Grippe - Influenza

Grippe
Autres noms Grippe, la grippe, Grippe
EM du virus de la grippe.jpg
Virus de la grippe, grossi environ 100 000 fois
Spécialité Maladie infectieuse
Symptômes Fièvre , écoulement nasal , mal de gorge , douleurs musculaires , maux de tête , toux , fatigue
Début habituel 1 à 4 jours après l'exposition
Durée 2 à 8 jours
Causes Virus de la grippe
La prévention Lavage des mains , vaccins contre la grippe
Des médicaments Médicaments antiviraux tels que l' oseltamivir
La fréquence 3 à 5 millions de cas graves par an
Des morts >290 000 à 650 000 décès par an

La grippe , communément appelée « la grippe », est une maladie infectieuse causée par des virus grippaux. Les symptômes vont de légers à graves et comprennent souvent de la fièvre, un écoulement nasal, des maux de gorge, des douleurs musculaires, des maux de tête, de la toux et de la fatigue. Ces symptômes commencent généralement 1 à 2 jours et moins généralement 3 à 4 jours après l'exposition au virus et durent environ 2 à 8 jours. Des diarrhées et des vomissements peuvent survenir, en particulier chez les enfants. La grippe peut évoluer vers une pneumonie , qui peut être causée par le virus ou par une infection bactérienne ultérieure. Les autres complications de l' infection incluent le syndrome de détresse respiratoire aiguë , la méningite , l' encéphalite et l' aggravation de problèmes de santé préexistants tels que l' asthme et les maladies cardiovasculaires .

Il existe quatre types de virus de la grippe, appelés virus de la grippe A, B, C et D. Les oiseaux aquatiques sont la principale source du virus de la grippe A (IAV), qui est également répandu chez divers mammifères, y compris les humains et les porcs. Le virus de la grippe B (IBV) et le virus de la grippe C (ICV) infectent principalement les humains, et le virus de la grippe D (IDV) se trouve chez les bovins et les porcs. L'IAV et l'IBV circulent chez l'homme et provoquent des épidémies saisonnières, et l'ICV provoque une infection bénigne, principalement chez les enfants. L'IDV peut infecter l'homme mais n'est pas connu pour provoquer une maladie. Chez l'homme, les virus de la grippe sont principalement transmis par les gouttelettes respiratoires produites par la toux et les éternuements. La transmission par les aérosols et les objets intermédiaires et les surfaces contaminées par le virus se produit également.

Le lavage fréquent des mains et le fait de se couvrir la bouche et le nez en toussant et en éternuant réduisent la transmission. La vaccination annuelle peut aider à fournir une protection contre la grippe. Les virus de la grippe, en particulier l'IAV, évoluent rapidement, de sorte que les vaccins contre la grippe sont régulièrement mis à jour pour correspondre aux souches grippales en circulation. Les vaccins actuellement utilisés offrent une protection contre les sous-types d'IAV H1N1 et H3N2 et un ou deux sous-types d'IBV. L'infection grippale est diagnostiquée à l'aide de méthodes de laboratoire telles que des tests d' anticorps ou d' antigène et une réaction en chaîne par polymérase ( PCR ) pour identifier l'acide nucléique viral. La maladie peut être traitée avec des mesures de soutien et, dans les cas graves, avec des médicaments antiviraux tels que l' oseltamivir . Chez les personnes en bonne santé, la grippe est généralement spontanément résolutive et rarement mortelle, mais elle peut être mortelle dans les groupes à haut risque.

Au cours d'une année typique, 5 à 15 % de la population contracte la grippe. Il y a 3 à 5 millions de cas graves chaque année, avec jusqu'à 650 000 décès liés aux voies respiratoires dans le monde chaque année. Les décès surviennent le plus souvent dans les groupes à haut risque, notamment les jeunes enfants, les personnes âgées et les personnes souffrant de problèmes de santé chroniques. Dans les régions tempérées du monde, le nombre de cas de grippe culmine pendant l'hiver, alors que dans les tropiques, la grippe peut survenir toute l'année. Depuis la fin des années 1800, de grandes épidémies de nouvelles souches de grippe qui se propagent à l'échelle mondiale, appelées pandémies, se sont produites tous les 10 à 50 ans. Cinq pandémies de grippe se sont produites depuis 1900 : la grippe espagnole en 1918-1920, qui était la pandémie de grippe la plus grave, la grippe asiatique en 1957, la grippe de Hong Kong en 1968, la grippe russe en 1977 et la pandémie de grippe porcine en 2009. .

Signes et symptômes

Symptômes de la grippe, avec fièvre et toux les symptômes les plus courants

Le délai entre l'exposition au virus et le développement des symptômes, appelé période d'incubation , est de 1 à 4 jours, le plus souvent de 1 à 2 jours. Cependant, de nombreuses infections sont asymptomatiques. L'apparition des symptômes est soudaine et les symptômes initiaux sont principalement non spécifiques, notamment fièvre, frissons, maux de tête, douleurs ou courbatures musculaires , sensation d'inconfort , perte d'appétit , manque d'énergie/fatigue et confusion. Ces symptômes sont généralement accompagnés de symptômes respiratoires tels qu'une toux sèche, un mal de gorge ou une sécheresse de la gorge, une voix rauque et un nez bouché ou qui coule. La toux est le symptôme le plus courant. Des symptômes gastro-intestinaux peuvent également survenir, notamment des nausées, des vomissements, de la diarrhée et une gastro-entérite, en particulier chez les enfants. Les symptômes standard de la grippe durent généralement de 2 à 8 jours. Une étude de 2021 suggère que la grippe peut provoquer des symptômes durables de la même manière que le long COVID .

Les infections symptomatiques sont généralement bénignes et limitées aux voies respiratoires supérieures, mais la progression vers la pneumonie est relativement fréquente. La pneumonie peut être causée par l'infection virale primaire ou par une infection bactérienne secondaire. La pneumonie primaire est caractérisée par une progression rapide de la fièvre, de la toux, une respiration laborieuse et de faibles niveaux d'oxygène qui provoquent une peau bleutée. Elle est particulièrement fréquente chez les personnes atteintes d'une maladie cardiovasculaire sous-jacente telle qu'une maladie cardiaque rhumatismale. La pneumonie secondaire a généralement une période d'amélioration des symptômes pendant 1 à 3 semaines, suivie d'une fièvre récurrente, d'une production d'expectorations et d'une accumulation de liquide dans les poumons, mais peut également survenir quelques jours seulement après l'apparition des symptômes de la grippe. Environ un tiers des cas de pneumonie primaire sont suivis d'une pneumonie secondaire, qui est le plus souvent causée par les bactéries Streptococcus pneumoniae et Staphylococcus aureus .

Virologie

Types de virus

Nomenclature du virus de la grippe (pour un virus de la grippe du Fujian )

Les virus de la grippe comprennent quatre espèces. Chacune des quatre espèces est le seul membre de son propre genre, et les quatre genres grippaux comprennent quatre des sept genres de la famille Orthomyxoviridae . Elles sont:

L'IAV est responsable de la plupart des cas de maladie grave ainsi que d'épidémies saisonnières et de pandémies occasionnelles. Il infecte les personnes de tous âges, mais a tendance à causer de manière disproportionnée des maladies graves chez les personnes âgées, les très jeunes et celles qui ont des problèmes de santé chroniques. Les oiseaux sont le principal réservoir d'IAV, en particulier les oiseaux aquatiques tels que les canards, les oies, les oiseaux de rivage et les goélands, mais le virus circule également parmi les mammifères, notamment les porcs, les chevaux et les mammifères marins. L'IAV est classé en sous-types basés sur les protéines virales hémagglutinine (H) et neuraminidase (N). En 2019, 18 sous-types H et 11 sous-types N ont été identifiés. La plupart des combinaisons potentielles ont été signalées chez les oiseaux, mais H17-18 et N10-11 n'ont été trouvées que chez les chauves-souris. Seuls les sous-types H H1-3 et les sous-types N N1-2 sont connus pour avoir circulé chez l'homme, les sous-types actuels d'IAV en circulation étant H1N1 et H3N2. Les IAV peuvent être classés plus spécifiquement pour inclure également les espèces hôtes naturelles, l'origine géographique, l'année d'isolement et le numéro de la souche, comme H1N1/A/duck/Alberta/35/76.

L'IBV infecte principalement les humains, mais a été identifié chez les phoques, les chevaux, les chiens et les porcs. IBV n'a pas de sous-types comme IAV mais a deux lignées antigéniquement distinctes, appelées lignées de type B/Victoria/2/1987 et B/Yamagata/16/1988, ou simplement (B/)Victoria(-like) et ( B/)Yamagata(-semblable). Les deux lignées sont en circulation chez l'homme, affectant de manière disproportionnée les enfants. Les IBV contribuent aux épidémies saisonnières aux côtés des IAV mais n'ont jamais été associés à une pandémie.

L'ICV, comme l'IBV, se trouve principalement chez l'homme, bien qu'il ait également été détecté chez les porcs, les chiens sauvages, les dromadaires , les bovins et les chiens. L'infection par l'ICV affecte principalement les enfants et est généralement asymptomatique ou présente de légers symptômes semblables à ceux du rhume, bien que des symptômes plus graves tels que la gastro-entérite et la pneumonie puissent survenir. Contrairement à l'IAV et à l'IBV, l'ICV n'a pas été un axe majeur de recherche concernant les médicaments antiviraux, les vaccins et d'autres mesures contre la grippe. ICV est sous-classé en six lignées génétiques/antigéniques.

L'IDV a été isolé chez les porcs et les bovins, ce dernier étant le réservoir naturel. L'infection a également été observée chez les humains, les chevaux, les dromadaires et les petits ruminants tels que les chèvres et les moutons. L'IDV est éloigné de l'ICV. Bien que les travailleurs du bétail aient parfois été testés positifs à une infection antérieure à l'IDV, il n'est pas connu qu'il provoque une maladie chez l'homme. L'ICV et l'IDV connaissent un taux d'évolution antigénique plus lent que l'IAV et l'IBV. En raison de cette stabilité antigénique, relativement peu de nouvelles lignées émergent.

Génome et structure

Structure du virion de la grippe . Les protéines hémagglutinine (HA) et neuraminidase (NA) sont représentées à la surface de la particule. Les ARN viraux qui composent le génome sont représentés par des spirales rouges à l'intérieur de la particule et liés aux ribonucléoprotéines (RNP).

