Halomonadacées - Halomonadaceae

Halomonadacées
GFAJ-1 (cultivé sur phosphore).jpg
GFAJ-1 cultivé sur phosphore.
Classement scientifique e
Domaine: Bactéries
Phylum: Protéobactéries
Classer: Gammaprotéobactéries
Commander: Océanospirillales
Famille: Halomonadacées
Genres

Aidingimonas
Carnimonas
Chromohalobacter
Cobetia
Deleya
Halomonas
Halotalea
Halovibrio
Kushneria
Modicisalibacter
Salicola
Salinicola
Volcaniella
Zymobacter

Les Halomonadaceae sont une famille de protéobactéries halophiles .

Histoire

La famille a été décrite à l'origine en 1988 pour contenir les genres Halomonas et Deleya .

En 1989, Chromobacterium marismortui a été reclassé en Chromohalobacter marismortui formant un troisième genre dans la famille des Halomonadaceae.

Par la suite, en 1990, une espèce a été découverte et a été initialement proposée pour s'appeler Volcaniella eurihalina formant un nouveau genre dans les Halomonadaceae , mais a ensuite été reclassée (en 1995) comme membre du genre Halomonas .

L'espèce Carnimonas nigrificans (seul membre du genre) n'a pas été placée dans la famille en raison de l'absence de deux des 15 séquences de signature d'ARNr 16S descriptives, mais il a été proposé de la reclasser dans la famille.

En 1996, la famille a ensuite été réorganisée en unifiant les genres Deleya , Halomonas et Halovibrio et l'espèce Paracoccus halodenitrificans en Halomonas et en plaçant Zymobacter dans cette famille. Cependant, il a été découvert plus tard que la souche de Halovibrio variabilis DSM 3051 et DSM 3050 différait et cette dernière a été transformée en souche type de Halovibrio , qui reste toujours en usage. et comprenant maintenant deux espèces (l'autre étant Halovibrio denitrificans)

En 2002, Halomonas marina a été transféré à son propre genre Cobetia , et en 2009 Halomonas marisflavi , Halomonas indalinina . et Halomonas avicenniae ont été transférés dans un nouveau genre appelé Kushneria (5 espèces)

Plusieurs genres singletons ont été créés récemment : en 2007, Halotalea alkalilenta a été décrit, Aidingimonas halophila en 2009, Halospina denitrificans en 2006, Modicisalibacter tunisiensis en 2009 Salinicola socius en 2009. A ce dernier genre deux espèces ont été transférées Halomonas salaria comme Salinicola salarius et Chromohalobacter salarius comme Salinicola halophilus .

La famille contient également la bactérie récemment découverte mais non cultivée « Candidatus Portiera aleyrodidarum » (endosymbiontes primaires des aleurodes ).

Genres

  • Halomonas , le genre type
    • Halomonas elongata , l'espèce type du genre, mais les plus anciens membres connus de la famille sont Halomonas halodentrificans (1952), Chromohalobacter marismortui (1940) et Chromohalobacter beijerinckii (à l'origine Pseudomonas beijerinckii ).
    • Halomonas titanicae
  • Aidingimonas halophila
  • Cobétie
    • Cobetia marina , à l' origine Pseudomonas marina , puis Dalya marina , puis Halomonas marina .
    • Cobetia crustatorum , isolé à partir de fruits de mer coréens fermentés
  • Carnimonas
  • Chromohalobacter
    • Chromohalobacter marismortui
    • Chromohalobacter beijerinckii
    • Chromohalobacter canadensis et Chromohalobacter israelensis , anciennement du genre Halomonas
    • Chromohalobacter japonicus
    • Chromohalobacter nigrandesensis
    • Chromohalobacter salarius
    • Chromohalobacter salexigens
    • Chromohalobacter sarecensis , phychrotolérant
  • Halotalea alcalilenta
  • Kushneria
    • Kushneria aurantia , espèce type
    • Kushneria marisflavi , Kushneria indalinina et Kushneria avicenniae étaient auparavant classées sous Halomonas
  • Modicisalibacter
  • Portiera
  • Zymobacter , à ne pas confondre avec Zymomonas mobilis , une alphaprotéobactérie étudiée pour sa production de biocarburant, une erreur facile que même le Code international de nomenclature des bactéries a commise comme indiqué dans

Remarque : les espèces de Deleya et Halovibrio sont désormais des Halomonas

Étymologie

Les noms dérivent de Halomonas, qui est le genre type de la famille, plus le suffixe -aceae, se terminant pour désigner une famille

Recherche

La géomicrobiologiste Felisa Wolfe-Simon, avec une équipe financée par la NASA, étudie une souche particulière de la famille des Halomonadaceae, nommée GFAJ-1 , isolée et cultivée à partir de sédiments collectés le long des rives du lac Mono , près du parc national de Yosemite, dans l'est de la Californie . Cette souche GFAJ-1 d'Halomonadaceae peut se développer en présence de fortes concentrations d' arsenic .

Voir également

Les références

Liens externes