FLNA - FLNA
La filamine A, alpha ( FLNA ) est une protéine qui, chez l'homme, est codée par le gène FLNA .
Fonction
La protéine de liaison à l'actine, ou filamine , est une protéine de 280 kD qui réticule les filaments d'actine en réseaux orthogonaux dans le cytoplasme cortical et participe à l'ancrage des protéines membranaires du cytosquelette d' actine . Le remodelage du cytosquelette est au cœur de la modulation de la forme et de la migration des cellules. La filamine A, codée par le gène FLNA, est une filamine largement exprimée qui régule la réorganisation du cytosquelette d'actine en interagissant avec les intégrines , les complexes récepteurs transmembranaires et les messagers secondaires .
Structure
La structure de la protéine comprend un domaine N terminal de liaison à l' actine , 24 répétitions internes et 2 régions charnières.
Interactions
Il a été démontré que la filamine interagit avec :
Édition d'ARN
Le résidu édité a été précédemment enregistré en tant que polymorphisme nucléotidique unique (SNP) dans dbSNP .
Taper
L' édition d'ARN A à I est catalysée par une famille d'adénosine désaminases agissant sur l'ARN (ADAR) qui reconnaissent spécifiquement les adénosines dans les régions double brin des pré-ARNm et les désaminent en inosine. Les inosines sont reconnues comme guanosine par la machinerie translationnelle des cellules. Il existe trois membres de la famille ADAR, les ADAR 1-3, ADAR 1 et ADAR 2 étant les seuls membres enzymatiquement actifs. On pense que l'ADAR3 a un rôle régulateur dans le cerveau. ADAR1 et ADAR 2 sont largement exprimés dans les tissus tandis que ADAR 3 est limité au cerveau. Les régions double brin d'ARN sont formées par appariement de bases entre des résidus dans une région complémentaire de la région du site d'édition. Cette région complémentaire se trouve généralement dans un intron voisin mais peut également être localisée dans une séquence exonique. La région qui s'apparie avec la région d'édition est connue sous le nom de séquence complémentaire d'édition (ECS).
Placer
Le seul site d'édition du pré-ARNm du FLNA est situé dans l'acide aminé 2341 de la protéine finale. Le codon Glutamine (Q) est modifié en raison d'une désamination spécifique au site d'une adénosine au site d'édition en un codon Arginine (R). La région d'édition est prédite pour former une région double brin de 32 paires de bases de long avec une séquence complémentaire à environ 200 nucléotides en aval du site d'édition. Cet ECS se trouve dans une séquence intronique. Le montage sur le site Q/R est susceptible d'impliquer à la fois ADAR1 et ADAR2. Les souris ADAR2 montrent une diminution du montage sur le site Q/R. Les doubles knock-out ADAR1 n'ont aucun effet sur le montage.
Structure
L'adénosine éditée est localisée dans l'immunoglobuline 22 comme la répétition de la protéine. Cette région est un domaine de liaison à l' intégrine et un domaine de liaison RAC1 . Le changement d'acide aminé est susceptible d'affecter le potentiel électrostatique des domaines de liaison. Le site d'édition FLNA est à 2 nucléotides d'un site d'épissage comme le site R/G de GluR-2. Les deux transcrits ont 7/8 nucléotides identiques autour de leurs sites d'édition. Comme il est largement admis que l'édition sur le site Q/R GLUR-2 influence l'épissage, la similitude de la séquence et du site d'édition pourrait signifier que l'édition sur le site FLNA pourrait également réguler l'épissage. Des expériences in vitro de gluR-2 ont montré que la présence d'ADAR2 entraîne une inhibition de l'épissage. L'analyse des données EST pour FLNA montre qu'il existe un lien entre l'édition du dernier codon d'exon et la rétention de l'intron suivant.
Fonction
Le changement de potentiel électrostatique est susceptible d'affecter la liaison du FLNA aux nombreuses protéines avec lesquelles il interagit.
Les références
Lectures complémentaires
- Light S, Sagit R, Ithychanda SS, Qin J, Elofsson A (septembre 2012). "L'évolution de la filamine - une perspective de répétition de domaine protéique" . Journal de biologie structurale . 179 (3) : 289-98. doi : 10.1016/j.jsb.2012.02.010 . PMC 3728663 . PMID 22414427 .
- Stossel TP, Condeelis J, Cooley L, Hartwig JH, Noegel A, Schleicher M, Shapiro SS (2001). « Les filamines en tant qu'intégrateurs de la mécanique cellulaire et de la signalisation ». Nat. Rév. Mol. Cell Biol . 2 (2) : 138–45. doi : 10.1038/35052082 . PMID 11252955 . S2CID 5203942 .
- van der Flier A, Sonnenberg A (2001). "Aspects structurels et fonctionnels des filamines" . Biochim. Biophys. Acta . 1538 (2-3): 99-117. doi : 10.1016/S0167-4889(01)00072-6 . PMID 11336782 .