Les virus grippaux ont un sens négatif du génome d'ARN simple brin qui est segmenté. Le sens négatif du génome signifie qu'il peut être utilisé comme matrice pour synthétiser l'ARN messager (ARNm). IAV et IBV ont huit segments génomiques qui codent pour 10 protéines principales. ICV et IDV ont sept segments génomiques qui codent pour neuf protéines principales. Trois segments codent pour trois sous-unités d'un complexe ARN polymérase ARN-dépendante (RdRp) : PB1, une transcriptase, PB2, qui reconnaît les coiffes 5', et PA (P3 pour ICV et IDV), une endonucléase. La protéine matricielle (M1) et la protéine membranaire (M2) partagent un segment, tout comme la protéine non structurelle (NS1) et la protéine d'exportation nucléaire (NEP). Pour IAV et IBV, l'hémagglutinine (HA) et la neuraminidase (NA) sont codées sur un segment chacune, tandis que ICV et IDV codent pour une protéine de fusion hémagglutinine-estérase (HEF) sur un segment qui fusionne les fonctions de HA et NA. Le segment final du génome code pour la nucléoprotéine virale (NP). Les virus de la grippe codent également pour diverses protéines accessoires, telles que PB1-F2 et PA-X, qui sont exprimées par des cadres de lecture ouverts alternatifs et qui sont importantes dans la suppression de la défense de l'hôte, la virulence et la pathogénicité.

La particule virale, appelée virion, est pléomorphe et varie entre une forme filamenteuse, bacilliforme ou sphérique. Les isolats cliniques ont tendance à être pléomorphes, tandis que les souches adaptées à la croissance en laboratoire produisent généralement des virions sphériques. Les virions filamenteux mesurent environ 250 nanomètres (nm) sur 80 nm, les bacilliformes 120-250 sur 95 nm et sphériques de 120 nm de diamètre. Le virion est constitué de chaque segment du génome lié aux nucléoprotéines dans des complexes ribonucléoprotéiques (RNP) séparés pour chaque segment, tous entourés d'une membrane lipidique bicouche appelée enveloppe virale . Il existe une copie du RdRp, toutes sous-unités incluses, liée à chaque RNP. L'enveloppe est renforcée structurellement par des protéines matricielles à l'intérieur qui enferment les RNP, et l'enveloppe contient des protéines HA et NA (ou HEF) s'étendant vers l'extérieur depuis la surface extérieure de l'enveloppe. Les protéines HA et HEF ont une structure distincte de "tête" et de "tige". Les protéines M2 forment des canaux ioniques protons à travers l'enveloppe virale qui sont nécessaires à l'entrée et à la sortie virale. Les IBV contiennent une protéine de surface nommée NB qui est ancrée dans l'enveloppe, mais sa fonction est inconnue.

Cycle de la vie

Invasion et réplication des cellules hôtes par le virus de la grippe

Le cycle de vie viral commence par la liaison à une cellule cible. La liaison est médiée par les protéines virales HA à la surface de l'enveloppe, qui se lient aux cellules contenant des récepteurs d'acide sialique à la surface de la membrane cellulaire. Pour les sous-types N1 avec la mutation "G147R" et les sous-types N2, la protéine NA peut initier l'entrée. Avant la liaison, les protéines NA favorisent l'accès aux cellules cibles en dégradant le mucus, ce qui aide à éliminer les récepteurs leurres extracellulaires qui entraveraient l'accès aux cellules cibles. Après liaison, le virus est internalisé dans la cellule par un endosome qui contient le virion à l'intérieur. L'endosome est acidifié par la vATPase cellulaire pour avoir un pH plus bas, ce qui déclenche un changement de conformation de l'HA qui permet la fusion de l'enveloppe virale avec la membrane endosomale. Dans le même temps, les ions hydrogène diffusent dans le virion via les canaux ioniques M2, perturbant les interactions protéine-protéine internes pour libérer les RNP dans le cytosol de la cellule hôte . L'enveloppe de la protéine M1 entourant les RNP est dégradée, décapant complètement les RNP dans le cytosol.

Les RNP sont ensuite importés dans le noyau à l'aide de signaux de localisation virale. Là, l'ARN polymérase virale transcrit l' ARNm en utilisant le brin de sens négatif génomique comme matrice. La polymérase arrache les coiffes 5' de l'ARNm viral de l'ARN cellulaire pour amorcer la synthèse de l'ARNm et l'extrémité 3' de l'ARNm est polyadénylée à la fin de la transcription. Une fois l'ARNm viral transcrit, il est exporté hors du noyau et traduit par les ribosomes de l'hôte d'une manière dépendante de la coiffe pour synthétiser les protéines virales. RdRp synthétise également des brins de sens positif complémentaires du génome viral dans un complexe RNP complémentaire qui sont ensuite utilisés comme matrices par les polymérases virales pour synthétiser des copies du génome de sens négatif. Au cours de ces processus, les RdRps des virus de la grippe aviaire (AIV) fonctionnent de manière optimale à une température plus élevée que les virus de la grippe des mammifères.

Les sous-unités de polymérase virale et les protéines NP nouvellement synthétisées sont importées dans le noyau pour augmenter encore le taux de réplication virale et former des RNP. Les protéines HA, NA et M2 sont acheminées à l'aide des protéines M1 et NEP vers la membrane cellulaire via l'appareil de Golgi et insérées dans la membrane cellulaire. Les protéines virales non structurelles, notamment NS1, PB1-F2 et PA-X, régulent les processus cellulaires de l'hôte pour désactiver les réponses antivirales. PB1-F2 interagit également avec PB1 pour maintenir plus longtemps les polymérases dans le noyau. Les protéines M1 et NEP se localisent dans le noyau au cours des derniers stades de l'infection, se lient aux RNP viraux et assurent leur exportation vers le cytoplasme où elles migrent vers la membrane cellulaire à l'aide d'endosomes recyclés et sont regroupées dans les segments du génome.

Les virus progéniques quittent la cellule par bourgeonnement à partir de la membrane cellulaire, ce qui est initié par l'accumulation de protéines M1 du côté cytoplasmique de la membrane. Le génome viral est incorporé à l'intérieur d'une enveloppe virale dérivée de portions de la membrane cellulaire qui contiennent les protéines HA, NA et M2. A la fin du bourgeonnement, les protéines HA restent attachées à l'acide sialique cellulaire jusqu'à ce qu'elles soient clivées par l'activité sialidase des protéines NA. Le virion est alors libéré de la cellule. L'activité sialidase de NA clive également tous les résidus d'acide sialique de la surface virale, ce qui aide à empêcher les virus nouvellement assemblés de s'agréger près de la surface cellulaire et d'améliorer l'infectivité. Semblable à d'autres aspects de la réplication de la grippe, l'activité NA optimale dépend de la température et du pH. Au final, la présence de grandes quantités d'ARN viral dans la cellule déclenche l'apoptose, c'est-à-dire la mort cellulaire programmée, qui est initiée par des facteurs cellulaires pour restreindre la réplication virale.

Dérive et décalage antigéniques

Le changement antigénique, ou le réassortiment, peut donner lieu à de nouvelles souches hautement pathogènes de la grippe humaine.

Deux processus clés par lesquels évoluent les virus de la grippe sont la dérive antigénique et le déplacement antigénique . La dérive antigénique se produit lorsque les antigènes d'un virus de la grippe changent en raison de l'accumulation progressive de mutations dans le gène de l'antigène (HA ou NA). Cela peut se produire en réponse à la pression évolutive exercée par la réponse immunitaire de l'hôte. La dérive antigénique est particulièrement courante pour la protéine HA, dans laquelle quelques changements d'acides aminés dans la région de la tête peuvent constituer une dérive antigénique. Le résultat est la production de nouvelles souches qui peuvent échapper à l'immunité préexistante à médiation par les anticorps. La dérive antigénique se produit chez toutes les espèces grippales, mais est plus lente chez B que A et plus lente chez C et D. La dérive antigénique est une cause majeure de grippe saisonnière et nécessite une mise à jour annuelle des vaccins antigrippaux. L'HA est le principal composant des vaccins inactivés, de sorte que la surveillance surveille la dérive antigénique de cet antigène parmi les souches circulantes. L'évolution antigénique des virus grippaux humains semble être plus rapide que celle des virus grippaux chez le porc et les équidés. Chez les oiseaux sauvages, la variation antigénique intra-sous-type semble limitée mais a été observée chez la volaille.

Le changement antigénique est un changement soudain et drastique de l'antigène d'un virus de la grippe, généralement HA. Au cours du déplacement antigénique, des souches antigéniquement différentes qui infectent la même cellule peuvent réassortir les segments du génome les uns avec les autres, produisant une descendance hybride. Étant donné que tous les virus de la grippe ont des génomes segmentés, tous sont capables de se réassortir. Le changement antigénique, cependant, ne se produit que parmi les virus de la grippe du même genre et se produit le plus souvent parmi les IAV. En particulier, le réassortiment est très courant dans les AIV, créant une grande diversité de virus grippaux chez les oiseaux, mais est rare dans les lignées humaines, équines et canines. Les porcs, les chauves-souris et les cailles ont des récepteurs pour les IAV mammifères et aviaires, ce sont donc des « vaisseaux de mélange » potentiels pour le réassortiment. Si une souche animale se réassort avec une souche humaine, une nouvelle souche peut alors émerger, capable de se transmettre d'humain à humain. Cela a provoqué des pandémies, mais seul un nombre limité s'est produit, il est donc difficile de prédire quand la prochaine se produira.

Mécanisme

Transmission

Les personnes infectées peuvent transmettre les virus de la grippe par la respiration, la parole, la toux et les éternuements, qui répandent des gouttelettes respiratoires et des aérosols contenant des particules virales dans l'air. Une personne sensible à l'infection peut alors contracter la grippe en entrant en contact avec ces particules. Les gouttelettes respiratoires sont relativement grosses et parcourent moins de deux mètres avant de tomber sur les surfaces avoisinantes. Les aérosols sont plus petits et restent en suspension dans l'air plus longtemps, ils mettent donc plus de temps à se déposer et peuvent voyager plus loin que les gouttelettes respiratoires. L'inhalation d'aérosols peut entraîner une infection, mais la transmission se fait principalement dans la zone d'environ deux mètres autour d'une personne infectée via des gouttelettes respiratoires qui entrent en contact avec la muqueuse des voies respiratoires supérieures. La transmission par contact avec une personne, des fluides corporels ou des objets intermédiaires ( fomites ) peut également se produire, par exemple par des mains et des surfaces contaminées, car les virus de la grippe peuvent survivre pendant des heures sur des surfaces non poreuses. Si les mains sont contaminées, toucher son visage peut provoquer une infection.

