Séquençage par hybridation - Sequencing by hybridization
Le séquençage par hybridation est une classe de méthodes pour déterminer l'ordre dans lequel les nucléotides apparaissent sur un brin d' ADN . Généralement utilisé pour rechercher de petits changements par rapport à une séquence d'ADN connue . La liaison d'un brin d'ADN à son brin complémentaire dans la double hélice d'ADN (connue sous le nom d' hybridation ) est sensible même à des mésappariements à une seule base lorsque la région hybride est courte ou si des protéines de détection de mésappariement spécialisées sont présentes. Ceci est exploité de diverses manières, notamment via des puces à ADN ou des puces à ADN avec des milliers à des milliards d' oligonucléotides synthétiques trouvés dans un génome d'intérêt plus de nombreuses variations connues ou même toutes les variations possibles à une seule base.
Le type de séquençage par hybridation décrit ci-dessus a été largement déplacé par d'autres méthodes, y compris le séquençage par synthèse et le séquençage par ligature (ainsi que les méthodes à base de pores). Cependant, l'hybridation d'oligonucléotides est encore utilisée dans certains schémas de séquençage, y compris le séquençage à base de pores assisté par hybridation et l'hybridation réversible.
Exemples de systèmes commerciaux
- Affymetrix (véritable séquençage par hybridation)
- NABsys (séquençage basé sur les pores assisté par hybridation)
- Complete Genomics Inc. (hybridation réversible de sondes qui appellent une seule base à chaque hybridation)