Variation somaclonale - Somaclonal variation

La variation somaclonale est la variation observée chez les plantes produites par culture de tissus végétaux . Les réarrangements chromosomiques sont une source importante de cette variation. Le terme variation somaclonale est un phénomène d'occurrence taxonomique large, signalé pour des espèces de différents niveaux de ploïdie, et pour les plantes croisées et consanguines, multipliées par voie végétative et par graines, et cultivées et non cultivées. Les caractères touchés comprennent à la fois des traits qualitatifs et quantitatifs.

La variation somaclonale n'est pas limitée aux plantes régénérées à partir de callosités , mais elle est particulièrement fréquente . Les variations peuvent être génotypiques ou phénotypiques , qui dans ce dernier cas peuvent être d'origine génétique ou épigénétique . Les altérations génétiques typiques sont: les changements dans le nombre de chromosomes ( polyploïdie et aneuploïdie ), la structure chromosomique ( translocations , délétions , insertions et duplications ) et la séquence d'ADN (mutations de base). Un événement typique lié à l'épigénétique serait la méthylation du gène .

Si aucun changement visuel et morphogénique n'est apparent, d'autres procédures de criblage des plantes doivent être appliquées. La variation somaclonale présente à la fois des avantages et des inconvénients. Le phénomène de forte variabilité chez les individus issus de cultures de cellules végétales ou de pousses adventives a été nommé variation somaclonale.

Avantages

Le principal avantage probable de la variation somaclonale est l'amélioration des plantes / cultures. La variation somaclonale conduit à la création d'une variabilité génétique supplémentaire. Les caractéristiques pour lesquelles les mutants somaclonaux peuvent être enrichis au cours de la culture in vitro comprennent la résistance aux maladies, les pathotoxines , les herbicides, la concentration élevée en sel, la toxicité minérale et la tolérance au stress environnemental ou chimique, ainsi qu'à l'augmentation de la production de métabolites secondaires.

Convient pour la reproduction de nouvelles espèces.

Désavantages

Un sérieux inconvénient de la variation somaclonale se produit dans les opérations qui nécessitent une uniformité clonale, comme dans les industries de l'horticulture et de la sylviculture où la culture tissulaire est utilisée pour la propagation rapide des génotypes d'élite.

  • Conduit parfois à des résultats indésirables
  • Les variantes sélectionnées sont aléatoires et génétiquement instables
  • Exiger des essais sur le terrain approfondis et prolongés
  • Ne convient pas aux caractères agronomiques complexes tels que le rendement, la qualité, etc.
  • Peut développer des variantes avec des effets pléiotropes.

Réduire la variation somaclonale

Différentes étapes peuvent être utilisées pour réduire la variation somaclonale. Il est bien connu que l'augmentation du nombre de sous-cultures augmente la probabilité de variation somaclonale, de sorte que le nombre de sous-cultures dans les protocoles de micropropagation doit être réduit au minimum. La réinitiation régulière des clones à partir de nouveaux explants pourrait réduire la variabilité au fil du temps. Une autre façon de réduire la variation somaclonale est d'éviter le 2,4-D dans le milieu de culture, car cette hormone est connue pour introduire une variation.

Voir également

Les références