Base de poisson - FishBase
Teneur | |
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La description | Une base de données biologique importante et largement consultée sur les poissons |
Types de données capturés |
Données complètes sur les espèces, y compris la taxonomie, la biométrie, le comportement, la distribution, les habitats et les photos |
Organismes | Espèces de poissons adultes ( poissons ) |
Contact | |
Centre de recherche | Institut Leibniz des sciences de la mer , coordinateur du consortium FishBase |
Auteurs | Daniel Pauly , Rainer Froese |
Accès | |
Site Internet | www.fishbase.org |
Outils | |
Autonome | Versions historiques disponibles sur CD |
Divers | |
Licence | CC-BY-NC pour les données ; différents niveaux de licence pour les fichiers multimédias (images, sons, ...) à vérifier au cas par cas |
Gestion des versions | Chaque mois pair de l'année |
Fréquence de diffusion des données |
Mis à jour en permanence |
Version | Dernière version actuelle : 08/2021 |
Politique de conservation | Consortium FishBase |
Entités pouvant être mises en signet |
Oui |
FishBase est une base de données mondiale sur les espèces de poissons (en particulier les poissons ). Il s'agit de la base de données en ligne la plus vaste et la plus consultée sur les poissons adultes sur le Web. Au fil du temps, il est « évolué en un outil écologique dynamique et polyvalent » qui est largement cité dans les publications savantes.
FishBase fournit des données complètes sur les espèces, y compris des informations sur la taxonomie , la répartition géographique, la biométrie et la morphologie , le comportement et les habitats, l'écologie et la dynamique des populations ainsi que des données reproductives, métaboliques et génétiques. Il existe un accès à des outils tels que les pyramides trophiques , les clés d'identification , la modélisation biogéographique et les statistiques de pêche et il existe des liens directs au niveau des espèces vers des informations dans d'autres bases de données telles que LarvalBase , GenBank , la Liste rouge de l'UICN et le Catalogue des poissons .
En août 2021, FishBase comprenait des descriptions de 34 700 espèces et sous-espèces, avec 324 200 noms communs , 61 000 images et des références à 58 400 ouvrages dans la littérature scientifique . Le site compte environ 1 000 000 de visites par mois.
Histoire
Les origines de FishBase remontent aux années 1970, lorsque le scientifique halieutique Daniel Pauly a eu du mal à tester une hypothèse sur la façon dont la capacité de croissance des poissons était affectée par la taille de leurs branchies. Des hypothèses, comme celle-ci, ne pourraient être testées que si de grandes quantités de données empiriques étaient disponibles. À l'époque, la gestion des pêches utilisait des modèles analytiques qui nécessitaient des estimations de la croissance et de la mortalité des poissons . Il peut être difficile pour les scientifiques et les gestionnaires des pêches d'obtenir les informations dont ils ont besoin sur les espèces qui les concernent, car les faits pertinents peuvent être dispersés et enterrés dans de nombreux articles de journaux, rapports, bulletins d'information et autres sources. Cela peut être particulièrement difficile pour les habitants des pays en développement qui ont besoin de telles informations. Pauly croyait que la seule façon pratique pour les gestionnaires des pêches d'accéder au volume de données dont ils avaient besoin était d'assembler et de consolider toutes les données disponibles dans la littérature publiée dans un référentiel central et facilement accessible. Une telle base de données serait particulièrement utile si les données ont également été standardisées et validées. Cela signifierait que lorsque les scientifiques ou les gestionnaires ont besoin de tester une nouvelle hypothèse, les données disponibles seront déjà là sous une forme validée et accessible, et il ne sera pas nécessaire de créer un nouvel ensemble de données puis de le valider.
Pauly a recruté Rainer Froese , et les débuts d'une base de données logicielle dans ce sens ont été codés en 1988. Cette base de données, initialement limitée aux poissons tropicaux, est devenue le prototype de FishBase. FishBase a ensuite été étendu pour couvrir tous les poissons et a été lancé sur le Web en août 1996. Il s'agit désormais de la base de données en ligne sur les poissons la plus grande et la plus consultée au monde. En 1995, le premier CD-ROM est sorti sous le nom de "FishBase 100". Les CD suivants sont sortis chaque année. Le logiciel fonctionne sur Microsoft Access qui ne fonctionne que sur Microsoft Windows .
FishBase couvre les poissons adultes, mais ne détaille pas les stades précoces et juvéniles des poissons. En 1999, une base de données complémentaire, appelée LarvalBase , a été mise en ligne sous la supervision de Bernd Ueberschär. Il couvre l' ichtyoplancton et le stade juvénile des poissons, avec des données détaillées sur les œufs et les larves de poissons, l' identification des poissons , ainsi que des données pertinentes pour l'élevage de jeunes poissons en aquaculture . Compte tenu du succès de FishBase, il y avait une demande pour une base de données couvrant les formes de vie aquatique autres que les poissons. Cela a abouti, en 2006, à la naissance de SeaLifeBase . L'objectif à long terme de SeaLifeBase est de développer un système d'information sur le modèle de FishBase, mais incluant toutes les formes de vie aquatique, à la fois marine et d'eau douce, à l'exception des poissons dans lesquels FishBase est spécialisé. Au total, il y a environ 300 000 espèces connues dans cette catégorie. .