La grippe est généralement transmissible d'un jour avant l'apparition des symptômes jusqu'à 5 à 7 jours après. Chez les adultes en bonne santé, le virus est excrété pendant 3 à 5 jours. Chez les enfants et les immunodéprimés, le virus peut être transmissible pendant plusieurs semaines. Les enfants âgés de 2 à 17 ans sont considérés comme les principaux et les plus efficaces vecteurs de propagation de la grippe. Les enfants qui n'ont pas eu d'expositions antérieures multiples aux virus de la grippe excrètent le virus en plus grande quantité et pendant une durée plus longue que les autres enfants. Les personnes à risque d'exposition à la grippe comprennent les travailleurs de la santé, les travailleurs sociaux et ceux qui vivent avec ou prennent soin de personnes vulnérables à la grippe. Dans les établissements de soins de longue durée, la grippe peut se propager rapidement après son introduction. Une variété de facteurs encouragent probablement la transmission de la grippe, notamment une température plus basse, une humidité absolue et relative plus faible , moins de rayonnement ultraviolet du soleil et le surpeuplement. Les virus de la grippe qui infectent les voies respiratoires supérieures comme le H1N1 ont tendance à être plus bénins mais plus transmissibles, tandis que ceux qui infectent les voies respiratoires inférieures comme le H5N1 ont tendance à provoquer une maladie plus grave mais sont moins contagieux.

Physiopathologie

Comment les différents sites d'infection (indiqués en rouge) du H1N1 et du H5N1 influencent leur transmission et leur létalité

Chez l'homme, les virus de la grippe provoquent d'abord une infection en infectant les cellules épithéliales des voies respiratoires. La maladie au cours de l'infection est principalement le résultat d'une inflammation pulmonaire et d'une atteinte causée par l'infection et la mort des cellules épithéliales, combinées à une inflammation causée par la réponse du système immunitaire à l'infection. Les organes non respiratoires peuvent être impliqués, mais les mécanismes par lesquels la grippe est impliquée dans ces cas sont inconnus. Les maladies respiratoires graves peuvent être causées par de multiples mécanismes non exclusifs, notamment l'obstruction des voies respiratoires, la perte de la structure alvéolaire , la perte de l'intégrité épithéliale pulmonaire due à l'infection et à la mort des cellules épithéliales, et la dégradation de la matrice extracellulaire qui maintient la structure pulmonaire. En particulier, l'infection des cellules alvéolaires semble entraîner des symptômes graves car cela entraîne une altération des échanges gazeux et permet aux virus d'infecter les cellules endothéliales, qui produisent de grandes quantités de cytokines pro-inflammatoires .

La pneumonie causée par les virus de la grippe est caractérisée par des niveaux élevés de réplication virale dans les voies respiratoires inférieures, accompagnées d'une forte réponse pro-inflammatoire appelée tempête de cytokines . L'infection par H5N1 ou H7N9 produit en particulier des niveaux élevés de cytokines pro-inflammatoires. Dans les infections bactériennes, l'épuisement précoce des macrophages pendant la grippe crée un environnement favorable dans les poumons pour la croissance bactérienne puisque ces globules blancs sont importants pour répondre à l'infection bactérienne. Les mécanismes de l'hôte pour encourager la réparation des tissus peuvent permettre par inadvertance une infection bactérienne. L'infection induit également la production de glucocorticoïdes systémiques qui peuvent réduire l'inflammation pour préserver l'intégrité des tissus mais permettre une croissance bactérienne accrue.

La physiopathologie de la grippe est fortement influencée par les récepteurs auxquels les virus grippaux se lient lors de leur entrée dans les cellules. Les virus de la grippe de mammifères se lient préférentiellement aux acides sialiques reliés au reste de l'oligosaccharide par une liaison α-2,6, le plus souvent trouvée dans diverses cellules respiratoires, telles que les cellules épithéliales respiratoires et rétiniennes. Les AIV préfèrent les acides sialiques avec une liaison α-2,3, qui sont les plus courants chez les oiseaux dans les cellules épithéliales gastro-intestinales et chez les humains dans les voies respiratoires inférieures. De plus, le clivage de la protéine HA en HA 1 , la sous-unité de liaison, et HA 2 , la sous-unité de fusion, est réalisé par différentes protéases, affectant quelles cellules peuvent être infectées. Pour les virus de la grippe de mammifères et les AIV faiblement pathogènes, le clivage est extracellulaire, ce qui limite l'infection aux cellules qui possèdent les protéases appropriées, alors que pour les AIV hautement pathogènes, le clivage est intracellulaire et réalisé par des protéases ubiquistes, ce qui permet l'infection d'une plus grande variété de cellules, contribuant ainsi à une maladie plus grave.

Immunologie

Les cellules possèdent des capteurs pour détecter l'ARN viral, qui peut alors induire la production d' interféron . Les interférons médient l'expression de protéines antivirales et de protéines qui recrutent des cellules immunitaires sur le site d'infection, et ils informent également les cellules non infectées voisines de l'infection. Certaines cellules infectées libèrent des cytokines pro-inflammatoires qui recrutent des cellules immunitaires sur le site de l'infection. Les cellules immunitaires contrôlent l'infection virale en tuant les cellules infectées et en phagocytant les particules virales et les cellules apoptotiques. Cependant, une réponse immunitaire exacerbée peut nuire à l'organisme hôte par le biais d'une tempête de cytokines. Pour contrer la réponse immunitaire, les virus de la grippe codent pour diverses protéines non structurelles, notamment NS1, NEP, PB1-F2 et PA-X, qui sont impliquées dans la réduction de la réponse immunitaire de l'hôte en supprimant la production d'interféron et l'expression des gènes de l'hôte.

Les lymphocytes B , un type de globule blanc, produisent des anticorps qui se lient aux antigènes grippaux HA et NA (ou HEF) et à d'autres protéines dans une moindre mesure. Une fois liés à ces protéines, les anticorps empêchent les virions de se lier aux récepteurs cellulaires, neutralisant ainsi le virus. La réponse des anticorps à la grippe chez l'homme est généralement robuste et durable, en particulier pour l'ICV et l'IDV, car HEF est antigéniquement stable. En d'autres termes, les personnes exposées à une certaine souche dans l'enfance possèdent encore des anticorps contre cette souche à un niveau raisonnable plus tard dans la vie, ce qui peut fournir une certaine protection aux souches apparentées. Il existe cependant un « péché antigénique originel », dans lequel le premier sous-type d'HA auquel une personne est exposée influence la réponse immunitaire basée sur les anticorps aux futures infections et vaccins.

La prévention

Vaccination

Faire un vaccin contre la grippe

La vaccination annuelle est le moyen principal et le plus efficace de prévenir la grippe et les complications associées à la grippe, en particulier pour les groupes à haut risque. Les vaccins contre la grippe sont trivalents ou quadrivalents, offrant une protection contre une souche H1N1, une souche H3N2 et une ou deux souches IBV correspondant aux deux lignées IBV. Deux types de vaccins sont utilisés : les vaccins inactivés qui contiennent des virus « tués » (c'est-à-dire inactivés) et les vaccins antigrippaux vivants atténués (VVAI) qui contiennent des virus affaiblis. Il existe trois types de vaccins inactivés : le virus entier, le virus fragmenté, dans lequel le virus est perturbé par un détergent, et la sous-unité, qui ne contient que les antigènes viraux HA et NA. La plupart des vaccins contre la grippe sont inactivés et administrés par injection intramusculaire. Les VVAI sont pulvérisés dans la cavité nasale.

Les recommandations de vaccination varient selon les pays. Certains recommandent la vaccination pour toutes les personnes au-dessus d'un certain âge, par exemple 6 mois, tandis que d'autres pays recommandent de se limiter aux groupes à haut risque, tels que les femmes enceintes, les jeunes enfants (à l'exclusion des nouveau-nés), les personnes âgées, les personnes souffrant de maladies chroniques, la santé les soignants, les personnes qui entrent en contact avec des personnes à haut risque et les personnes qui transmettent facilement le virus. Les jeunes nourrissons ne peuvent pas recevoir de vaccins contre la grippe pour des raisons de sécurité, mais ils peuvent hériter d' une immunité passive de leur mère si des vaccins inactivés sont administrés à la mère pendant la grossesse. La vaccination contre la grippe contribue également à réduire la probabilité de réassortiment.

L'efficacité des vaccins contre la grippe saisonnière varie considérablement, avec une efficacité moyenne estimée de 50 à 60 %, selon la souche vaccinale, l'âge, l'immunité antérieure et la fonction immunitaire, de sorte que les personnes vaccinées peuvent toujours contracter la grippe. L'efficacité des vaccins contre la grippe est considérée comme sous-optimale, en particulier chez les personnes âgées, mais la vaccination est toujours bénéfique pour réduire le taux de mortalité et le taux d'hospitalisation dus à la grippe ainsi que la durée d'hospitalisation. Il a été démontré que la vaccination des enfants d'âge scolaire offre une protection indirecte aux autres groupes d'âge. Les VVAI sont recommandés pour les enfants en raison de leur efficacité supérieure, en particulier pour les enfants de moins de 6 ans, et d'une plus grande immunité contre les souches non vaccinales par rapport aux vaccins inactivés.

Les effets secondaires courants de la vaccination comprennent des réactions locales au site d'injection et des symptômes semblables à ceux du rhume . La fièvre, les malaises et les myalgies sont moins fréquents. Les vaccins contre la grippe sont contre-indiqués pour les personnes qui ont eu une réaction allergique grave en réponse à un vaccin contre la grippe ou à l'un des composants du vaccin. Les VVAI ne sont pas administrés aux enfants ou adolescents présentant une immunodéficience sévère ou à ceux qui utilisent des traitements au salicylate en raison du risque de développer le syndrome de Reye . Les VVAI ne sont pas non plus recommandés pour les enfants de moins de 2 ans, les femmes enceintes et les adultes immunodéprimés. Les vaccins antigrippaux inactivés ne peuvent pas provoquer la grippe et sont considérés comme sûrs pendant la grossesse.

