KDM1A - KDM1A

KDM1A
Structures disponibles
APD Recherche orthologue : PDBe RCSB
Identifiants
Alias KDM1A , AOF2 , BHC110, KDM1, LSD1, CPRF, lysine déméthylase 1A
Identifiants externes OMIM : 609132 MGI : 1196256 HomoloGene : 32240 GeneCards : KDM1A
Orthologues
Espèce Humain Souris
Entrez
Ensemble
UniProt
RefSeq (ARNm)

NM_001009999
NM_015013
NM_001363654

NM_133872
NM_001347221
NM_001356567

RefSeq (protéine)

NP_00109999
NP_055828
NP_001350583

NP_001334150
NP_598633
NP_001343496

Localisation (UCSC) Chr 1 : 23.02 – 23.08 Mo Chr 4: 136,55 – 136,6 Mo
Recherche PubMed
Wikidata
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L'histone déméthylase 1A spécifique de la lysine (LSD1) également connue sous le nom de déméthylase 1A spécifique de la lysine (K) (KDM1A) est une protéine chez l'homme qui est codée par le gène KDM1A . Le LSD1 est une monoamine oxydase dépendante de la flavine , qui peut déméthyler les lysines mono- et diméthylées , en particulier l' histone 3, les lysines 4 et 9 (H3K4 et H3K9). Cette enzyme peut jouer un rôle critique dans l' embryogenèse et la différenciation tissu-spécifique , ainsi que dans la croissance des ovocytes. KDM1A a été la première histone déméthylase à être découverte, bien que plus de 30 aient été décrites.

Structure

Ce gène code pour une protéine nucléaire contenant un domaine SWIRM, un motif de liaison FAD et un domaine amine oxydase . Cette protéine est un composant de plusieurs complexes d' histone désacétylase , bien qu'elle fasse taire les gènes en fonctionnant comme une histone déméthylase.

Une fonction

La LSD1 (lysine-specific démethylase 1), également connue sous le nom de KDM1, est la première de plusieurs protéines lysine déméthylases découvertes. Grâce à une réaction oxydative dépendante des FAD, le LSD1 élimine spécifiquement l'histone H3K4me2 en H3K4me1 ou H3K4me0. Lors de la formation d'un complexe avec le récepteur des androgènes (et éventuellement d'autres récepteurs nucléaires d'hormones ), le LSD1 change ses substrats en H3K9me2. Il est maintenant connu que le complexe LSD1 médie un changement de modification d' histone coordonné par le biais d'activités enzymatiques ainsi que de lecteurs de modification d'histone dans le complexe.

La fonction du gène KDM1A peut être examinée efficacement par knockdown siRNA sur la base d'une validation indépendante.

Interactions

KDM1A possède de nombreux partenaires de liaison différents, qui peuvent être nécessaires à son activité de déméthylation. Dans la leucémie aiguë myéloïde (LAM), il a été définitivement démontré que GFI1B maintient une interaction avec KDM1A nécessaire à la prolifération de la maladie. Des preuves du rôle des interactions entre KDM1A et GSK3β nucléaire dans la promotion de la progression de certains cancers sont également présentes. Il a été découvert que des niveaux élevés de GSK3β nucléaire favorisent la liaison de KDM1A à la deubiquitinase, USP22, ce qui empêche la dégradation de KDM1A et provoque son accumulation à des niveaux plus élevés. L'accumulation de KDM1A a été corrélée à la progression tumorale dans certains cancers, notamment le glioblastome, la leucémie et l'ostéosarcome.

Signification clinique

KDM1A semble jouer un rôle important dans la « reprogrammation » épigénétique qui se produit lorsque le sperme et l'ovule se réunissent pour former un zygote. La suppression du gène de KDM1A peut avoir des effets sur la croissance et la différenciation des cellules souches embryonnaires . La suppression dans les embryons de souris est mortelle; les embryons ne progressent pas au-delà du jour 7.5. On pense également que KDM1A joue un rôle dans le cancer, car des résultats plus faibles peuvent être corrélés à une expression plus élevée de ce gène. Par conséquent, l'inhibition de KDM1A peut être un traitement possible pour le cancer. KDM1A a tendance à être surexprimé dans les cellules tumorales de certains cancers tels que les cancers de la vessie, du poumon et colorectal. La spécificité de la surexpression de KDM1A dans ces cancers crée le potentiel de traitements de thérapie moléculaire ciblés, grâce à l'utilisation d'ARNsi spécifiques à KDM1A.

Mutation

Des mutations de novo de KDM1A ont été rapportées chez trois patients, chacun avec des retards de développement que l'on pense être attribuables en partie aux mutations. Toutes les mutations documentées sont des substitutions faux-sens. L'une des familles touchées a créé un site Web public afin d'identifier d'autres cas.

Voir également

Les références

Liens externes

Cet article incorpore du texte de la National Library of Medicine des États-Unis , qui est dans le domaine public .