Oryzomys -Oryzomys

Oryzomys Gamme temporelle : Rancholabréen (300 000 ans avant le présent) – présent
Rat de riz des marais ( Oryzomys palustris )
Classement scientifique
Royaume:	Animalia
Phylum:	Accords
Classer:	Mammifères
Commander:	Rodentia
Famille:	Cricetidae
Sous-famille :	Sigmodontinae
Tribu:	Oryzomyini
Genre:	Oryzomys Baird , 1857
Espèce type
Mus palustris Harlan , 1837
Espèce
Oryzomys albiventer Oryzomys couesi Oryzomys dimidiatus Oryzomys gorgasi Oryzomys palustris Péninsule d'Oryzomys † Oryzomys antillarum † Oryzomys nelsoni
Répartition d' Oryzomys : bleu foncé, rat des marais ( O. palustris ); bleu clair, ancienne distribution du rat des marais ; rouge, O. couesi ; rose, O. albiventer ; vert foncé, O. péninsulee ; orange, O. nelsoni ; vert clair, O. antillarum ; jaune, O. dimidiatus et O. couesi ; brun, O. gorgasi .
Synonymes
Hesperomys (Oryzomys) Baird, 1857 Oryzomys : Allen, 1890 Micronectomies Hershkovitz , 1948

Oryzomys est un genre derongeurs semi - aquatiques de la tribu Oryzomyini vivant dans le sud de l'Amérique du Nord et l'extrême nord de l'Amérique du Sud. Il comprend huit espèces , dont deux—le rat des marais ( O. palustris ) des États-Unis et O. couesi du Mexique et d'Amérique centrale—sont répandus; les six autres ont des distributions plus restreintes. Les espèces ont eu des histoires taxonomiques mouvementées, et la plupart des espèces étaient autrefois incluses dans le rat du riz des marais; d'autres espèces pourraient être reconnues à l'avenir. Le nom Oryzomys a été créé en 1857 par Spencer Fullerton Baird pour le rat du riz des marais et a rapidement été appliqué à plus d'une centaine d'espèces de rongeurs américains. Par la suite, le genre est progressivement devenu plus étroitement défini jusqu'à ce que son contenu actuel soit établi en 2006, lorsque dix nouveaux genres ont été établis pour des espèces précédemment placées dans Oryzomys .

Les espèces d' Oryzomys sont des rats de taille moyenne avec une fourrure longue et grossière. Les parties supérieures sont grises à rougeâtres et les parties inférieures blanches à chamois . Les animaux ont des pattes larges avec des touffes de poils unguéales réduites ou absentes autour des griffes et, au moins chez certaines espèces, avec une sangle entre les orteils . Le rostre (partie antérieure du crâne) est large et la boîte crânienne est haute. Le rat des marais et O. couesi ont tous deux 56  chromosomes , n'ont pas de vésicule biliaire et ont un pénis complexe (comme c'est le cas chez les Sigmodontinae) avec quelques traits qui sont rares chez les oryzomyines ; ces caractéristiques sont inconnues chez les autres espèces de ce genre.

L' habitat comprend divers types de zones humides, telles que des lacs, des marais et des rivières. Les espèces d' Oryzomys nagent bien, sont actives la nuit et mangent à la fois des aliments végétaux et animaux. Ils construisent des nids tissés de végétation. Après une période de gestation de 21 à 28 jours, environ quatre jeunes naissent. Les espèces d' Oryzomys sont infectées par de nombreux parasites et sont porteuses d'au moins trois hantavirus , dont un ( virus Bayou ) infecte également l'homme. Deux, peut-être trois espèces ont disparu au cours des deux derniers siècles et au moins une autre est en voie de disparition, mais le rat du riz des marais et O. couesi ne sont pas menacés.

Taxonomie

Oryzomys est l'un des quelque trente genres de la tribu Oryzomyini , un groupe diversifié de plus d'une centaine d'espèces, dont beaucoup étaient autrefois également incluses dans Oryzomys . Oryzomyini est l'une des nombreuses tribus de la sous - famille des Sigmodontinae de la famille des Cricetidae , qui comprend des centaines d'autres espèces de petits rongeurs principalement, réparties principalement dans les Amériques et en Eurasie.

