Halomonadacées - Halomonadaceae
Halomonadacées | |
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GFAJ-1 cultivé sur phosphore. | |
Classement scientifique | |
Domaine: | Bactéries |
Phylum: | Protéobactéries |
Classer: | Gammaprotéobactéries |
Commander: | Océanospirillales |
Famille: | Halomonadacées |
Genres | |
Aidingimonas |
Les Halomonadaceae sont une famille de protéobactéries halophiles .
Histoire
La famille a été décrite à l'origine en 1988 pour contenir les genres Halomonas et Deleya .
En 1989, Chromobacterium marismortui a été reclassé en Chromohalobacter marismortui formant un troisième genre dans la famille des Halomonadaceae.
Par la suite, en 1990, une espèce a été découverte et a été initialement proposée pour s'appeler Volcaniella eurihalina formant un nouveau genre dans les Halomonadaceae , mais a ensuite été reclassée (en 1995) comme membre du genre Halomonas .
L'espèce Carnimonas nigrificans (seul membre du genre) n'a pas été placée dans la famille en raison de l'absence de deux des 15 séquences de signature d'ARNr 16S descriptives, mais il a été proposé de la reclasser dans la famille.
En 1996, la famille a ensuite été réorganisée en unifiant les genres Deleya , Halomonas et Halovibrio et l'espèce Paracoccus halodenitrificans en Halomonas et en plaçant Zymobacter dans cette famille. Cependant, il a été découvert plus tard que la souche de Halovibrio variabilis DSM 3051 et DSM 3050 différait et cette dernière a été transformée en souche type de Halovibrio , qui reste toujours en usage. et comprenant maintenant deux espèces (l'autre étant Halovibrio denitrificans)
En 2002, Halomonas marina a été transféré à son propre genre Cobetia , et en 2009 Halomonas marisflavi , Halomonas indalinina . et Halomonas avicenniae ont été transférés dans un nouveau genre appelé Kushneria (5 espèces)
Plusieurs genres singletons ont été créés récemment : en 2007, Halotalea alkalilenta a été décrit, Aidingimonas halophila en 2009, Halospina denitrificans en 2006, Modicisalibacter tunisiensis en 2009 Salinicola socius en 2009. A ce dernier genre deux espèces ont été transférées Halomonas salaria comme Salinicola salarius et Chromohalobacter salarius comme Salinicola halophilus .
La famille contient également la bactérie récemment découverte mais non cultivée « Candidatus Portiera aleyrodidarum » (endosymbiontes primaires des aleurodes ).
Genres
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Halomonas , le genre type
- Halomonas elongata , l'espèce type du genre, mais les plus anciens membres connus de la famille sont Halomonas halodentrificans (1952), Chromohalobacter marismortui (1940) et Chromohalobacter beijerinckii (à l'origine Pseudomonas beijerinckii ).
- Halomonas titanicae
- Aidingimonas halophila
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Cobétie
- Cobetia marina , à l' origine Pseudomonas marina , puis Dalya marina , puis Halomonas marina .
- Cobetia crustatorum , isolé à partir de fruits de mer coréens fermentés
- Carnimonas
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Chromohalobacter
- Chromohalobacter marismortui
- Chromohalobacter beijerinckii
- Chromohalobacter canadensis et Chromohalobacter israelensis , anciennement du genre Halomonas
- Chromohalobacter japonicus
- Chromohalobacter nigrandesensis
- Chromohalobacter salarius
- Chromohalobacter salexigens
- Chromohalobacter sarecensis , phychrotolérant
- Halotalea alcalilenta
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Kushneria
- Kushneria aurantia , espèce type
- Kushneria marisflavi , Kushneria indalinina et Kushneria avicenniae étaient auparavant classées sous Halomonas
- Modicisalibacter
- Portiera
- Zymobacter , à ne pas confondre avec Zymomonas mobilis , une alphaprotéobactérie étudiée pour sa production de biocarburant, une erreur facile que même le Code international de nomenclature des bactéries a commise comme indiqué dans
Remarque : les espèces de Deleya et Halovibrio sont désormais des Halomonas
Étymologie
Les noms dérivent de Halomonas, qui est le genre type de la famille, plus le suffixe -aceae, se terminant pour désigner une famille
Recherche
La géomicrobiologiste Felisa Wolfe-Simon, avec une équipe financée par la NASA, étudie une souche particulière de la famille des Halomonadaceae, nommée GFAJ-1 , isolée et cultivée à partir de sédiments collectés le long des rives du lac Mono , près du parc national de Yosemite, dans l'est de la Californie . Cette souche GFAJ-1 d'Halomonadaceae peut se développer en présence de fortes concentrations d' arsenic .
Voir également
Les références
Liens externes
- NASA - Astrobiology Magazine : "À la recherche d'une vie extraterrestre, sur Terre" — ( octobre 2009)
- NASA.gov : "Une recherche financée par la NASA découvre une vie construite avec des produits chimiques toxiques" - (décembre 2010)
- Science Express résumé de F. Wolfe-Simon, et al. : « Une bactérie qui peut se développer en utilisant de l'arsenic au lieu du phosphore. - (décembre 2010)