En général, les vaccins antigrippaux ne sont efficaces que s'il existe une correspondance antigénique entre les souches vaccinales et les souches circulantes. De plus, la plupart des vaccins antigrippaux disponibles dans le commerce sont fabriqués par propagation des virus de la grippe dans des œufs de poule embryonnés, ce qui prend 6 à 8 mois. Les saisons de grippe sont différentes dans l'hémisphère nord et sud, donc l'OMS se réunit deux fois par an, une pour chaque hémisphère, pour discuter des souches qui devraient être incluses dans les vaccins antigrippaux sur la base de l'observation des tests d'inhibition de l'HA. D'autres procédés de fabrication comprennent un vaccin inactivé à base de culture cellulaire MDCK et un vaccin sous-unitaire recombinant fabriqué à partir d'une surexpression de baculovirus dans des cellules d'insectes.

Chimioprophylaxie antivirale

La grippe peut être prévenue ou réduite en sévérité par une prophylaxie post-exposition avec les médicaments antiviraux oseltamivir, qui peuvent être pris par voie orale par les personnes d'au moins trois mois, et le zanamivir, qui peut être inhalé par les personnes de plus de sept ans. La chimioprophylaxie est particulièrement utile pour les personnes à haut risque de développer des complications et celles qui ne peuvent pas recevoir le vaccin contre la grippe en raison de contre-indications ou d'un manque d'efficacité. La chimioprophylaxie post-exposition n'est recommandée que si l'oseltamivir est pris dans les 48 heures suivant le contact avec un cas de grippe confirmé ou suspecté et le zanamivir dans les 36 heures. Il est recommandé de l'offrir aux personnes qui n'ont pas encore reçu de vaccin pour la saison grippale en cours, qui ont été vaccinées moins de deux semaines depuis le contact, s'il y a un décalage important entre le vaccin et les souches en circulation, ou lors d'une éclosion en un milieu fermé, quels que soient les antécédents de vaccination.

Contrôle d'infection

L'hygiène des mains est importante pour réduire la propagation de la grippe. Cela comprend des mesures telles que le lavage fréquent des mains à l'eau et au savon, l'utilisation de désinfectants pour les mains à base d' alcool et le fait de ne pas se toucher les yeux, le nez et la bouche avec les mains. Il est important de se couvrir le nez et la bouche en toussant ou en éternuant. D'autres méthodes pour limiter la transmission de la grippe consistent à rester à la maison en cas de maladie, à éviter tout contact avec les autres jusqu'au lendemain de la fin des symptômes et à désinfecter les surfaces susceptibles d'être contaminées par le virus, telles que les poignées de porte. L'éducation à la santé à travers les médias et les affiches est souvent utilisée pour rappeler aux gens l'étiquette et l'hygiène susmentionnées.

Il existe une incertitude quant à l'utilisation de masques, car les recherches n'ont jusqu'à présent pas montré de réduction significative de la grippe saisonnière avec l'utilisation de masques. De même, l'efficacité du dépistage aux points d'entrée dans les pays n'est pas bien étudiée. Les mesures de distanciation sociale telles que la fermeture des écoles, l'évitement des contacts avec les personnes infectées via l'isolement ou la quarantaine et la limitation des rassemblements de masse peuvent réduire la transmission, mais ces mesures sont souvent coûteuses, impopulaires et difficiles à mettre en œuvre. Par conséquent, les méthodes couramment recommandées de contrôle des infections sont l'étiquette respiratoire, l'hygiène des mains et le port du masque, qui sont peu coûteux et faciles à mettre en œuvre. Les mesures pharmaceutiques sont efficaces mais peuvent ne pas être disponibles dans les premiers stades d'une épidémie.

Dans les établissements de soins de santé, les personnes infectées peuvent être groupées ou affectées à des chambres individuelles. Des vêtements de protection tels que des masques, des gants et des blouses sont recommandés en cas de contact avec des personnes infectées s'il existe un risque d'exposition à des fluides corporels infectés. Garder les patients dans des chambres à pression négative et éviter les activités produisant des aérosols peut aider, mais des systèmes spéciaux de traitement de l'air et de ventilation ne sont pas considérés comme nécessaires pour empêcher la propagation de la grippe dans l'air. Dans les foyers résidentiels, il peut être nécessaire de fermer les nouvelles admissions jusqu'à ce que la propagation de la grippe soit maîtrisée. Lors du renvoi des patients vers des maisons de soins, il est important de faire attention s'il y a une épidémie de grippe connue.

Étant donné que les virus de la grippe circulent chez les animaux tels que les oiseaux et les porcs, la prévention de la transmission par ces animaux est importante. Le traitement de l'eau , l'élevage d'animaux en intérieur, la mise en quarantaine des animaux malades, la vaccination et la biosécurité sont les principales mesures utilisées. Placer des poulaillers et des porcheries sur des hauteurs, loin des fermes à haute densité, des fermes d'arrière-cour, des marchés de volailles vivantes et des plans d'eau aide à minimiser le contact avec les oiseaux sauvages. La fermeture des marchés de volailles vivantes semble être la mesure la plus efficace et s'est avérée efficace pour contrôler la propagation du H5N1, du H7N9 et du H9N2 . D'autres mesures de biosécurité comprennent le nettoyage et la désinfection des installations et des véhicules, l'interdiction des visites dans les fermes avicoles, le fait de ne pas ramener les oiseaux destinés à l'abattage dans les fermes, le changement de vêtements, la désinfection des bains de pieds et le traitement des aliments et de l'eau.

Si les marchés de volailles vivantes ne sont pas fermés, alors les « jours propres » lorsque les volailles invendues sont retirées et les installations sont désinfectées et les politiques « pas de transfert » pour éliminer le matériel infectieux avant l'arrivée de nouvelles volailles peuvent être utilisées pour réduire la propagation des virus de la grippe. Si un nouveau virus grippal a enfreint les mesures de biosécurité susmentionnées, une détection rapide pour l'éradiquer via la mise en quarantaine, la décontamination et l'abattage peut être nécessaire pour empêcher le virus de devenir endémique. Des vaccins existent pour les sous-types aviaires H5, H7 et H9 qui sont utilisés dans certains pays. En Chine, par exemple, la vaccination des oiseaux domestiques contre le H7N9 a réussi à limiter sa propagation, ce qui indique que la vaccination peut être une stratégie efficace si elle est utilisée en combinaison avec d'autres mesures pour limiter la transmission. Chez les porcs et les chevaux, la gestion de la grippe dépend de la vaccination avec biosécurité.

Diagnostic

Radiographie d'une personne de 29 ans atteinte du H1N1

Le diagnostic basé sur les symptômes est assez précis chez les personnes par ailleurs en bonne santé pendant les épidémies saisonnières et doit être suspecté en cas de pneumonie, de syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA), de septicémie ou en cas d'encéphalite, de myocardite ou de dégradation du tissu musculaire . Étant donné que la grippe est similaire à d'autres maladies virales des voies respiratoires, un diagnostic de laboratoire est nécessaire pour la confirmation. Les méthodes courantes de prélèvement d'échantillons pour les tests comprennent les écouvillonnages nasaux et pharyngés. Des échantillons peuvent être prélevés dans les voies respiratoires inférieures si l'infection a éliminé les voies respiratoires supérieures mais pas inférieures. Le dépistage de la grippe est recommandé pour toute personne hospitalisée présentant des symptômes ressemblant à la grippe pendant la saison de la grippe ou qui est liée à un cas de grippe. Pour les cas graves, un diagnostic plus précoce améliore les résultats pour le patient. Les méthodes de diagnostic permettant d'identifier la grippe comprennent les cultures virales , les tests de détection d'anticorps et d'antigènes et les tests basés sur les acides nucléiques.

Les virus peuvent être cultivés dans une culture de cellules de mammifères ou d' œufs embryonnés pendant 3 à 10 jours pour surveiller l'effet cytopathique. La confirmation finale peut ensuite être effectuée par coloration d'anticorps, hémadsorption à l'aide de globules rouges ou microscopie par immunofluorescence . Les cultures en flacons coques, qui peuvent identifier l'infection par immunocoloration avant l'apparition d'un effet cytopathique, sont plus sensibles que les cultures traditionnelles avec des résultats en 1 à 3 jours. Les cultures peuvent être utilisées pour caractériser de nouveaux virus, observer la sensibilité aux médicaments antiviraux et surveiller la dérive antigénique, mais elles sont relativement lentes et nécessitent des compétences et un équipement spécialisés.

Des tests sérologiques peuvent être utilisés pour détecter une réponse en anticorps à la grippe après une infection naturelle ou une vaccination. Les tests sérologiques courants comprennent les tests d'inhibition de l'hémagglutination qui détectent les anticorps spécifiques de l'HA, les tests de neutralisation du virus qui vérifient si les anticorps ont neutralisé le virus et les tests d'immunoabsorption enzymatique. Ces méthodes ont tendance à être relativement peu coûteuses et rapides, mais sont moins fiables que les tests basés sur les acides nucléiques.

Les tests d'anticorps fluorescents ou immunofluorescents directs (DFA/IFA) impliquent la coloration des cellules épithéliales respiratoires dans des échantillons avec des anticorps spécifiques de la grippe marqués par fluorescence, suivie d'un examen au microscope à fluorescence. Ils peuvent différencier IAV et IBV mais ne peuvent pas sous-typer IAV. Les tests de diagnostic rapide de la grippe (RIDT) sont un moyen simple d'obtenir des résultats d'analyse, sont peu coûteux et produisent des résultats rapidement, en moins de 30 minutes, ils sont donc couramment utilisés, mais ils ne peuvent pas faire la distinction entre l'IAV et l'IBV ou entre l'IAV sous-types et ne sont pas aussi sensibles que les tests basés sur les acides nucléiques.

Les tests basés sur les acides nucléiques (NAT) amplifient et détectent les acides nucléiques viraux. La plupart de ces tests prennent quelques heures, mais les tests moléculaires rapides sont aussi rapides que les RIDT. Parmi les NAT, la réaction en chaîne par polymérase à transcription inverse (RT-PCR) est la plus traditionnelle et considérée comme la référence pour le diagnostic de la grippe car elle est rapide et peut sous-typer l'IAV, mais elle est relativement chère et plus sujette aux faux positifs que les cultures. D'autres NAT qui ont été utilisés comprennent des tests basés sur l' amplification isotherme à médiation par boucle , des tests basés sur l'amplification simples et l'amplification basée sur la séquence d'acides nucléiques. Les méthodes de séquençage d'acide nucléique peuvent identifier une infection en obtenant la séquence d'acide nucléique d'échantillons viraux pour identifier le virus et la résistance aux médicaments antiviraux. La méthode traditionnelle est le séquençage de Sanger , mais elle a été largement remplacée par des méthodes de nouvelle génération qui ont une vitesse et un débit de séquençage plus élevés.