Au sein d'Oryzomyini, une analyse phylogénétique de 2006 par Marcelo Weksler qui a utilisé à la fois des données morphologiques et de séquences d'ADN a trouvé des preuves qu'Oryzomys est le plus étroitement lié à un groupe comprenant Holochilus , Lundomys et Pseudoryzomys . Bien que des analyses basées sur des données morphologiques et combinées aient soutenu cette relation, les séquences du gène Rbp3 à elles seules ont plutôt placé Oryzomys parmi un groupe comprenant Nectomys , Sigmodontomys et quelques autres genres. Dans toutes les analyses, Oryzomys est apparu dans le clade D d'Oryzomyini. La relation entre Oryzomys et le groupe Holochilus était soutenue par cinq synapomorphies (caractères dérivés partagés) : absence ou réduction des coussinets hypothénar et interdigital ; réduction des touffes unguéales de poils entourant les griffes; ayant le bord arrière de la plaque zygomatique du crâne au même niveau que l'avant de la première molaire supérieure ; et l' antérocône (cuspide antérieure) de la première molaire supérieure divisée par une fossette antéromédiane . Les trois premiers sont des adaptations au mode de vie semi - aquatique qu'Oryzomys et les membres du groupe Holochilus partagent, et peuvent donc être des exemples d' évolution convergente .

Circonscription

Le nom Oryzomys a été introduit en 1857 par Spencer Fullerton Baird pour désigner le rat des marais (maintenant Oryzomys palustris ) de l'est des États-Unis, qui avait été décrit pour la première fois vingt ans plus tôt par Richard Harlan . Le nom combine le grec oryza "riz" et mys "souris" et fait référence aux habitudes alimentaires du rat des marais. Baird a placé Oryzomys comme un sous - genre du genre aujourd'hui disparu Hesperomys et n'y a inclus que le rat des marais, une classification qui a été suivie par Elliott Coues en 1874 et 1877. En 1890, Oryzomys a été élevé au rang de générique, et au cours des années suivantes de nombreuses espèces supplémentaires lui ont été attribuées, dont beaucoup ont rapidement été déplacées vers des genres séparés. Dans le Catalogus Mammalium de 1898 , Édouard Louis Trouessart a répertorié 67 espèces d' Oryzomys , dont certaines sont maintenant classées dans Calomys , Necromys , Thomasomys et d'autres genres sans rapport avec Oryzomys . Certains des nouveaux genres proposés ont rapidement été repris dans Oryzomys , et dans The Families and Genra of Living Rodents (1941), John Ellerman a répertorié Microryzomys , Oligoryzomys , Melanomys , Nesoryzomys et Oecomys comme synonymes d' Oryzomys et y a inclus environ 127 espèces. . En 1948, Philip Hershkovitz a suggéré que d'autres oryzomyines comme Nectomys et Megalomys pourraient également être incluses dans Oryzomys , et Clayton Ray a suivi cette suggestion en 1962.

