asparagoideae
Asphodelacées Xanthorrhoeaceae : Asphodeloideae
Hémérocallidacées Xanthorrhoeaceae : Hemerocallidoideae
Hespérocallidacées Asparagacées : Agavoideae
Hyacinthacées Asparagacées : Scilloideae
Laxmanniacées Asparagacées : Lomandroideae
Ruscacées Asparagacées : Nolinoideae
Thémidacées Asparagacées : Brodiaeoideae
Xanthorrhoeacées Xanthorrhoeaceae : Xanthorrhoeoideae

Les références

Liens externes