Actinobactéries - Actinobacteria

" Actinobactéries "
Actinomyces israelii.jpg
Micrographie électronique à balayage d' Actinomyces israelii .
Classement scientifique e
Domaine: Bactéries
(non classé): Terrabactéries
Phylum: Actinobactéries
Goodfellow 2012
Des classes
Synonymes
  • " Actinobacteraeota " Oren et al. 2015
  • " Actinobacteriota " Whitman et al. 2018
  • " Actinobactéries " Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997
  • " Actinobactéries " ( ex Margulis 1974) Cavalier-Smith 2020
  • " Actinomycètes " Krasil'nikov 1949

Les « Actinobactéries » sont un phylum de bactéries majoritairement Gram-positives . Ils peuvent être terrestres ou aquatiques . Ils sont d'une grande importance économique pour l'homme car l' agriculture et les forêts dépendent de leur contribution aux systèmes pédologiques . Dans le sol, ils aident à décomposer la matière organique des organismes morts afin que les molécules puissent être à nouveau absorbées par les plantes . Bien que ce rôle soit également joué par les champignons , les actinobactéries sont beaucoup plus petites et n'occupent probablement pas la même niche écologique . Dans ce rôle, les colonies développent souvent des mycéliums étendus , comme le ferait un champignon, et le nom d'un ordre important du phylum, Actinomycetales (les actinomycètes), reflète qu'ils ont longtemps été considérés comme des champignons. Certaines actinobactéries du sol (telles que Frankia ) vivent en symbiose avec les plantes dont les racines envahissent le sol, fixant l'azote pour les plantes en échange de l'accès à certains des saccharides de la plante . D'autres espèces, telles que de nombreux membres du genre Mycobacterium , sont des agents pathogènes importants .

Au-delà du grand intérêt des « Actinobactéries » pour leur rôle dans le sol, il reste encore beaucoup à apprendre sur elles. Bien qu'actuellement comprises principalement comme des bactéries du sol, elles pourraient être plus abondantes dans les eaux douces. " Actinobacteria " est l'un des phylums bactériens dominants et contient l'un des plus grands genres bactériens, Streptomyces . Streptomyces et d'autres actinobactéries sont des contributeurs majeurs au tampon biologique des sols. Ils sont également à l'origine de nombreux antibiotiques .

Le genre « Actinobacteria » Bifidobacterium est la bactérie la plus répandue dans le microbiome des nourrissons humains. Bien que les adultes aient moins de bifidobactéries, les bifidobactéries intestinales aident à maintenir la barrière muqueuse et à réduire les lipopolysaccharides dans l'intestin.

Bien que certaines des cellules bactériennes les plus grandes et les plus complexes appartiennent aux " Actinobactéries ", le groupe des Actinomarinales marines a été décrit comme possédant les plus petites cellules procaryotes libres .

Certaines « Actinobactéries » sibériennes ou antarctiques seraient le plus ancien organisme vivant sur Terre, gelées dans le pergélisol il y a environ un demi-million d'années. Les symptômes de la vie ont été détectés par le CO
2
libération d'échantillons de pergélisol de 640 kya ou moins.

Général

La plupart des « Actinobactéries » d'importance médicale ou économique appartiennent à la classe des Actinobactéries et appartiennent à l'ordre des Actinomycétales . Alors que beaucoup d'entre eux provoquent des maladies chez l'homme, Streptomyces est remarquable en tant que source d' antibiotiques .

De ces « Actinobactéries » ne faisant pas partie des Actinomycétales , Gardnerella est l'une des plus étudiées. La classification de Gardnerella est controversée et MeSH la classe à la fois comme un organisme à Gram positif et à Gram négatif .

Les " actinobactéries ", en particulier les Streptomyces spp., sont reconnues comme les producteurs de nombreux métabolites bioactifs utiles aux humains en médecine, tels que les antibactériens, les antifongiques, les antiviraux, les antithrombotiques, les immunomodificateurs, les médicaments antitumoraux et les inhibiteurs d'enzymes ; et dans l'agriculture, y compris les insecticides, les herbicides, les fongicides et les substances favorisant la croissance des plantes et des animaux. Les antibiotiques dérivés des « actinobactéries » qui sont importants en médecine comprennent les aminosides, les anthracyclines, le chloramphénicol, les macrolides, les tétracyclines, etc.

Les « actinobactéries » ont une teneur élevée en guanine et en cytosine dans leur ADN . La teneur en G+C des « Actinobactéries » peut atteindre 70 %, bien que certaines puissent avoir une faible teneur en G+C.

L'analyse de la séquence de la glutamine synthétase a été suggérée pour l'analyse phylogénétique des " Actinobactéries ".

Phylogénie

La taxonomie actuellement acceptée est basée sur la Liste des noms procaryotes avec standing in Nomenclature (LPSN). La phylogénie est basée sur l'analyse du génome entier.

Actinobactéries  (phylum)

Rubrobactéries

Thermoléophilie

Coriobactéries

Acidimicrobiie

Nitriliruptoria

Actinobactéries (classe)

sous-groupe

Chloroflexi

Voir également

Les références

Lectures complémentaires

Liens externes