Génétypes - Genetypes
Les types de gènes sont un concept taxonomique proposé en 2010 pour décrire toute séquence génétique à partir de spécimens types . Cette nomenclature intègre la systématique moléculaire et les termes utilisés en taxonomie biologique . Cette nomenclature est conçue pour marquer ou marquer les séquences génétiques qui ont été échantillonnées à partir de spécimens types. La nomenclature des types de gènes propose que les séquences génétiques d'un holotype soient appelées « hologènetype » (de « holotype » et « gènetype »), les séquences d'un topotype devraient être un « topogènetype », et ainsi de suite. De plus, le (s) marqueur (s) génétique (s) utilisé(s) devra(ont) être incorporé(s) dans la nomenclature (par exemple paragènetype ND2).
Le système de nomenclature des types de gènes pourrait être utilisé pour signaler les séquences « de référence » qui, en raison de leur lien direct avec les spécimens types, seront plus crédibles que les séquences standard dont l'identification des espèces peut être problématique. Les erreurs d'identification affligent de nombreuses séquences sur GenBank et le fait d'avoir certaines séquences liées à des spécimens types aidera à localiser et à gérer les erreurs d'identification et à créer des séquences "gold standard" identifiées positivement et disponibles pour la comparaison. Il est suggéré que cette nomenclature soit utilisée dans les publications et les bases de données qui affichent ou discutent des séquences de spécimens types.
Voici des exemples de types de gènes :
- Leptoderma macrophthalmum hologenetype mitogenome - AP011500
- Milyeringa brooksi paragénétype COI - HM590595
- Milyeringa brooksi paragénétype NDI - HM590607
Le concept de types de gènes a été remplacé par le concept GenSeq , proposé en 2013 en raison d'une certaine confusion parmi les chercheurs selon laquelle les types de gènes étaient équivalents aux types portant un nom .