NeuroNames - NeuroNames

NeuroNames
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Teneur
Description Nomenclature hiérarchique complète des structures du cerveau primate (humain et macaque)
Types de données
capturés
Neuroanatomie
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Site Internet http://braininfo.rprc.washington.edu/
Divers
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NeuroNames est une nomenclature intégrée pour les structures du cerveau et de la moelle épinière des quatre espèces les plus étudiées par les neuroscientifiques: l' homme , le macaque , le rat et la souris . Il offre un vocabulaire standard et contrôlé de noms communs pour les structures, qui convient à l' indexation neuroanatomique sans ambiguïté des informations dans les bases de données numériques. Les termes du vocabulaire standard ont été sélectionnés pour leur facilité de prononciation, leur valeur mnémonique et leur fréquence d'utilisation dans de récentes publications neuroscientifiques. Les structures et leurs relations entre elles sont définies en fonction du vocabulaire standard. Actuellement, NeuroNames contient des noms, des synonymes et des définitions standard de quelque 2 500 entités neuroanatomiques.

La nomenclature est maintenue par l' Université de Washington et est le composant central d'un outil appelé "BrainInfo". BrainInfo aide à identifier les structures du cerveau. On peut soit rechercher par un nom de structure, soit localiser la structure dans un atlas cérébral et obtenir des informations telles que son emplacement dans la hiérarchie cérébrale classique, des images de la structure, les cellules dont elle dispose, ses connexions et les gènes qui y sont exprimés. Les informations peuvent être consultées par l'un des 16 000 synonymes dans huit langues.

NeuroNames est un vocabulaire source du métathésaurus du système de langage médical unifié . Il est décrit en détail dans les trois articles scientifiques suivants :

  • DM Bowden et RF Martin (mars 1995). "Hiérarchie du Cerveau NeuroNames". NeuroImage . 2 (1): 63–83. doi : 10.1006 / nimg.1995.1009 . PMID   9410576 . S2CID   24847350 .
  • DM Bowden et MF Dubach (2003). «NeuroNames 2002». Neuroinformatique . 1 (1): 43–59. doi : 10.1385 / NI: 1: 1: 043 . PMID   15055392 . S2CID   12575028 .
  • DM Bowden; E. Song; J. Kosheleva; MF Dubach (2011). "NeuroNames: Une Ontologie pour le Portail BrainInfo aux Neurosciences sur le Web" . Neuroinformatique . 10 (1): 97-114. doi : 10.1007 / s12021-011-9128-8 . PMC   3247656 . PMID   21789500 .

Voir également

Liens externes