Organisation Actuelle
Au fur et à mesure que la notoriété de FishBase s'est accrue parmi les spécialistes du poisson, elle a attiré plus de 2 310 contributeurs et collaborateurs. Depuis 2000, FishBase est supervisé par un consortium de neuf institutions internationales. À ce jour, le consortium FishBase est passé à douze membres. Le GEOMAR - Centre Helmholtz pour la recherche océanique pour la recherche océanique de Kiel (GEOMAR) en Allemagne, fonctionne comme l'organe de coordination.
Le consortium FishBase Université Aristote de Thessalonique , Thessalonique, Grèce Académie chinoise des sciences halieutiques , Pékin, Chine Institut des océans et des pêches , Université de la Colombie-Britannique , Vancouver, Canada Organisation pour l'alimentation et l'agriculture , Rome, Italie Muséum National d'Histoire Naturelle , Paris, France Musée royal de l'Afrique centrale , Tervuren, Belgique Musée suédois d'histoire naturelle , Stockholm, Suède WorldFish , Penang, Malaisie Universidade Federal de Sergipe , São Cristóvão - SE, Brésil Université d'Australie-Occidentale, Perth , Australie-Occidentale Quantitative Aquatics, Incorporated , Laguna, Philippines
Voir également
Les références
Lectures complémentaires
- Bailly N (2010) Pourquoi il peut y avoir des divergences dans l'évaluation des noms scientifiques entre le Catalogue of Fishes et FishBase Version 2, 6 mai 2010.
- Bailly N, Reyes Jr R, Atanacio R et Froese R (2010) "Simple Identification Tools in FishBase" Dans : Nimis PL et Vignes Lebbe R. (eds) Tools for Identifier Biodiversity: Progress and Problems , pages 31-36. ISBN 978-88-8303-295-0 .
- Christensen V, CJ Walters, R Ahrens, J Alder, J Buszowski, LB Christensen, WWL Cheung, J Dunne, R Froese, V Karpouzi, K Kaschner, K Kearney, S Lai, V Lam, MLD Palomares, A Peters-Mason, C Piroddia, JL Sarmiento, J Steenbeek, R Sumaila, R Watson, D Zeller et D Pauly (2009) Modèles basés sur des bases de données de la modélisation écologique des grands écosystèmes marins du monde , 220 (17) : 1984-1996.
- Froese R (2011) "La science dans Fishbase" Dans: Villy Christensen et Jay Maclean (eds) Ecosystem Approaches to Fisheries: A Global Perspective , Cambridge University Press, pages 47-54. ISBN 978-0-521-13022-6 .
- Froese R et Pauly D (eds) (2000) FishBase 2000 : concepts, conception et sources de données ICLARM, Philippines.
- Froese R et Pauly D (1994) "Fishbase as a tool for comparer the life history patterns of flatfish" Netherlands Journal of Sea Research , 32 (3/4): 235-239.
- Nauen CE (2004) Une archive électronique publique sur les poissons du monde à l'appui d'une pêche durable Séminaire CTA/Secrétariat du Commonwealth, Réunion d'experts sur les relations de pêche ACP-UE, Bruxelles.
- Palomares, MLD, N. Bailly et D. Pauly (2009) FishBase, SeaLifeBase et la modélisation des écosystèmes basée sur les bases de données p. 156-158. Dans : MLD Palomares, L. Morissette, A. Cisnero-Montemayor, D. Varkey, M. Coll et C. Piroddi (éd.) Ecopath 25 Years Conference Proceedings : Extended Abstracts. Rapports de recherche du Centre des pêches de l'UBC 17 (3).
- Pauly D (1997) « La science dans FishBase » , Bulletin de coopération en matière de pêche de la CE, 10 (2) : 4–6.
- Robertson R (2008) « Bases de données biogéographiques mondiales sur les poissons marins : caveat emptor » Diversité et distributions, 14 (6) : 891–892.
- Ueberschär B et Teltow M (1999) Bulletin "FishBase va à la pêche" , 12 (2–3) : 38–39.
Liens externes
- FishBase en ligne
- La base de données sur les poissons de Taïwan
- FishBase pour l'Afrique
- FishBase FishBlog (informateur FishBase Sverige)
- FishBase célèbre son 20e anniversaire dans le journal Kiel Science , 3 septembre 2010.
- Rainer Froese sur FishBase Blue Zoo .
- SpeciesBank : Rêves et réalités Rainer Froese, Présentation de l'atelier, 2005.
- Fish Morphology and Identification in FishBase Musée Royal de l'Afrique Centrale (MRAC Tervuren) , Présentation à FishBase and Fish Taxonomy Training Session 2007.
- La 6e réunion du Consortium FishBase et le 3e Mini FishBase Symposium FishBytes , 2005.
- 2008 FishBase Symposium Académie chinoise des sciences de la pêche , 2 septembre 2008.
- Pêchez en ligne Daniel Pauly, Rainer Froese et Maria Lourdes Palomares. Un projet de guide pour l'apprentissage et l'enseignement de l'ichtyologie à l'aide du système d'information FishBase. Mis à jour le 17 janvier 2005.