L' Esiliiga 2000 est la dixième saison de l' Esiliiga , deuxième ligue estonienne pour les clubs de football d'association , depuis sa création en 1992.
Le FC Kuressaare a remporté la victoire en séries éliminatoires après le retrait de JK Tervis Pärnu en raison de l'indisponibilité des joueurs actifs pour l'équipe estonienne U-18. Kuressaare est resté à Meistriliiga, Tervis à Esiliiga.