La classification de Hershkovitz et Ray n'a jamais été largement suivie, et à partir de 1976, les auteurs ont commencé à réintégrer certains des autres groupes regroupés dans Oryzomys en tant que genres distincts. Le genre a été réduit à 43 espèces (sur 110 chez Oryzomyini) dans la troisième édition (2005) de Mammal Species of the World , mais ce n'était toujours pas un groupe naturel et monophylétique ; au contraire, il a réuni principalement ces oryzomyines qui n'avaient pas les spécialisations remarquables d'autres genres. En 2006, l'analyse phylogénétique complète de Marcelo Weksler a produit une preuve supplémentaire que le genre était polyphylétique , car les espèces d' Oryzomys étaient dispersées dans tout l'arbre d'oryzomyine. Il a proposé que onze nouveaux genres soient créés pour accueillir les espèces qui n'étaient pas étroitement liées à l' espèce type d' Oryzomys , le rat des marais ; il a envisagé d'autres options qui nécessiteraient moins de nouveaux genres, mais a fait valoir que cela entraînerait des groupes au niveau du genre moins significatifs chez Oryzomyini. Plus tard dans la même année, Weksler, Percequillo et Voss a créé dix nouvelles générations Aegialomys , Cerradomys , eremoryzomys polius , Euryoryzomys , Hylaeamys , Mindomys , Nephelomys , Oreoryzomys , Sooretamys et Transandinomys -pour les espèces autrefois placées dans Oryzomys et placé six autres espèces apparentées à "Oryzomys" alfaroi dans Handleyomys en attendant la description de nouveaux genres pour eux. Ils n'ont laissé que cinq espèces dans Oryzomys , qui était maintenant finalement un groupe naturel et monophylétique. En raison des travaux taxonomiques ultérieurs, le nombre d'espèces a depuis augmenté à au moins huit.

Quelques problèmes subsistent : ? Oryzomys pliocaenicus , un fossile du Miocène du Kansas, est d'identité incertaine mais peut appartenir à Bensonomys , et des fossiles du Miocène de l'Oregon et du Pliocène du Nouveau-Mexique ont également été attribués à Oryzomys , mais probablement à tort. Un Oryzomys possible a été signalé dans l' Irvingtonien (Pléistocène) de la Saskatchewan .

Espèce

Dessin d' Oryzomys molestus , maintenant synonyme d' Oryzomys albiventer

Le concept actuel d' Oryzomys dérive du groupe palustris-mexicanus reconnu au sein d'un genre Oryzomys beaucoup plus vaste par Merriam (1901) et du groupe palustris proposé par Goldman (1918). Merriam a reconnu 21 espèces au sein de son groupe, mais Goldman les a regroupées en huit : le rat des marais aux États-Unis, O. couesi dans l'extrême sud du Texas, au Mexique et en Amérique centrale, et six autres avec de petites distributions. En 1960, Raymond Hall a réuni O. couesi et le rat des marais en une seule espèce, Oryzomys palustris , et par la suite, d'autres formes localisées ont également été incluses dans O. palustris . Hershkovitz a décrit une autre espèce du groupe, O. gorgasi de Colombie, en 1970 et l'année suivante, il a noté que O. dimidiatus , précédemment classé comme Nectomys , était similaire à O. palustris . Après 1979, le rat des marais et O. couesi ont de nouveau été considérés comme séparés à la suite de travaux ultérieurs au Texas, où leurs aires de répartition se rejoignent. En examinant O. gorgasi en 2001, J. Sánchez H. et ses collègues ont redéfini et caractérisé le groupe O. palustris et répertorié O. couesi , O. dimidiatus , O. gorgasi et le rat des marais comme ses membres ; Guy Musser et Michael Carleton dans la troisième édition de 2005 de Mammal Species of the World ont également répertorié O. nelsoni de l' île María Madre dans l'ouest du Mexique.

En 2006, Weksler et ses collègues ont suivi la définition de 2001 de Sánchez et d'autres pour le genre restreint Oryzomys , mais ont ajouté O. antillarum de la Jamaïque en tant qu'espèce. Carleton et Joaquin Arroyo-Cabrales ont examiné Oryzomys de l'ouest du Mexique en 2009 et, dans ce contexte, ont fourni un diagnostic approfondi d' Oryzomys . Ils ont reconnu huit espèces : les six mentionnées précédemment plus O. albiventer et O. Peninsulae . Toujours en 2009, Robert Voss et Weksler ont identifié le sous- fossile Oryzomys curasoae de Curaçao comme une population insulaire d' O . gorgasi . L'année suivante, Delton Hanson et ses collègues ont publié une étude utilisant les données de séquence d'ADN du cytochrome b , la protéine de liaison aux rétinoïdes interphotorécepteurs et les gènes de l' alcool déshydrogénase 1 pour évaluer les relations au sein d' Oryzomys . Ils ont recommandé que le rat des marais soit divisé en deux espèces et que O. couesi soit divisé en quatre espèces sur la base de la divergence de séquence observée et d'autres données.

