HLA-DQ8 - HLA-DQ8

HLA-DQ8 ( CMH classe II , antigène de surface cellulaire DQ )
Rendu de HLA-DQ8 avec un peptide d'insuline immunodominant dans la poche de liaison.
Cis-haplotype		Haplotype
isoforme,	sous-type	DQA1	DQB1
QD α 3 β 8	DQ8.1	*0301	*0302
QD α 3 β 8	DQ8.1v	*0302	*0302
haplotypes rares
QD α 4 β 8	DQ8.4	*0401	*0302
QD α 5 β 8	DQ8.5	*0503	*0302

HLA-DQ8 ( DQ8 ) est un sérotype d' antigène leucocytaire humain appartenant au groupe de sérotypes HLA-DQ (DQ). DQ8 est un antigène fractionné de l' antigène large DQ3 . DQ8 est déterminé par la reconnaissance d'anticorps de β ⁸ et ceci détecte généralement le produit génique de DQB1 *0302 .

DQ8 est généralement lié à une maladie auto-immune dans la population humaine. DQ8 est la deuxième isoforme la plus prédominante liée à la maladie cœliaque et la DQ la plus liée au diabète de type 1 . Le DQ8 augmente le risque de polyarthrite rhumatoïde et est lié au principal locus de risque de PR, HLA-DR4 . DR4 joue également un rôle important dans le diabète de type 1. Alors que l'haplotype DQ8.1 est associé à une maladie, il n'existe aucune association connue avec les haplotypes DQB1*0305, DQ8.4 ou DQ8.5 (voir encadré) avec une maladie auto-immune ; cependant, cela peut être le résultat du manque d'études dans les populations qui en sont porteuses et de la très faible fréquence.

DQ8.1 diffère également des autres HLA en termes de fréquences de population. Typiquement pour les antigènes du CMH de classe II chez l'homme, les fréquences des haplotypes ne dépassent pas 40 %. Par exemple, aux États-Unis, la fréquence d'haplotype la plus élevée, l'haplotype qui a codé DQ6.2, est d'environ 15 %, ce qui se traduit par des fréquences de phénotype inférieures à 30 %. Les fréquences d'haplotypes atypiques dépassent 40 %.

Pour DQ8, les fréquences d'haplotypes les plus élevées approchent 80 % dans certaines parties de l'Amérique centrale et du Sud et les fréquences phénotypiques approchent les 90 %. Il s'agit de la fréquence de phénotype la plus élevée observée pour n'importe quel phénotype DR ou DQ dans la population humaine de loin.

Sérologie

Bien que la fausse réaction avec DQB1*0302 soit faible, l'efficacité de la réaction positive n'est pas bonne et il existe un risque de fausse détection de DQB1*0305 qui pourrait créer une incompatibilité. Pour le diagnostic et la confirmation de la maladie, il n'y a pas d'association connue de DQB1*0305 avec le diabète cœliaque ou auto-immun. Par conséquent, il est prudent d'utiliser le typage DQB1 haute résolution pour DQ8.

Allèles

DQ8 est déterminé par la reconnaissance d'anticorps de β ⁸ et est compliqué par le fait que DQ8 reconnaît certaines isoformes codées HLA-DQB1 *03 bien, partiellement ou pas bien du tout (Voir sérologie ) DQ β ^3,2 et β ^3,5 sont mieux reconnus comme DQ8 . Ces antigènes fractionnés sont les produits alléliques de DQB1 *0302 et DQB1 *0305 , respectivement.

DQB1*0302

DQB1 *0302 et se trouve le plus souvent dans l'haplotype DQA1 *0301 :DQB1 *0302 , environ 10 % du temps il se trouve dans l'haplotype DQA1 *0302 :DQB1 *0302 . DQB1*0302 sont presque toujours liés à DR4, DRB1 *0401 , *0402 et *0404 chez les caucasiens. Le premier et le troisième DRB1 sont les plus fortement associés à la polyarthrite rhumatoïde.

DQB1*0305

Le produit du gène DQB1 *0305 réagit légèrement plus intensément avec DQ8 qu'avec DQ7, il est généralement rare en Europe et en Amérique du Nord, sauf dans quelques populations indigènes. Les niveaux de DQB1 *0305 sont probablement plus élevés étant donné que les tests antérieurs ne distinguaient pas bien les différents *03.

Haplotypes

Les chaînes DQ8 se combinent avec les chaînes , codées par des allèles HLA-DQA1 génétiquement liés , pour former les isoformes cis - haplotypes . Il n'y a qu'une seule cis-isoforme commune de DQ8 parce que les allèles DQA1 *03 liés (2) se produisent sur la majorité de la population, DQ8.1 est l'écrasante majorité cis-isoforme de DQ8. Un haplotype rare DQA1 *0503 :DQB1 *0302 est détecté en dessous de 1% de tous les haplotypes DQ8 en Asie et en Méso-Amérique. Un autre haplotype plus rare, DQA1 *0401 :DQB1 *0302

DQ8.1

DQA1 *0301 :DQB1 *0302 (DQ8.1) est le sous-type DQ8 le plus courant représentant plus de 98% de la population porteuse de DQ8. Rarement, DQA1 *0302 :DQB1 *0302 , mais cette substitution de la chaîne alpha, DQA1* *0301 contre *0302 , est en dehors de la fente de liaison et ne semble pas altérer la fonction DQ8. DQ8.1 se trouve presque omniprésent dans chaque population régionale humaine, mais en raison de sa distribution unique, il devient un objet d'anthropologie moléculaire. Il y a 3 endroits où la fréquence des haplotypes est élevée, l'Amérique centrale et du Sud, la bordure nord-est du Pacifique et l'Europe du Nord.

