Stephen J. O'Brien - Stephen J. O'Brien
Stephen J. O'Brien (né en 1944) est un généticien américain. Il est connu pour ses contributions à la recherche en génomique comparative , virologie , épidémiologie génétique , systématique des mammifères et conservation des espèces. Membre de l' Académie nationale des sciences et membre étranger de l' Académie russe des sciences . Auteur ou co-auteur de plus de 850 articles scientifiques et éditeur de quatorze volumes.
De 1986 à 2011, O'Brien a été chef du laboratoire de la diversité génomique au National Cancer Institute (NCI), National Institutes of Health (NIH). En décembre 2011, il a créé le Centre Theodosius Dobzhansky pour la bioinformatique du génome (du nom de Theodosius Dobzhansky ) à l'Université d'État de Saint-Pétersbourg , en Russie, en tant que directeur scientifique .
En janvier 2013, il a rejoint la Faculté en tant que professeur au Centre océanographique de l'Université Nova Southeastern , Ft Lauderdale en Floride.
Depuis novembre 2019, O'Brien est professeur au Centre de diversité génomique de l'Université ITMO , Saint-Pétersbourg, Russie.
Carrière
O'Brien a obtenu son BS en biologie en 1966 du St. Francis College, qui lui a décerné un Distinguished Alumni Award en 1994.
En 1971, il a obtenu un doctorat. en génétique de l'Université Cornell qui lui a décerné le titre de «Andrew Dixon White Endowed Professor at Large» en 1998. À Cornell, il a élargi la discipline naissante de la génétique biochimique, en développant les cartes gène-enzyme de Drosophila melanogaster . Sa cartographie biochimique stimulerait son édition de six éditions de Genetic Maps: Locus Maps of Complex Genomes (1980-1993) (Cold Spring Harbor Laboratory Publications), des recueils internationaux non abrégés de cartes génétiques de plantes, d'animaux, de bactéries et de virus qui étaient le prélude à la bases de données de cartographie génique NCBI en ligne des séquences d'ADN du génome entier des espèces.
En 1983, lui et ses collaborateurs découvrent la remarquable uniformité génétique du guépard africain , prélude à une nouvelle discipline de conservation génétique . Au cours de trois décennies d'études menées auprès de ses étudiants et collègues, il a par la suite rapporté plus de 800 publications, dont beaucoup dans les revues scientifiques les mieux notées, sur la façon dont la génétique pourrait informer et faciliter les mesures de gestion des espèces en voie de disparition. Celles-ci comprenaient l'identification de nouvelles espèces d'éléphants, de léopards nébuleux et d'orangs-outans, ainsi que des études génétiques détaillées sur les espèces sauvages menacées, notamment les guépards , les lions , les tigres , les pandas géants , les léopards , les pumas, les jaguars , les koalas , les solénodons et les baleines à bosse .
En 1982, l'équipe d'O'Brien au NIH a publié une carte génétique complète du chat domestique comme article de couverture dans Science et a comparé l'organisation du génome du chat à l'homme, à la souris et à d'autres espèces démontrant une conservation extrême de la synténie chromosomique (ordre des gènes homologues) entre disparates espèces de mammifères. Ces études et les études ultérieures ont établi le domaine de la génomique comparative . Cette discipline reste aujourd'hui une référence pour interpréter l'organisation et l'évolution de l'homme et a établi le chat domestique comme un puissant modèle génétique de cancers héréditaires et de maladies infectieuses chez l'homme et l'animal.