Merriam a divisé son groupe palustris-mexicanus en deux "séries" selon la couleur des parties inférieures (blanc ou fauve ). Goldman a divisé son groupe palustris en deux « sections » : une section couesi avec O. couesi et six espèces apparentées, et une section palustris avec O. palustris uniquement. Il a noté que ce dernier différait du premier par une fourrure généralement plus foncée, plus brunâtre, plus longue et des vacuités sphénopalatines plus grandes (ouvertures dans la fosse mésoptérygoïde , l'espace derrière l'extrémité du palais ). Comme l'analyse de 2006 de Weksler n'incluait que O. couesi et le rat des marais parmi les espèces d' Oryzomys au sens strict, il n'a pas pu tester ces groupes. Carleton et Arroyo-Cabrales étaient d'accord avec la division de Goldman, énumérant des caractères supplémentaires, et ont noté que le groupe palustris peut être plus adapté semi-aquatiquement que les membres du groupe couesi . Chez ces derniers, la fourrure est généralement brun rougeâtre, par opposition au brun grisâtre dans le groupe palustris . Les membres du groupe couesi ont des vacuités sphénopalatines plus petites et un foramen sphénopalatin plus petit , un foramen (ouverture) sur le côté du crâne au-dessus des molaires, et un cingulum antérolabial plus développé sur la troisième molaire inférieure (une crête à l'avant de la dent). Le coussinet hypothénar de l'arrière-pied, situé sur la plante des pieds loin des doigts, est présent dans le groupe couesi , mais absent dans le groupe palustris . La sangle interdigitée peut être plus développée dans le groupe palustris . En utilisant des données morphologiques, Voss et Weksler ont trouvé une relation plus étroite entre O. couesi et O. gorgasi à l'exclusion d' O. palustris , mais avec une faible confiance. Les données de séquence d'ADN de Hanson et de ses collègues confirmaient une séparation profonde entre les groupes palustris et couesi , mais un échantillon du Costa Rica (attribué à O. couesi ) était à peu près aussi éloigné des deux groupes qu'ils l'étaient l'un de l'autre.

Le genre comprend actuellement les espèces suivantes :

La description

Oryzomys contient des rongeurs oryzomyines de taille moyenne, spécialisés dans le milieu semi-aquatique. Ils ont une fourrure longue et rugueuse qui est grisâtre à rougeâtre sur les parties supérieures et blanche à chamois sur les parties inférieures. Le rat des marais ressemble superficiellement aux espèces introduites rat noir et rat brun , mais présente des différences de couleur plus importantes entre les parties supérieure et inférieure. Les vibrisses (moustaches) sont courtes et les oreilles sont petites et bien poilues. La queue est généralement aussi longue ou plus longue que la tête et le corps et est à poils clairsemés, mais les poils du côté inférieur sont plus longs que ceux du dessus. Les femelles ont huit mamelles , comme dans la plupart des oryzomyines. Les pattes postérieures sont larges et ont les premier et cinquième chiffres nettement plus courts que les trois du milieu. La face supérieure est poilue, mais la face inférieure est nue et couverte de petites irrégularités ( squames ). Les coussinets sont généralement peu développés, de même que les touffes unguéales. Une sangle interdigitée peut être présente, mais son développement est variable au sein du genre.

Le caryotype a été enregistré dans diverses populations de rat des marais et d' O. couesi et est apparemment stable au sein du genre à 56  chromosomes , le nombre fondamental de bras chromosomiques allant de 56 à 60 (2n = 56, FN = 56-60 ). Chez les deux espèces, l' estomac présente le motif caractéristique des sigmodontines ( uniloculaire -hémiglandulaire) : il n'est pas divisé en deux chambres par une incisura angularis et la partie antérieure ( antre ) est recouverte d'un épithélium glandulaire . De plus, la vésicule biliaire est absente, une synapomorphie d'Oryzomyini.