Traitement

Le traitement de la grippe en cas de maladie légère ou modérée est de soutien et comprend des médicaments anti-fièvre tels que l' acétaminophène et l' ibuprofène , un apport hydrique suffisant pour éviter la déshydratation et le repos à la maison. Les gouttes contre la toux et les sprays pour la gorge peuvent être bénéfiques pour les maux de gorge. Il est recommandé d'éviter la consommation d'alcool et de tabac en cas de grippe. L'aspirine n'est pas recommandée pour traiter la grippe chez les enfants en raison d'un risque élevé de développer le syndrome de Reye. De même, les corticostéroïdes ne sont pas recommandés, sauf dans le traitement d' un choc septique ou d'une affection médicale sous-jacente, telle qu'une maladie pulmonaire obstructive chronique ou une exacerbation de l'asthme, car ils sont associés à une mortalité accrue. En cas d'infection bactérienne secondaire, un traitement antibiotique peut être nécessaire.

Antiviraux

Médicaments antiviraux
Médicament Voie d'administration Âge d'utilisation approuvé
Oseltamivir Oral Au moins deux semaines
Zanamivir Inhalation Au moins cinq ans
Peramivir Injection intraveineuse Au moins 18 ans
Laninamivir Inhalation Dose de 40 milligrammes (mg) pour les personnes d'au moins 10 ans,
20 mg pour les moins de 10 ans
Baloxavir marboxil Oral Au moins 12 ans

Les médicaments antiviraux sont principalement utilisés pour traiter les patients gravement malades, en particulier ceux dont le système immunitaire est affaibli. Les antiviraux sont plus efficaces lorsqu'ils sont administrés dans les 48 heures suivant l'apparition des symptômes. Une administration ultérieure peut toujours être bénéfique pour ceux qui ont des défauts immunitaires sous-jacents, ceux qui présentent des symptômes plus graves ou ceux qui ont un risque plus élevé de développer des complications si ces personnes excrètent encore le virus. Un traitement antiviral est également recommandé si une personne est hospitalisée pour une suspicion de grippe au lieu d'attendre le retour des résultats des tests et si les symptômes s'aggravent. La plupart des médicaments antiviraux contre la grippe se répartissent en deux catégories : les inhibiteurs de la neuraminidase (NA) et les inhibiteurs M2. Le baloxavir marboxil est une exception notable, qui cible l'activité endonucléase de l'ARN polymérase virale et peut être utilisé comme alternative aux inhibiteurs de NA et M2 pour l'IAV et l'IBV.

Les inhibiteurs de NA ciblent l'activité enzymatique des récepteurs NA, imitant la liaison de l'acide sialique dans le site actif de NA sur les virions IAV et IBV de sorte que la libération virale des cellules infectées et le taux de réplication virale sont altérés. Les inhibiteurs de la NA comprennent l'oseltamivir, qui est consommé par voie orale sous forme de promédicament et converti en sa forme active dans le foie, et le zanamivir, qui est une poudre qui est inhalée par voie nasale. L'oseltamivir et le zanamivir sont efficaces pour la prophylaxie et la prophylaxie post-exposition, et la recherche indique dans l'ensemble que les inhibiteurs de la NA sont efficaces pour réduire les taux de complications, d'hospitalisation, de mortalité et la durée de la maladie. De plus, plus les inhibiteurs de NA sont fournis tôt, meilleur est le résultat, bien qu'une administration tardive puisse toujours être bénéfique dans les cas graves. D'autres inhibiteurs de la NA comprennent le laninamivir et le peramivir, ce dernier pouvant être utilisé comme alternative à l'oseltamivir pour les personnes qui ne peuvent pas le tolérer ou l'absorber.

Les adamantanes amantadine et rimantadine sont des médicaments administrés par voie orale qui bloquent le canal ionique M2 du virus de la grippe, empêchant ainsi le décapage viral. Ces médicaments ne sont fonctionnels que contre l'IAV mais ne sont plus recommandés pour une utilisation en raison de la résistance généralisée à eux parmi les IAV. La résistance à l'adamantane est apparue pour la première fois dans le H3N2 en 2003, devenant mondiale en 2008. La résistance à l'oseltamivir n'est plus répandue car la souche pandémique H1N1 de 2009 (H1N1 pdm09), résistante aux adamantanes, a apparemment remplacé les souches résistantes en circulation. Depuis la pandémie de 2009, la résistance à l'oseltamivir a été principalement observée chez les patients sous traitement, en particulier les enfants immunodéprimés et les jeunes enfants. La résistance à l'oseltamivir est généralement signalée dans le H1N1, mais a été signalée moins fréquemment dans le H3N2 et les IBV. Pour cette raison, l'oseltamivir est recommandé comme premier médicament de choix pour les personnes immunocompétentes, alors que pour les immunodéprimés, l'oseltamivir est recommandé contre H3N2 et IBV et le zanamivir contre H1N1 pdm09. Une résistance au zanamivir est observée moins fréquemment et une résistance au péramivir et au baloxavir marboxil est possible.

Pronostic

Chez les personnes en bonne santé, l'infection grippale est généralement spontanément résolutive et rarement mortelle. Les symptômes durent généralement de 2 à 8 jours. La grippe peut amener les gens à s'absenter du travail ou de l'école, et elle est associée à une diminution du rendement au travail et, chez les personnes âgées, à une autonomie réduite. La fatigue et le malaise peuvent durer plusieurs semaines après la guérison, et les adultes en bonne santé peuvent présenter des anomalies pulmonaires qui peuvent mettre plusieurs semaines à se résorber. Les complications et la mortalité surviennent principalement dans les populations à haut risque et celles qui sont hospitalisées. La maladie grave et la mortalité sont généralement attribuables à une pneumonie due à une infection virale primaire ou à une infection bactérienne secondaire, qui peut évoluer vers le SDRA.

D'autres complications respiratoires qui peuvent survenir incluent une sinusite , une bronchite , une bronchiolite , une accumulation excessive de liquide dans les lingots, et l'exercicebation de la bronchite chronique et de l'asthme. Une infection de l'oreille moyenne et un croup peuvent survenir, le plus souvent chez les enfants. Une infection secondaire à S. aureus a été observée, principalement chez les enfants, provoquant un syndrome de choc toxique après la grippe, avec hypotension, fièvre, rougeur et desquamation de la peau. Les complications affectant le système cardiovasculaire sont rares et comprennent la péricardite, la myocardite fulminante avec un rythme cardiaque rapide, lent ou irrégulier et l'exacerbation d'une maladie cardiovasculaire préexistante. L'inflammation ou l'enflure des muscles accompagnée d'une rupture du tissu musculaire se produit rarement, généralement chez les enfants, qui se manifeste par une sensibilité extrême et des douleurs musculaires dans les jambes et une réticence à marcher pendant 2 à 3 jours.

La grippe peut affecter la grossesse, notamment en causant une taille néonatale plus petite, un risque accru de naissance prématurée et un risque accru de décès de l'enfant peu de temps avant ou après la naissance. Des complications neurologiques ont été associées à la grippe à de rares occasions, notamment la méningite aseptique, l'encéphalite, l'encéphalomyélite disséminée, la myélite transverse et le syndrome de Guillain-Barré . De plus, des convulsions fébriles et le syndrome de Reye peuvent survenir, le plus souvent chez les enfants. L'encéphalopathie associée à la grippe peut survenir directement à partir d'une infection du système nerveux central due à la présence du virus dans le sang et se présente sous la forme d'une fièvre d'apparition soudaine accompagnée de convulsions, suivie d'une progression rapide vers le coma. Une forme atypique d'encéphalite appelée encéphalite léthargique, caractérisée par des maux de tête, une somnolence et un coma, peut rarement survenir quelque temps après l'infection. Chez les survivants d'une encéphalopathie associée à la grippe, des anomalies neurologiques peuvent survenir. Principalement chez les enfants, dans les cas graves, le système immunitaire peut rarement produire une surproduction dramatique de globules blancs qui libèrent des cytokines, provoquant une inflammation sévère.

Les personnes âgées d'au moins 65 ans, en raison d'un système immunitaire affaibli par le vieillissement ou d'une maladie chronique, constituent un groupe à haut risque de développer des complications, tout comme les enfants de moins d'un an et les enfants qui n'ont pas été exposés auparavant. plusieurs fois aux virus de la grippe. Les femmes enceintes courent un risque élevé, qui augmente par trimestre et dure jusqu'à deux semaines après l'accouchement. L'obésité, en particulier un indice de masse corporelle supérieur à 35-40, est associée à de plus grandes quantités de réplication virale, à une sévérité accrue de l'infection bactérienne secondaire et à une efficacité réduite de la vaccination. Les personnes qui ont des problèmes de santé sous-jacents sont également considérées à risque, y compris celles qui ont des problèmes cardiaques congénitaux ou chroniques ou des troubles pulmonaires (par exemple, l'asthme), des reins, du foie, du sang, neurologiques ou métaboliques (par exemple, le diabète ), tout comme les personnes qui sont immunodéprimé par la chimiothérapie, l' asplénie , un traitement prolongé aux stéroïdes, un dysfonctionnement splénique ou une infection par le VIH . La consommation actuelle ou passée de tabac met également une personne à risque. Le rôle de la génétique dans la grippe n'est pas bien étudié, mais il peut être un facteur de mortalité grippale.

Épidémiologie

Mortalité grippale des cas symptomatiques aux États-Unis pour la saison 2018/2019.

La grippe se caractérise généralement par des épidémies saisonnières et des pandémies sporadiques. La plus grande partie du fardeau de la grippe est le résultat des saisons grippales causées par l'IAV et l'IBV. Parmi les sous-types d'IAV, H1N1 et H3N2 circulent actuellement chez l'homme et sont responsables de la grippe saisonnière. Les cas surviennent de manière disproportionnée chez les enfants, mais les causes les plus graves sont chez les personnes âgées, les très jeunes et les immunodéprimés. Au cours d'une année typique, les virus de la grippe infectent 5 à 15 % de la population mondiale, provoquant 3 à 5 millions de cas de maladie grave par an et entraînant chaque année 290 000 à 650 000 décès dus à des maladies respiratoires. 5 à 10 % des adultes et 20 à 30 % des enfants contractent la grippe chaque année. Le nombre de cas de grippe signalé est généralement bien inférieur au nombre réel de cas.