En 1996, l'équipe d'O'Brien a décrit le premier gène humain à influencer l'infection par le VIH-1 et la progression du SIDA, CCR5-Δ32, en utilisant une analyse d'association basée sur la génétique de la population. Cette découverte a conduit à plusieurs développements d'inhibiteurs d'entrée du VIH qui ont été approuvés par la FDA et ont également stimulé le premier véritable remède contre le VIH-SIDA chez le soi-disant patient de Berlin qui a définitivement éliminé le VIH lorsqu'il était perfusé avec une tige de donneur CCR5-Δ32 / CCR5-Δ32 cellules en 2006. Le groupe d'O'Brien a utilisé des études d'association génétique similaires pour revigorer le domaine de l'épidémiologie génétique, décrivant plus de 30 gènes de restriction du sida et appliquant également ces stratégies de découverte de gènes à des maladies infectieuses humaines chroniques, notamment l'hépatite C, l'hépatite, le carcinome hépatocellulaire du VHB, et le carcinome du nasopharynx.
En 2009, O'Brien s'est associé à David Haussler et Oliver Ryder pour fonder le projet Genome10K, un consortium international de génomiciens réunis pour faciliter le séquençage, l'assemblage et l'annotation du génome entier de 10 000 espèces de vertébrés.
En 2009, il a reçu un doctorat honorifique en médecine vétérinaire de l' Université de Zurich .
Le Dr O'Brien a un fort dévouement à l'éducation, comme en témoigne ses nominations en tant que professeur adjoint dans treize universités: Harvard University, The Johns Hopkins University, Cornell University, Duke University, St Francis University, Peking University-Beijing, University of Maryland, Université du Minnesota, Michigan State University, Colorado State University, George Washington University, George Mason University et Hood College of Frederick. Il a encadré plus de quinze doctorants. étudiants dont: Roger Reeves, Dennis Gilbert, Robert Wayne, Cheryl Winkler, Jose Lopez, Melanie Culver, Eduardo Eizirik, Olga Uphyrkina, Carlos Driscoll, Meredith Brown et Shu Jin Luo en plus de huit thèses de maîtrise et de plus de trente stagiaires postdoctoraux . Depuis 1996, il dirige un cours de courte durée internationalement reconnu et parrainé par la Smithsonian and American Genetics Association , intitulé «Recent Advances in Conservation Genetics», l'édition la plus récente (2018) à Front Royal, Virginie, USA
En 2018, le Dr OBrien a été élu à la National Academy of Sciences . En 2016, O'Brien a été élu membre étranger de l' Académie russe des sciences . Le Dr O'Brien a également été élu à l'American Academy of Arts and Science, au Explorer's Club et au Cosmos Club . Il a été président de l'Assemblée des scientifiques du NIH, président du Comité international sur la cartographie comparative des gènes pour l' Organisation du génome humain (HUGO). Le Dr O'Brien a fondé et codirige NOAHS (New Opportunities in Animal Health Sciences), un consortium de scientifiques et d'apprentis, qui fait partie de la Smithsonian Institution / National Zoological Park, dédié à l'application de la technologie biomédicale au nom de la conservation des espèces et à la formation une génération de scientifiques de la conservation. Il a été président du conseil consultatif scientifique du projet International BarCode of Life ( http://ibol.org/ ) et président du conseil d'administration du Cheetah Conservation Fund ( http://www.cheetah.org/ )
Le Dr O'Brien est l'auteur ou le coauteur de plus de 850 articles scientifiques et l'éditeur de quatorze volumes. En 2004, il a publié un livre populaire d'histoires d'aventures scientifiques intitulé «Tears of the Cheetah And Other Tales From The Genetic Frontier» (St. Martin's Pres NYC); en 2007, il a publié un «Atlas of Mammalian Chromosomes», un recueil de photos du caryotype de près de 1000 espèces de mammifères (John Wiley Inc. NYC). Le Dr O'Brien a été rédacteur en chef de six éditions de Genetic Maps: Locus Maps of Complex Genomes (Cold Spring Harbor Laboratory Press); Rédacteur du Journal of Heredity (American Genetics Association) de 1987 à 2007; Rédacteur du Bulletin Isozyme; Membre du comité de rédaction de GigaScience , rédacteur associé pour la génomique ; Génomique humaine , génome des mammifères , phylogénétique moléculaire et évolution , et cosmos.