Domaine (biologie) - Domain (biology)
Dans biologique taxonomie , un domaine ( / d ə m eɪ n / ou / d oʊ m eɪ n / ) ( latin : regio ), aussi la domination , superkingdom , royaume ou empire , est le plus haut rang taxonomique des organismes dans le système de taxonomie à trois domaines conçu par Carl Woese et al. en 1990.
Selon ce système, l' arbre de vie se compose de trois domaines : Archaea , Bacteria et Eukarya . Les deux premiers sont tous des micro - organismes procaryotes , ou pour la plupart des organismes unicellulaires dont les cellules ont un noyau déformé ou non lié à la membrane . Toute vie qui a un noyau cellulaire et des organites liés à la membrane eucaryote est incluse dans Eukarya.
La vie non cellulaire n'est pas incluse dans ce système. Les alternatives au système à trois domaines comprennent le système antérieur à deux empires (avec les empires Prokaryota et Eukaryota) et l' hypothèse des éocytes (avec deux domaines de bactéries et d'archées, et d'Eucarya inclus dans les archées).
Terminologie
Le terme "domaine" a été proposé par Carl Woese , Otto Kandler et Mark Wheelis (1990) dans un système à trois domaines . Ce terme représente un synonyme de la catégorie de domination (Lat. dominium ), introduite par Moore en 1974.
Caractéristiques des trois domaines
Chacun de ces trois domaines contient un ARNr unique . Ceci constitue la base du système à trois domaines. Alors que la présence d'une membrane nucléaire différencie l'Eucarya des archées et des bactéries, qui n'ont pas toutes deux de membrane nucléaire, des marqueurs biochimiques et ARN distincts différencient les archées et les bactéries les unes des autres.
Archées
Les archées sont des cellules procaryotes, généralement caractérisées par des lipides membranaires qui sont des chaînes hydrocarbonées ramifiées attachées au glycérol par des liaisons éther. La présence de ces liaisons éther dans les archées ajoute à leur capacité à résister à des températures extrêmes et à des conditions très acides , mais de nombreuses archées vivent dans des environnements doux. Les halophiles , des organismes qui prospèrent dans des environnements très salés, et les hyperthermophiles , des organismes qui prospèrent dans des environnements extrêmement chauds, sont des exemples d'archées.
Les archées ont évolué dans de nombreuses tailles de cellules, mais toutes sont relativement petites. Leur taille varie de 0,1 m à 15 m de diamètre et jusqu'à 200 m de longueur. Ils ont à peu près la taille d'une bactérie ou une taille similaire à celle des mitochondries trouvées dans les cellules eucaryotes. Les membres du genre Thermoplasma sont les plus petits des Archaea.
Bactéries
Même si les bactéries sont des cellules procaryotes tout comme les archées, leurs membranes sont constituées de bicouches phospholipidiques. Les cyanobactéries et les mycoplasmes sont deux exemples de bactéries. Ils n'ont généralement pas de liaisons éther comme Archaea, et ils sont regroupés dans une catégorie différente - et donc un domaine différent. Il y a une grande diversité dans ce domaine. Confus par cette diversité et ce transfert horizontal de gènes , il est quasiment impossible de déterminer combien d'espèces de bactéries existent sur la planète, ou de les organiser en arborescence, sans interconnexions entre les branches.
Eucarya
Les membres du domaine Eukarya—appelés eucaryotes—ont des organites liés à la membrane (y compris un noyau contenant du matériel génétique) et sont représentés par cinq règnes : Plantae , Protozoa , Animalia , Chromista et Fungi .
Exclusion des virus et prions
Le système à trois domaines n'inclut aucune forme de vie non cellulaire . Stefan Luketa a proposé un système à cinq domaines en 2012, ajoutant Prionobiota (acellulaire et sans acide nucléique) et Virusobiota (acellulaire mais avec acide nucléique) aux trois domaines traditionnels.
Classements alternatifs
Nœud racine taxonomique | Deux superdomaines (controversé) | Deux empires | Trois domaines | Cinq royaumes | Six royaumes | Hypothèse des ovocytes |
---|---|---|---|---|---|---|
Biote / Vitae / Vie | Acytota / Aphanobionta - Vie non cellulaire | Virusobiota ( Virus , Viroïdes ) | ||||
Prionobiota ( Prions ) | ||||||
Cytota vie cellulaire |
Procaryota / Procarya ( Monera ) |
Bactéries | Bactéries | Eubactéries | Bactéries | |
Archées | Archées | Archaebactéries | Archaea y compris eucaryotes | |||
Eucaryotes / Eucaryotes | Protiste | |||||
Champignons | ||||||
Plantes | ||||||
Animalia |
Voir aussi : Classification des virus Les classifications
alternatives de la vie incluent :
- Le système à deux empires ou système de superdomaines , avec des groupements de niveau supérieur de Prokaryota (ou Monera ) et Eukaryota.
- L' hypothèse de l'éocyte , proposée pour la première fois par James A. Lake et al . en 1984, qui postule deux domaines ( Bacteria et Archaea , avec Eukaryota inclus dans Archaea).
Voir également
- Matière noire biologique
- Neomura , qui sont les deux domaines de vie des Archaea et Eukaryota
- Phylogénétique
- Structure des protéines
- Royaume (virologie) , un rang équivalent pour la vie non cellulaire
- Systématique