Coriobactéries - Coriobacteriia

Les Coriobacteriia sont une classe de bactéries Gram-positives au sein du phylum des Actinobacteria . Les espèces de ce groupe sont des anaérobies non sporulants , stricts ou facultatifs capables de prospérer dans un ensemble diversifié de niches écologiques. Les espèces de Gordonibacter sont les seuls membres capables de motilité au moyen de flagelles au sein de la classe. Plusieurs espèces de la classe des Coriobacteriia ont été impliquées dans des maladies humaines dont la gravité varie. Les espèces Atopobium , Olsenella et Cryptobacterium sont responsables d'infections buccales chez l'homme, notamment la parodontite , l' halitose et d'autres infections endodontiques . Les espèces d' Eggerthella ont été associées à une bactériémie sanguine sévère et à une rectocolite hémorragique .

Signatures moléculaires et position phylogénétique

Historiquement, toutes les espèces de Coriobacteriia étaient placées dans un seul ordre ( Coriobacteriales ) et une seule famille ( Coriobacteriaceae ). Ce point de vue, cependant, ne reflétait pas les interrelations évolutives précises au sein de la classe. Le point de vue taxonomique actuel est justifié par la présence de plusieurs indels de signature conservés (CSI) qui ont été trouvés aux différents rangs taxonomiques. Ces CSI sont spécifiques et représentent des caractéristiques synapomorphiques qui peuvent être utilisées pour distinguer des groupes au sein des Coriobacteriia , à la fois au niveau de la famille et de l'ordre. La distinction des ordres au sein des Coriobacteriia est également prise en charge par la ramification des arbres phylogénétiques et par des caractéristiques cohérentes ; les membres appartenant aux Coriobacteriales sont des espèces saccharolytiques à fermentation du glucose tandis que l' ordre Eggerthellales a des espèces qui sont systématiquement incapables de fermenter le glucose et sont asaccharolytiques.

Les CSI ont également été utilisés pour résoudre la position phylogénétique des Coriobacteriia parmi toutes les bactéries où elles ont été trouvées exclusivement pour toutes les espèces de la classe, les délimitant des autres Actinobactéries . Les Coriobacteriia sont une lignée de ramification précoce au sein du phylum des Actinobacteria. La ramification profonde de la classe a conduit à des différends sur son appartenance au phylum et sur le fait qu'il s'agisse ou non d'un véritable groupe d'actinobactéries. Un CSI sous la forme d'un insert d'acide aminé unique dans l'enzyme désoxyuridine 59-triphosphate (dUTP) nucléotidohydrolase a été trouvé qui est partagé par tous les membres de Coriobacteriia , ainsi que plusieurs espèces d' Actinobactéries , et absent de toutes les autres bactéries. Ce CSI soutient sans ambiguïté l' appartenance de Coriobacteriia au sein des Actinobacteria .

Les références