Néomura - Neomura
Neomura est un clade possible composé des deux domaines de vie des Archaea et Eukaryota . Le groupe a été nommé par Thomas Cavalier-Smith en 2002. Son nom signifie "nouveaux murs", reflétant son hypothèse selon laquelle il a évolué à partir de bactéries , et l'un des changements majeurs a été le remplacement des parois cellulaires du peptidoglycane par d'autres glycoprotéines . En août 2017, l'hypothèse du néomuran n'est pas acceptée par la plupart des travailleurs ; les phylogénies moléculaires suggèrent que les eucaryotes sont plus étroitement liés à un groupe d'archéens et ont évolué à partir d'eux, plutôt que de former un clade avec tous les archéens.
Morphologie
Considérés comme un clade, les Neomura sont un groupe très diversifié, contenant toutes les espèces multicellulaires, ainsi que toutes les espèces les plus extrêmophiles , mais ils partagent tous certaines caractéristiques moléculaires. Tous les néomurans ont des histones pour aider à l' empaquetage des chromosomes , et la plupart ont des introns . Tous utilisent la molécule de méthionine comme acide aminé initiateur de la synthèse des protéines (les bactéries utilisent la formylméthionine ). Enfin, tous les néomurans utilisent plusieurs sortes d' ARN polymérase , alors que les bactéries n'en utilisent qu'une.
Phylogénie
Il existe plusieurs hypothèses sur les relations phylogénétiques entre les archéens et les eucaryotes.
Vue à trois domaines
Lorsque Carl Woese a publié pour la première fois son système à trois domaines en 1990, on pensait que les domaines Bacteria , Archaea et Eukaryota étaient également anciens et également liés à l'arbre de vie. Cependant, certaines preuves ont commencé à suggérer qu'Eukaryota et Archaea étaient plus étroitement liés l'un à l'autre que l'un ou l'autre ne l'était aux bactéries. Ces preuves comprenaient l'utilisation courante des cholestérols et des protéasomes , qui sont des molécules complexes que l'on ne trouve pas dans la plupart des bactéries, ce qui conduit à conclure que la racine de la vie se situe entre les bactéries d'une part, et les archées et les eucaryotes combinés d'autre part, c'est-à-dire qu'il y a étaient deux branches primaires de la vie postérieures à la LUCA – les bactéries et Neomura (pas alors appelées par ce nom).
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Le scénario des « trois domaines primaires » (3D) était l'une des deux hypothèses considérées comme plausibles dans une revue de 2010 sur l'origine des eucaryotes.
Vue clade dérivée
Dans un article de 2002, et des articles ultérieurs, Thomas Cavalier-Smith et ses collègues ont émis l'hypothèse que Neomura était un clade profondément imbriqué avec Eubacteria avec Actinobacteria comme groupe frère. Il a écrit : « Les eucaryotes et les archébactéries forment le clade neomura et sont des sœurs, comme le montrent de manière décisive les gènes fragmentés uniquement dans les archébactéries et par de nombreux arbres de séquence. ne tiennent pas compte des nombreuses caractéristiques partagées spécifiquement par les eucaryotes et les actinobactéries. »
Ceux-ci incluent la présence de cholestérols et de protéasomes dans Actinobacteria ainsi que dans Neomura. Il est peu probable que les caractéristiques de cette complexité évoluent plus d'une fois dans des branches distinctes, donc soit il y a eu un transfert horizontal de ces deux voies, soit Neomura a évolué à partir de cette branche particulière de l'arbre bactérien.
LUCA |
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Vue deux domaines
Dès 2010, le principal concurrent du scénario des trois domaines pour l'origine des eucaryotes était le scénario des « deux domaines » (2D), dans lequel les eucaryotes ont émergé de l'intérieur des archées. La découverte d'un groupe majeur au sein des Archaea, Lokiarchaeota , auquel les eucaryotes sont génétiquement plus similaires qu'aux autres archéens, n'est pas compatible avec l'hypothèse de Neomura. Au lieu de cela, il soutient l'hypothèse que les eucaryotes ont émergé au sein d'un groupe d'archéens :
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Archées
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Une étude de 2016 utilisant 16 protéines ribosomiques universellement conservées prend en charge la vue 2D. Sa "nouvelle vision de l'arbre de vie" montre les eucaryotes comme un petit groupe niché au sein des Archaea, en particulier au sein du superphylum TACK. Cependant, l'origine des eucaryotes reste non résolue, et les scénarios à deux et trois domaines restent des hypothèses viables.
Voir également
Les références
Lectures complémentaires
- Cavalier-Smith T (1987). « L'origine des cellules eucaryotes et archéobactériennes ». Anne. NY Acad. Sci . 503 : 17-54. doi : 10.1111/j.1749-6632.1987.tb40596.x . PMID 3113314 . S2CID 38405158 .
- Cavalier-Smith T (janvier 2002). "L'origine néomurienne des archaebactéries, la racine négiobactérienne de l'arbre universel et la mégaclassification bactérienne" . Int. J. Syst. Évol. Microbiole . 52 (Part 1) : 7-76. doi : 10.1099/00207713-52-1-7 . PMID 11837318 .
- Cavalier-Smith T (2006). "Enraciner l'arbre de vie par des analyses de transition" . Biol. Directement . 1 : 19. doi : 10.1186/1745-6150-1-19 . PMC 1586193 . PMID 16834776 .
- Skophammer RG, Servin JA, Herbold CW, Lake JA (août 2007). "Preuve d'une racine eubactérienne à Gram positif de l'arbre de vie" . Mol. Biol. Évol . 24 (8) : 1761–8. doi : 10.1093/molbev/msm096 . PMID 17513883 .
- Cox, juge en chef ; Foster, PG; Hirt, RP ; Harris, RS; Embley, TM (10 décembre 2008). « L'origine archéobactérienne des eucaryotes » (PDF) . Actes de l'Académie nationale des sciences . 105 (51) : 20356–20361. doi : 10.1073/pnas.0810647105 . PMC 2629343 . PMID 19073919 .
- Cavalier-Smith, T. (2 septembre 2014). "La révolution néomurienne et l'origine phagotrophe des eucaryotes et des cils à la lumière de la coévolution intracellulaire et d'un arbre de vie révisé" . Cold Spring Harbor Perspectives en biologie . 6 (9) : a016006. doi : 10.1101/cshperspect.a016006 . PMC 4142966 . PMID 25183828 .