Pendant les épidémies saisonnières, on estime qu'environ 80 % des personnes par ailleurs en bonne santé qui ont une toux ou un mal de gorge ont la grippe. Environ 30 à 40 % des personnes hospitalisées pour la grippe développent une pneumonie, et environ 5 % de tous les cas de pneumonie grave dans les hôpitaux sont dus à la grippe, qui est également la cause la plus fréquente du SDRA chez les adultes. Chez l'enfant, la grippe est l'une des deux causes les plus fréquentes de SDRA, l'autre étant le virus respiratoire syncytial . Environ 3 à 5 % des enfants développent chaque année une otite moyenne due à la grippe. Les adultes qui développent une insuffisance organique due à la grippe et les enfants qui ont des scores PIM et une insuffisance rénale aiguë ont des taux de mortalité plus élevés. Pendant la grippe saisonnière, la mortalité est concentrée chez les très jeunes et les personnes âgées, alors que pendant les pandémies de grippe, les jeunes adultes sont souvent touchés à un taux élevé.

Zones à risque saisonnier pour la grippe : novembre-avril (bleu), avril-novembre (rouge) et toute l'année (jaune)

Dans les régions tempérées, le nombre de cas de grippe varie d'une saison à l'autre. Des niveaux inférieurs de vitamine D , probablement dus à moins de soleil, à une humidité plus faible, à une température plus basse et à des changements mineurs dans les protéines virales causés par la dérive antigénique, contribuent aux épidémies annuelles qui culminent pendant la saison hivernale. Dans l'hémisphère nord, c'est d'octobre à mai (plus précisément de décembre à avril), et dans l'hémisphère sud, c'est de mai à octobre (plus étroitement de juin à septembre). Il y a donc deux saisons grippales distinctes chaque année dans les régions tempérées, une dans l'hémisphère nord et une dans l'hémisphère sud. Dans les régions tropicales et subtropicales, la saisonnalité est plus complexe et semble être affectée par divers facteurs climatiques tels que la température minimale, les heures d'ensoleillement, les précipitations maximales et une humidité élevée. La grippe peut donc sévir toute l'année dans ces régions. Les épidémies de grippe à l'époque moderne ont tendance à commencer dans l'hémisphère est ou sud, l'Asie étant un réservoir clé de virus de la grippe.

IAV et IBV co-circulent, de sorte que les deux ont les mêmes schémas de transmission. La saisonnalité de l'ICV, cependant, est mal comprise. L'infection par ICV est plus fréquente chez les enfants de moins de 2 ans et, à l'âge adulte, la plupart des gens y ont été exposés. L'hospitalisation associée à la VCI survient le plus souvent chez les enfants de moins de 3 ans et s'accompagne fréquemment d'une co-infection avec un autre virus ou une bactérie, ce qui peut augmenter la gravité de la maladie. Lorsque l'on considère toutes les hospitalisations pour maladie respiratoire chez les jeunes enfants, la VCI semble ne représenter qu'un faible pourcentage de ces cas. De grandes épidémies d'infection par ICV peuvent survenir, de sorte que l'incidence varie considérablement.

Les épidémies de grippe causées par de nouveaux virus grippaux sont courantes. Selon le niveau d'immunité préexistante de la population, les nouveaux virus grippaux peuvent se propager rapidement et provoquer des pandémies faisant des millions de morts. Ces pandémies, contrairement à la grippe saisonnière, sont causées par des changements antigéniques impliquant des virus de la grippe animale. À ce jour, toutes les pandémies de grippe connues ont été causées par des IAV et elles suivent le même schéma de propagation d'un point d'origine au reste du monde au cours de plusieurs vagues au cours d'une année. Les souches pandémiques ont tendance à être associées à des taux plus élevés de pneumonie chez des individus par ailleurs en bonne santé. Généralement, après chaque pandémie de grippe, la souche pandémique continue de circuler en tant que cause de la grippe saisonnière, remplaçant les souches antérieures. De 1700 à 1889, les pandémies de grippe se sont produites environ une fois tous les 50 à 60 ans. Depuis lors, les pandémies se sont produites environ une fois tous les 10 à 50 ans, elles peuvent donc devenir plus fréquentes avec le temps.

Histoire

Les principaux types de virus de la grippe chez l'homme. Les carrés pleins montrent l'apparition d'une nouvelle souche, provoquant des pandémies de grippe récurrentes. Les lignes interrompues indiquent des identifications de souches incertaines.

Il est impossible de savoir quand un virus de la grippe a infecté les humains pour la première fois ou quand la première pandémie de grippe s'est produite. La première épidémie de grippe s'est peut-être produite vers 6 000 av. J.-C. en Chine, et des descriptions possibles de la grippe existent dans les écrits grecs du Ve siècle av. En 1173-1174 après JC et en 1387 après JC, des épidémies se sont produites à travers l'Europe et ont été nommées « grippe ». On ne sait pas si ces épidémies et d'autres ont été causées par la grippe, car il n'y avait pas de modèle de dénomination cohérent pour les maladies respiratoires épidémiques à cette époque, et la « grippe » n'est devenue complètement liée aux maladies respiratoires que des siècles plus tard. La grippe a peut-être été introduite dans les Amériques dès 1493, lorsqu'une maladie épidémique ressemblant à la grippe a tué la plupart de la population des Antilles .

Le premier enregistrement convaincant d'une pandémie de grippe a été relaté en 1510 ; elle a commencé en Asie de l'Est avant de s'étendre à l'Afrique du Nord puis à l'Europe. Après la pandémie, la grippe saisonnière s'est produite, avec des pandémies subséquentes en 1557 et 1580. La pandémie de grippe en 1557 était potentiellement la première fois que la grippe était liée à une fausse couche et à la mort de femmes enceintes. La pandémie de grippe de 1580 est née en Asie pendant l'été, s'est propagée à l'Afrique, puis à l'Europe et enfin à l'Amérique. À la fin du XVIe siècle, la grippe commençait probablement à être comprise comme une maladie spécifique et reconnaissable avec des formes épidémiques et endémiques. En 1648, on découvrit que les chevaux souffraient également de la grippe.

Les données sur la grippe après 1700 sont plus informatives, il est donc plus facile d'identifier les pandémies de grippe après ce point, chacune augmentant progressivement la compréhension de la grippe. La première pandémie de grippe du XVIIIe siècle a commencé en 1729 en Russie au printemps, s'étendant dans le monde entier en trois ans avec des vagues distinctes, les dernières étant plus meurtrières. La deuxième pandémie de grippe du XVIIIe siècle a eu lieu en 1781-1782, commençant en Chine à l'automne. À partir de cette pandémie, la grippe est devenue associée à des flambées soudaines de maladie fébrile. La prochaine pandémie de grippe a eu lieu de 1830 à 1833, commençant en Chine en hiver. Cette pandémie avait un taux d'attaque élevé, mais le taux de mortalité était faible.

Une pandémie de grippe mineure s'est produite de 1847 à 1851 en même temps que la troisième pandémie de choléra et a été la première pandémie de grippe à se produire avec des statistiques de l'état civil, de sorte que la mortalité due à la grippe a été clairement enregistrée pour la première fois. L'influenza aviaire hautement pathogène a été reconnue en 1878 et a rapidement été associée à une transmission à l'homme. Au moment de la pandémie de 1889 , qui pourrait avoir été causée par une souche H2N2, la grippe était devenue une maladie facilement reconnaissable.

Initialement, l'agent microbien responsable de la grippe a été identifié par erreur en 1892 par RFJ Pfeiffer comme étant l'espèce bactérienne Haemophilus influenzae , qui retient « grippe » dans son nom. Dans les années qui ont suivi, le domaine de la virologie a commencé à se former lorsque les virus ont été identifiés comme la cause de nombreuses maladies. De 1901 à 1903, des chercheurs italiens et autrichiens ont pu montrer que la grippe aviaire, alors appelée « peste aviaire », était causée par un agent microscopique plus petit que les bactéries en utilisant des filtres aux pores trop petits pour le passage des bactéries. Les différences fondamentales entre les virus et les bactéries, cependant, n'étaient pas encore entièrement comprises.

Différence entre les distributions par âge de la mortalité grippale de l'épidémie de 1918 et des épidémies normales. Décès pour 100 000 personnes dans chaque groupe d'âge, États-Unis, pour les années interpandémiques 1911-1917 (ligne pointillée) et l'année pandémique 1918 (ligne continue).

De 1918 à 1920, la pandémie de grippe espagnole est devenue la pandémie de grippe la plus dévastatrice et l'une des pandémies les plus meurtrières de l'histoire. La pandémie, probablement causée par le H1N1, a probablement commencé aux États-Unis avant de se propager dans le monde entier par les soldats pendant et après la Première Guerre mondiale . La vague initiale de la première moitié de 1918 était relativement mineure et ressemblait aux pandémies de grippe passées, mais la deuxième vague plus tard cette année-là avait un taux de mortalité beaucoup plus élevé, représentant la plupart des décès. Une troisième vague avec une mortalité plus faible s'est produite dans de nombreux endroits quelques mois après la seconde. À la fin de 1920, on estime qu'environ un tiers à la moitié de toutes les personnes dans le monde avaient été infectées, avec des dizaines de millions de décès, de manière disproportionnée de jeunes adultes. Au cours de la pandémie de 1918, la voie respiratoire de transmission a été clairement identifiée et la grippe s'est avérée être causée par un « passeur de filtre », pas une bactérie, mais il restait un manque d'accord sur la cause de la grippe pendant une autre décennie et la recherche sur la grippe a diminué. Après la pandémie, le H1N1 a circulé chez l'homme sous forme saisonnière jusqu'à la prochaine pandémie.