Crâne holotypique d' Oryzomys antillarum , vu du dessus (A), du dessous (B) et de la gauche (C)

Les espèces d' Oryzomys ont un grand crâne avec un rostre court et une boîte crânienne haute . La région interorbitaire , située entre les yeux, est la plus étroite vers l'avant et est flanquée de perles bien développées à ses marges. La plaque zygomatique est large et présente une encoche zygomatique bien développée à l'avant. L'arcade zygomatique est robuste et contient un os jugal petit mais distinct . L' os interpariétal , partie du toit de la boîte crânienne, est étroit et court ; son étroitesse est une synapomorphie pour O. couesi plus le rat des marais selon l'analyse de Weksler. Les foramens incisifs sont longs, avec leur marge postérieure à l'avant des premières molaires ou plus en arrière. Le palais est également long, s'étendant au-delà du bord arrière de l' os maxillaire et est perforé près des troisièmes molaires par des fosses palatines postéro - latérales bien développées . Il n'y a pas de jambe de force alisphénoïde , une extension de l' os alisphénoïde qui, dans d'autres oryzomyines, sépare deux foramens dans le crâne. Les bulles auditives sont grandes. L'état des artères de la tête est très dérivé . Au niveau de la mandibule (mâchoire inférieure), l' apophyse coronoïde , apophyse située à l'arrière, est bien développée et l' apophyse capsulaire , un soulèvement de l'os mandibulaire abritant la racine de l'incisive inférieure, est bien visible.

Comme d'habitude chez les oryzomyines, les molaires sont des pentalophodontes (ont les mésolophes et mésolophides , crêtes accessoires, bien développées) et des bunodontes , avec les cuspides plus hautes que les crêtes de liaison. Les cuspides sur les molaires supérieures sont disposées en deux séries longitudinales, et non en trois comme chez les rats noirs et bruns. Les cuspides antérieures de la première molaire supérieure et inférieure (antérocône et antéroconide , respectivement) sont larges et ne sont pas complètement divisées par un flexus ou flexid antéromédien . Derrière l'antérocône, l' antéroloph (une crête plus petite) est complet et séparé de l'antérocône. Sur les deuxième et troisième molaires inférieures, l' antérolophide (une crête sur le coin avant interne) est présent, une synapomorphie putative du genre. Les premières molaires ont de petites racines supplémentaires en plus des principales, de sorte que la première molaire supérieure en a quatre et la inférieure trois ou quatre racines.

Comme c'est le cas chez Sigmodontinae, le rat des marais et O. couesi ont un pénis complexe, le baculum (os du pénis) présentant de grandes protubérances sur les côtés. La surface externe du pénis est principalement recouverte de petites épines , mais il y a une large bande de tissu non épineux. La papille (projection en forme de mamelon) sur la face dorsale (supérieure) du pénis est recouverte de petites épines, un caractère que ces deux espèces ne partagent qu'avec Oligoryzomys parmi les oryzomyines examinées. Sur le processus urétral , situé dans le cratère à l'extrémité du pénis, un processus charnu (le lobule sous-apical ) est présent ; il est absent chez toutes les autres oryzomyines à pènes étudiées, à l'exception de Holochilus brasiliensis . Les deux traits sont récupérés sous forme de synapomorphies d' O. couesi et du rat des marais dans l'analyse de Weksler.

