Imbrication - Nestedness

L'imbrication est une mesure de la structure dans un système écologique , généralement appliquée aux systèmes espèces-sites (décrivant la distribution des espèces à travers les emplacements), ou aux réseaux d'interactions espèces-espèces (décrivant les interactions entre espèces, généralement sous forme de réseaux bipartites tels que les hôtes-parasites , plantes-pollinisateurs, etc.).

Un système (généralement représenté sous forme de matrice) est dit imbriqué lorsque les éléments qui contiennent quelques éléments (emplacements avec peu d'espèces, espèces avec peu d'interactions) ont un sous-ensemble des éléments d'éléments avec plus d'éléments. Imaginez une série d'îles classées par leur distance du continent. Si le continent a toutes les espèces, la première île a un sous-ensemble des espèces du continent, la deuxième île a un sous-ensemble des espèces de la première île, et ainsi de suite, alors ce système est parfaitement imbriqué.

Mesures d'imbrication

Une unité de mesure de l'imbrication est la « température » d' un système proposée par Atmar et Patterson en 1993. Elle mesure l'ordre dans lequel les extinctions d'espèces se produiraient dans le système (ou de l'autre côté - l'ordre de colonisation d'un système). Plus le système est « froid », plus l'ordre d'extinction serait fixé. Dans un système plus chaud, les extinctions prendront un ordre plus aléatoire. Les températures vont de 0°, le plus froid et absolument fixe, à 100° absolument aléatoire.

Pour diverses raisons, le calculateur de température d'imbrication n'est pas mathématiquement satisfaisant (pas de solution unique, pas assez prudent). Un logiciel (BINMATNEST) est disponible auprès des auteurs sur demande et auprès du Journal of Biogeography pour corriger ces déficits. De plus, ANINHADO résout les problèmes de grande taille de matrice et de traitement d'un grand nombre de matrices randomisées ; en outre, il implémente plusieurs modèles nuls pour estimer l'importance de l'imbrication.

Bastolla et al. introduit une mesure simple d'imbrication basée sur le nombre de voisins communs pour chaque paire de nœuds. Ils soutiennent que cela peut aider à réduire la concurrence effective entre les nœuds dans certaines situations. Par exemple, deux espèces d'insectes pourraient « s'entraider » en pollinisant le même sous-ensemble de plantes, réduisant ainsi la mesure dans laquelle elles se nuisent mutuellement. Les auteurs suggèrent que cet effet est à l'origine d'une corrélation entre l'imbrication et la diversité dans les écosystèmes plantes-pollinisateurs. Cependant, Johnson et al. ont montré que cette mesure ne rendait pas, en effet, bien compte de l'effet recherché. Ces auteurs proposent une version affinée de la mesure et montrent ensuite comment certaines propriétés du réseau affectent l'imbrication.

Les références

Logiciel