En 1931, Richard Shope a publié trois articles identifiant un virus comme cause de la grippe porcine, une maladie alors nouvellement reconnue chez les porcs qui a été caractérisée pour la première fois au cours de la deuxième vague de la pandémie de 1918. Les recherches de Shope ont redynamisé la recherche sur la grippe humaine, et de nombreux progrès en virologie, sérologie, immunologie, modèles animaux expérimentaux, vaccinologie et immunothérapie sont depuis issus de la recherche sur la grippe. Deux ans seulement après la découverte des virus de la grippe, en 1933, l'IAV a été identifié comme l'agent responsable de la grippe humaine. Des sous-types d'IAV ont été découverts tout au long des années 1930 et l'IBV a été découvert en 1940.

Pendant la Seconde Guerre mondiale , le gouvernement américain a travaillé au développement de vaccins inactivés contre la grippe, ce qui a permis au premier vaccin antigrippal d'être homologué en 1945 aux États-Unis. L'ICV a été découvert deux ans plus tard en 1947. En 1955, il a été confirmé que la grippe aviaire était causée par l'IAV. Quatre pandémies de grippe se sont produites depuis la Seconde Guerre mondiale, chacune moins grave que la pandémie de 1918. Le premier d'entre eux était la grippe asiatique de 1957 à 1958, causée par une souche H2N2 et ayant débuté dans la province chinoise du Yunnan . Le nombre de décès a probablement dépassé le million, principalement parmi les très jeunes et les très vieux. Notamment, la pandémie de 1957 a été la première pandémie de grippe à se produire en présence d'un système de surveillance mondial et de laboratoires capables d'étudier le nouveau virus de la grippe. Après la pandémie, le H2N2 était le sous-type d'IAV responsable de la grippe saisonnière. Le premier médicament antiviral contre la grippe, l'amantadine, a été approuvé en 1966, avec d'autres médicaments antiviraux utilisés depuis les années 1990.

En 1968, H3N2 a été introduit chez l'homme à la suite d'un réassortiment entre une souche H3N2 aviaire et une souche H2N2 qui circulait chez l'homme. La nouvelle souche H3N2 est apparue pour la première fois à Hong Kong et s'est propagée dans le monde entier, provoquant la pandémie de grippe de Hong Kong , qui a fait 500 000 à 2 000 000 de décès. Il s'agit de la première pandémie à se propager de manière significative par voie aérienne. Le H2N2 et le H3N2 ont co-circulé après la pandémie jusqu'en 1971, date à laquelle le H2N2 a diminué en prévalence et a été complètement remplacé par le H3N2. En 1977, le H1N1 est réapparu chez l'homme, peut-être après sa sortie d'un congélateur lors d'un accident de laboratoire, et a provoqué une pseudo-pandémie . La question de savoir si la « pandémie » de 1977 mérite d'être incluse dans l'histoire naturelle des pandémies de grippe est discutable. Cette souche H1N1 était antigéniquement similaire aux souches H1N1 qui circulaient avant 1957. Depuis 1977, H1N1 et H3N2 ont circulé chez les humains dans le cadre de la grippe saisonnière. En 1980, le système de classification actuel utilisé pour sous-typer les virus de la grippe a été introduit.

Caméra et écran à imagerie thermique, photographiés dans un terminal d'aéroport en Grèce pendant la pandémie de grippe de 2009. L'imagerie thermique peut détecter une température corporelle élevée, l'un des signes de la grippe porcine.

À un moment donné, l'IBV a divergé en deux lignées, appelées lignées de type B/Victoria et B/Yamagata, qui circulent toutes deux chez l'homme depuis 1983. En 1996, l'IAHP H5N1 a été détectée dans le Guangdong , en Chine et un an plus tard émergé dans la volaille à Hong Kong, s'étendant progressivement dans le monde entier à partir de là. Une petite épidémie de H5N1 chez l'homme à Hong Kong s'est alors produite, et des cas humains sporadiques se sont produits depuis 1997, entraînant un taux de létalité élevé. La pandémie de grippe la plus récente a été la pandémie de grippe porcine de 2009 , qui est originaire du Mexique et a fait des centaines de milliers de morts. Il a été causé par une nouvelle souche H1N1 qui était un réassortiment de virus de la grippe humaine, porcine et aviaire. La pandémie de 2009 a eu pour effet de remplacer les anciennes souches H1N1 en circulation par la nouvelle souche, mais pas par d'autres virus grippaux. Par conséquent, H1N1, H3N2 et les deux lignées IBV sont en circulation sous forme saisonnière depuis la pandémie de 2009.

En 2011, l'IDV a été découvert chez des porcs en Oklahoma, aux États-Unis, et les bovins ont ensuite été identifiés comme le principal réservoir d'IDV. La même année, le H7N9 aviaire a été détecté en Chine et a commencé à provoquer des infections humaines en 2013, commençant à Shanghai et Anhui et restant principalement en Chine. L'IAHP H7N9 est apparue en 2016 et a occasionnellement infecté des humains de manière accidentelle. D'autres AIV ont moins fréquemment infecté les humains depuis les années 1990, notamment H5N6 , H6N1 , H7N2-4, H7N7 et H10N7-8, et les sous-types H de l'IAHP tels que H5N1-3, H5N5-6 et H5N8 ont commencé à se propager dans une grande partie du le monde depuis les années 2010. Les futures pandémies de grippe, qui peuvent être causées par un virus de la grippe d'origine aviaire, sont considérées comme presque inévitables, et la mondialisation croissante a facilité la propagation de nouveaux virus, de sorte que des efforts constants sont déployés pour se préparer aux futures pandémies et améliorer la prévention et la traitement de la grippe.

Étymologie

Le mot grippe vient du mot italien influenza , du latin médiéval influentia , signifiant à l'origine « visite » ou « influence ». Des termes tels que influenza di freddo , signifiant « influence du froid », et influenza di stelle , signifiant « influence des astres » sont attestés dès le XIVe siècle. Ce dernier faisait référence à la cause de la maladie, qui à l'époque était attribuée par certains à des conditions astrologiques défavorables. Dès 1504, la grippe a commencé à signifier une « visite » ou une « épidémie » de toute maladie affectant de nombreuses personnes en un seul endroit à la fois. Lors d'une épidémie de grippe en 1743 qui a commencé en Italie et s'est propagée dans toute l'Europe, le mot a atteint la langue anglaise et a été anglicisé dans sa prononciation. Depuis le milieu des années 1800, la grippe est également utilisée pour désigner les rhumes sévères. La forme abrégée du mot, « (la) grippe », est d' abord attesté en 1839 comme fumée avec l'orthographe grippe d' abord attesté en 1893. D' autres noms qui ont été utilisés pour la grippe comprennent épidémie catarrhe , la grippe du français , la maladie de transpiration , et, en particulier lorsqu'il s'agit de la souche pandémique de 1918, la fièvre espagnole .

Recherche

Professionnel examinant une reconstruction en laboratoire du virus de la grippe espagnole de 1918 dans un environnement de niveau 3 de biosécurité

La recherche sur la grippe est vaste et comprend des efforts pour comprendre comment les virus grippaux pénètrent dans les hôtes, la relation entre les virus grippaux et les bactéries, comment les symptômes de la grippe progressent et ce qui rend certains virus grippaux plus mortels que d'autres. Des protéines non structurelles codées par les virus de la grippe sont périodiquement découvertes et leurs fonctions sont continuellement à l'étude. Les pandémies passées, et en particulier la pandémie de 1918, font l'objet de nombreuses recherches pour comprendre les pandémies de grippe. Dans le cadre de la préparation à une pandémie, le Système mondial de surveillance et de riposte à la grippe est un réseau mondial de laboratoires qui surveille la transmission et l'épidémiologie de la grippe. D'autres domaines de recherche comprennent des moyens d'améliorer le diagnostic, le traitement et la prévention de la grippe.

Les méthodes de diagnostic existantes ont une variété de limitations couplées à leurs avantages. Par exemple, les NAT ont une sensibilité et une spécificité élevées, mais ne sont pas pratiques dans les régions sous-financées en raison de leur coût élevé, de leur complexité, de la maintenance et de la formation requise. Les RIDT portables à faible coût peuvent diagnostiquer rapidement la grippe mais ont une sensibilité très variable et sont incapables de sous-typer l'IAV. En raison de ces limitations et d'autres, la recherche sur de nouvelles méthodes de diagnostic s'articule autour de la production de nouvelles méthodes rentables, moins laborieuses et moins complexes que les méthodes existantes tout en étant capable de différencier les espèces de grippe et les sous-types d'IAV. Une approche en développement est le laboratoire sur puce , qui sont des dispositifs de diagnostic qui utilisent une variété de tests de diagnostic, tels que la RT-PCR et les tests sérologiques, sous forme de micropuce. Ces puces présentent de nombreux avantages potentiels, notamment une efficacité de réaction élevée, une faible consommation d'énergie et une faible production de déchets.

De nouveaux médicaments antiviraux sont également en cours de développement en raison de l'élimination des adamantines en tant que médicaments viables et des préoccupations concernant la résistance à l'oseltamivir. Ceux-ci incluent : les inhibiteurs de NA qui peuvent être injectés par voie intraveineuse, tels que les formulations intraveineuses de zanamivir ; le favipiravir , qui est un inhibiteur de polymérase utilisé contre plusieurs virus à ARN ; le pimodivir , qui empêche la liaison à la coiffe requise lors de la transcription virale ; et le nitazoxanide , qui inhibe la maturation de l'HA. La réduction de l'excès d'inflammation dans les voies respiratoires fait également l'objet de nombreuses recherches car il s'agit de l'un des principaux mécanismes de la pathologie grippale. D'autres formes de thérapie en cours de développement comprennent des anticorps monoclonaux et polyclonaux qui ciblent les protéines virales, le plasma convalescent, différentes approches pour modifier la réponse antivirale de l'hôte et des thérapies à base de cellules souches pour réparer les lésions pulmonaires.

De nombreuses recherches sur les VVAI se concentrent sur l'identification de séquences génomiques qui peuvent être supprimées pour créer des virus grippaux inoffensifs dans des vaccins qui confèrent encore une immunité. Cependant, la grande variabilité et l'évolution rapide des antigènes du virus de la grippe constituent un obstacle majeur au développement de vaccins efficaces. De plus, il est difficile de prédire quelles souches seront en circulation au cours de la prochaine saison grippale, la fabrication d'une quantité suffisante de vaccins antigrippaux pour la prochaine saison est difficile, les VVAI ont une efficacité limitée et la vaccination annuelle répétée a potentiellement une efficacité diminuée. Pour ces raisons, des vaccins antigrippaux « largement réactifs » ou « universels » sont en cours de recherche et peuvent fournir une protection contre plusieurs ou tous les virus de la grippe. Les approches pour développer un tel vaccin comprennent des méthodes basées sur la tige HA telles que des chimères qui ont la même tige mais des têtes différentes, des méthodes basées sur la tête HA telles que des antigènes neutralisants largement optimisés par le calcul, des anticorps anti-idiotypiques et des vaccins pour susciter des réponses immunitaires à des protéines virales conservées. Des vaccins à ARNm pour fournir une protection contre la grippe sont également en cours de recherche.