Distribution, écologie et comportement

Oryzomys couesi (ci-dessus) et Tylomys panamensis (ci-dessous)

L'aire de répartition d' Oryzomys s'étend du New Jersey à l'est des États-Unis en passant par le Mexique et l'Amérique centrale jusqu'au nord-ouest de la Colombie et à l'est jusqu'au nord-ouest du Venezuela et Curaçao. Les espèces d' Oryzomys vivent généralement dans des habitats humides tels que les marais, les ruisseaux et les mangroves , mais le rat des marais et O. couesi sont également parfois rencontrés dans des habitats plus secs. Ils se produisent ou se sont produits sur de nombreuses îles du plateau continental et une île océanique , la Jamaïque; leur aptitude à coloniser les îles peut être due à leur association étroite avec l'eau et à leur présence fréquente dans les zones humides côtières. Les fossiles les plus anciens datent du Rancholabréen des États-Unis, il y a environ 300 000 ans ; bien qu'il y ait eu quelques enregistrements nord-américains antérieurs, ceux-ci ne sont en fait pas liés à Oryzomys ou même Oryzomyini. Les oryzomyines ont probablement évolué en Amérique du Sud à l'est des Andes; on pense que la présence d' Oryzomys en Amérique centrale et dans d'autres régions transandines est le résultat de l'une des nombreuses invasions indépendantes de cette région par les oryzomyines. Alternativement, Oryzomys peut avoir évolué à partir du Pliocène nord-américain Jacobsomys . O. antillarum peut avoir atteint la Jamaïque au cours de la dernière période glaciaire alors que le niveau de la mer était bas.

Le comportement est connu principalement pour le rat des marais et O. couesi , avec quelques données éparses pour les autres espèces. Les Oryzomys sont semi-aquatiques, passent beaucoup de temps dans l'eau et vivent par ailleurs principalement sur le sol ; le rat des marais et O. couesi sont tous deux connus pour être d'excellents nageurs et fuiront dans l'eau lorsqu'ils sont dérangés. Les deux sont également actifs pendant la nuit et construisent des nids de végétation entrelacée, qui peuvent être suspendus au-dessus de l'eau. La reproduction peut avoir lieu tout au long de l'année chez les deux espèces, mais on sait qu'elle varie selon les saisons chez le rat des marais. Dans les deux cas, la gestation dure environ 21 à 28 jours et la taille de la portée est généralement de un à sept, en moyenne de trois à cinq. Les jeunes rats du riz des marais et O. couesi deviennent actifs sur le plan de la reproduction vers l'âge de 50 jours.

Le rat des marais, O. couesi et O. gorgasi sont connus pour être omnivores , mangeant à la fois des matières végétales et animales. Ils mangent à la fois des graines et des parties de plantes vertes et consomment une variété d'animaux, notamment des insectes , des crustacés et bien d'autres. La chouette effraie des clochers ( Tyto alba ) est un prédateur majeur du rat des marais et des restes de O. antillarum , O. couesi et O. gorgasi ont été trouvés dans des dépôts de boulettes de chouette . On sait que plusieurs autres animaux s'attaquent à Oryzomys . Une variété de parasites est connue chez O. couesi et le rat des marais et deux nématodes parasites ont été trouvés chez O. gorgasi .

Interactions humaines

Deux espèces d' Oryzomys , O. antillarum et O. nelsoni , se sont éteintes depuis le 19e siècle, et une troisième, O. Peninsulae , est peu susceptible d'exister encore. Leur extinction peut avoir été causée par la destruction de l'habitat et par des espèces introduites telles que la petite mangouste asiatique et le rat brun et noir. Ces mêmes causes peuvent menacer O. gorgasi , que la Liste rouge de l' UICN considère comme « En danger ». O. albiventer a été affecté par l'altération humaine de son habitat, mais il survit probablement encore. En revanche, les espèces répandues, le rat des marais et O. couesi , sont communes et ne posent aucun problème de conservation - en effet, les deux ont été considérés comme un ravageur - mais certaines populations sont menacées. Comme ces deux espèces, O. dimidiatus est classé « Préoccupation mineure » par la Liste rouge.

Le rat des marais est le réservoir naturel du virus Bayou , la deuxième cause de syndrome pulmonaire à hantavirus aux États-Unis. Deux autres hantavirus, le virus Catacamas et le virus Playa de Oro , sont présents chez O. couesi au Honduras et dans l'ouest du Mexique, respectivement, mais ne sont pas connus pour infecter les humains.

Remarques

Les références

Ouvrages cités

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