Chez les animaux

Des oiseaux

Les oiseaux aquatiques tels que les canards, les oies, les oiseaux de rivage et les goélands sont le principal réservoir d'IAV. Chez les oiseaux, les AIV peuvent être soit des virus de l'influenza aviaire faiblement pathogène (LPAI) qui produisent peu ou pas de symptômes, soit des virus de l'influenza aviaire hautement pathogène (HPAI) qui provoquent une maladie grave. Les symptômes de l'infection par l'IAHP comprennent un manque d'énergie et d'appétit, une diminution de la production d'œufs, des œufs à coquille molle ou difformes, un gonflement de la tête, de la crête, des caroncules et des jarrets, une décoloration violette des caroncules, des crêtes et des pattes, des écoulements nasaux, de la toux, des éternuements , incoordination et diarrhée. Les oiseaux infectés par un virus de l'IAHP peuvent également mourir subitement sans aucun signe d'infection.

La distinction entre LPAI et HPAI peut généralement être faite en fonction de la létalité d'un AIV pour les poulets. Au niveau génétique, un AIV peut généralement être identifié comme un virus HPAI s'il possède un site de clivage multibasique dans la protéine HA, qui contient des résidus supplémentaires dans le gène HA. La plupart des AIV sont des LPAI. Les virus HPAI notables incluent HPAI H5N1 et HPAI H7N9. Les virus de l'IAHP ont été une charge de morbidité majeure au 21e siècle, entraînant la mort d'un grand nombre d'oiseaux. Dans le cas de H7N9, certaines souches circulantes étaient à l'origine LPAI mais sont devenues HPAI en acquérant le site de clivage multibasique HA. Le H9N2 aviaire est également préoccupant car bien qu'il s'agisse d'une LPAI, il s'agit d'un donneur commun de gènes pour H5N1 et H7N9 lors du réassortiment.

Les oiseaux migrateurs peuvent propager la grippe sur de longues distances. Un exemple de ceci était lorsqu'une souche H5N1 en 2005 a infecté des oiseaux au lac Qinghai , en Chine, qui est une escale et un site de reproduction pour de nombreux oiseaux migrateurs, propageant par la suite le virus dans plus de 20 pays à travers l'Asie, l'Europe et le Moyen-Orient. Les AIV peuvent être transmis des oiseaux sauvages aux canards domestiques élevés en plein air et à leur tour à la volaille par l'eau contaminée, les aérosols et les vecteurs passifs. Les canards agissent donc comme des intermédiaires clés entre les oiseaux sauvages et domestiques. La transmission à la volaille se produit généralement dans les élevages de basse-cour et les marchés d'animaux vivants où plusieurs espèces interagissent les unes avec les autres. De là, les AIV peuvent se propager aux élevages avicoles en l'absence d'une biosécurité adéquate. Chez les volailles, la transmission de l'IAHP se produit par les aérosols et les matières fécales, les cages, les aliments et les animaux morts contaminés. Une rétrotransmission des virus de l'IAHP de la volaille aux oiseaux sauvages s'est produite et est impliquée dans des mortalités massives et une propagation intercontinentale.

Les AIV ont occasionnellement infecté les humains par le biais d'aérosols, de vecteurs passifs et d'eau contaminée. La transmission directionnelle par les oiseaux sauvages est rare. Au lieu de cela, la plupart des transmissions concernent la volaille domestique, principalement les poulets, les canards et les oies, mais aussi une variété d'autres oiseaux tels que la pintade, la perdrix, les faisans et les cailles. Le principal facteur de risque d'infection par les AIV est l'exposition aux oiseaux dans les fermes et les marchés de volailles vivantes. En règle générale, l'infection par un AIV a une période d'incubation de 3 à 5 jours, mais peut aller jusqu'à 9 jours. Le H5N1 et le H7N9 provoquent une maladie grave des voies respiratoires inférieures, tandis que d'autres AIV tels que le H9N2 provoquent une maladie plus légère des voies respiratoires supérieures, généralement accompagnée de conjonctivite. Une transmission limitée des sous-types aviaires H2, H5-7, H9 et H10 d'une personne à une autre par le biais de gouttelettes respiratoires, d'aérosols et de contaminants s'est produite, mais il n'y a pas eu de transmission interhumaine soutenue des AIV. Avant 2013, le H5N1 était l'AIV le plus courant pour infecter les humains. Depuis lors, le H7N9 est responsable de la plupart des cas humains.

Les cochons

Des inspecteurs chinois contrôlent la fièvre des passagers des compagnies aériennes, un symptôme courant de la grippe porcine

La grippe porcine est une maladie respiratoire similaire à la grippe humaine et est présente dans le monde entier. Les infections asymptomatiques sont fréquentes. Les symptômes apparaissent généralement 1 à 3 jours après l'infection et comprennent fièvre, léthargie, anorexie, perte de poids, respiration difficile, toux, éternuements et écoulement nasal. Chez les truies, la gestation peut être interrompue. Les complications comprennent des infections secondaires et une bronchopneumonie potentiellement mortelle . Les porcs deviennent contagieux dans la journée suivant l'infection et propagent généralement le virus pendant 7 à 10 jours, ce qui peut se propager rapidement au sein d'un troupeau. Les porcs guérissent généralement de l'infection dans les 3 à 7 jours suivant l'apparition des symptômes. Les mesures de prévention et de contrôle comprennent les vaccins inactivés et l'abattage des troupeaux infectés. Les virus de la grippe habituellement responsables de la grippe porcine sont les sous-types d'IAV H1N1, H1N2 et H3N2.

Certains IAV peuvent être transmis par aérosols des porcs aux humains et vice versa. De plus, les porcs, ainsi que les chauves-souris et les cailles, sont reconnus comme un récipient de mélange des virus de la grippe car ils possèdent à la fois des récepteurs d'acide sialique α-2,3 et -2,6 dans leurs voies respiratoires. Pour cette raison, les virus de la grippe aviaire et mammifère peuvent infecter les porcs. En cas de co-infection, un réassortiment est possible. Un exemple notable en est le réassortiment d'un virus de la grippe porcine, aviaire et humaine en 2009, résultant en une nouvelle souche H1N1 qui a causé la pandémie de grippe de 2009. Cependant, les effets de débordement des humains aux porcs semblent être plus fréquents que ceux des porcs aux humains.

Autres animaux

Des virus grippaux ont été trouvés chez de nombreux autres animaux, notamment les bovins, les chevaux, les chiens, les chats et les mammifères marins. Presque tous les IAV sont apparemment des descendants de virus ancestraux chez les oiseaux. L'exception sont les virus de type grippe de chauve-souris, dont l'origine est incertaine. Ces virus de chauve-souris ont les sous-types HA et NA H17, H18, N10 et N11. H17N10 et H18N11 sont incapables de se réassocier avec d'autres IAV, mais ils sont toujours capables de se répliquer chez d'autres mammifères. Les AIV se croisent parfois dans les mammifères. Par exemple, fin 2016-début 2017, une souche aviaire H7N2 s'est avérée infecter des chats à New York.

Les IAV équins comprennent H7N7 et deux lignées de H3N8 . Le H7N7, cependant, n'a pas été détecté chez les chevaux depuis la fin des années 1970, il pourrait donc s'être éteint chez les chevaux. Le H3N8 chez les équidés se propage via les aérosols et provoque des maladies respiratoires. Le H3N8 équin se lie de manière préférentielle aux acides α-2,3 sialiques, de sorte que les chevaux sont généralement considérés comme des hôtes sans issue, mais une transmission aux chiens et aux chameaux s'est produite, ce qui fait craindre que les chevaux ne mélangent les vaisseaux pour un réassortiment. Chez le chien, les seuls IAV en circulation sont le H3N8 d'origine équine et le H3N2 d'origine aviaire. Canine H3N8 n'a pas été observé pour se réassortir avec d'autres sous-types. H3N2 a une gamme d'hôtes beaucoup plus large et peut se réassortir avec H1N1 et H5N1. Un cas isolé de H6N1 provenant probablement d'un poulet a été trouvé en train d'infecter un chien, de sorte que d'autres AIV peuvent émerger chez les chiens.

Les autres mammifères infectés par les IAV comprennent H7N7 et H4N5 chez les phoques, H1N3 chez les baleines et H10N4 et H3N2 chez les visons. Diverses mutations ont été identifiées qui sont associées à l'adaptation des AIV aux mammifères. Étant donné que les protéines HA varient dans les acides sialiques auxquels elles se lient, des mutations dans le site de liaison du récepteur HA peuvent permettre aux AIV d'infecter les mammifères. D'autres mutations incluent des mutations affectant le clivage des protéines NA des acides sialiques et une mutation dans la sous-unité de la polymérase PB2 qui améliore la tolérance des températures plus basses dans les voies respiratoires des mammifères et améliore l'assemblage de RNP en stabilisant la liaison NP et PB2.

L'IBV est principalement présent chez l'homme, mais a également été détecté chez les porcs, les chiens, les chevaux et les phoques. De même, l'ICV infecte principalement les humains, mais a été observé chez les porcs, les chiens, les bovins et les dromadaires. L'IDV provoque une maladie pseudo-grippale chez les porcs, mais son impact dans son réservoir naturel, le bétail, est relativement inconnu. Il peut provoquer une maladie respiratoire ressemblant à la grippe humaine à lui seul, ou il peut faire partie d'un complexe de maladie respiratoire bovine (BRD) avec d'autres agents pathogènes lors d'une co-infection. La BRD est une préoccupation pour l'industrie bovine, donc l'implication possible d'IDV dans la BRD a conduit à des recherches sur des vaccins pour le bétail qui peuvent fournir une protection contre l'IDV. Deux lignées antigéniques sont en circulation : D/swine/Oklahoma/1334/2011 (D/OK) et D/bovine/Oklahoma/660/2013 (D/660).

Les références

Liens externes

Classification
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