Hautes fréquences dans les Amériques

Le nœud mondial de DQ8 se trouve en Amérique centrale et dans le nord de l'Amérique du Sud, où il atteint la fréquence la plus élevée pour un seul sérotype DQ, près de 90 % de fréquence phénotypique (77 % de fréquence d'haplotype) et est à une fréquence relativement élevée dans la population indigène d'Amérique du Nord. , et les régions côtières du golfe du Mexique et jusqu'à la vallée du Mississippi. La fréquence élevée de DQ8 dans les régions du nord-est de l'Amérique du Sud et sa faible fréquence chez les Amérindiens d'ascendance asiatique plus récente ou d'origine sibérienne suggèrent que DQ8 était à une fréquence élevée chez les premiers Amérindiens. Le modèle de distribution est cohérent avec les résultats récents de l'ADNmt suggérant que les premiers migrants vers le Nouveau Monde se sont installés dans les régions côtières des basses terres, les vallées fluviales et se sont lentement déplacés vers l'intérieur des terres, les colons suivants se sont installés dans les régions des hautes terres. DQ8 et DQ2.5 ont de nombreuses similitudes fonctionnelles analogues, et ce premier biais de colon peut être une raison de la similitude. Des études sur le virus d'Epstein Barr et d'autres protéines suggèrent que les deux protéines sont des présentateurs de peptides acides (c'est-à-dire des peptides avec une charge négative accrue) (voir DQ8 pour une illustration du processus de présentation) et peuvent s'être adaptés à certains modes de vie de chasse et de cueillette, peut-être les butineurs côtiers.

Abondance en Asie

Hiatus de DQ8 dans le nord-est de l'Arctique sibérien, niveaux élevés dans la région de l'Amour et les Turcs de l'Est

Les niveaux de DQ8 dans SW à West Pacific Rim sont à des fréquences d'haplotype variables, de 2 à 30%, et se stabilisent autour de 10% pour Ryūkyūan, Japonais, Coréens, Régions de l'Amour et dans le NW Pacific Rim tombent à moins de 1% dans le Nivkhi. Il y a un hiatus moderne de DQ8 dans la région Alaska-Sibérie orientale et on ne sait pas si cela est dû au remplacement, à la sélection ou au mode selon lequel les premiers Américains sont arrivés (c'est-à-dire une route strictement maritime). Les types DR associés à DQ8 sont DRB1*0403, *0404, *0406, *0407, *0408 et *0401 est réparti entre de nombreux haplotypes DQA1:B1. DQB1*0405 est généralement associé à DQA1*0303:DQB1*04 et n'est donc pas inclus dans DRB1*0401 dans les évaluations haute résolution. L'île Cook DQ8 n'avait qu'un seul haplotype DR associé suggérant une introduction limitant la diversité dans la région, soit via la route TW-(Japon/Corée/Chine) soit par l'ouest, par exemple les Bunun ont un DRB1*0403 élevé. La majorité des DRB1*04 semblent avoir été redistribués d'Asie orientale à partir d'une source inconnue, peut-être en Asie centrale ou en Inde. La distribution peut être comparée avec les groupes autochtones tels que les Sud-Américains. Trois groupes avec des niveaux élevés, les Kogui, les Sikuni et les Yucpa, ont environ 75 % de DQ8, l'allèle dominant DRB1* dans 2 sur 3 est le *0411 (Chine du Nord = 0), mais *0407 (Ryūkyū, japonais, Mansi -Oural oriental, chinois Naxi) et *0403 (Nganasan, Bouriate, Negidal, Tunisiens, Ryūkyū, Corée, Ainu) sont également trouvés. En Amérique du Nord, DRB1*0404 et *0407 sont plus fréquents que *0403 et, chez les Lakota Sioux, B1*0411 est rare. L'haplotype DRB1*0404-DQ8 est plus courant en Asie du Nord-Ouest et en Europe du Nord.

Niveaux élevés de DQ8 en Europe du Nord

Le DQ8 est également abondant en Europe du Nord et se trouve à des fréquences élevées dans la population germano-scandinave-ouralienne au nord de la Suisse. Les haplotypes HLA AB suggèrent qu'une migration de personnes à l'est de l'Oural est responsable de DQ8, peut-être d'aussi loin à l'est que la rive ouest du Pacifique. Le niveau élevé de DQ8 et DQ2.5 est quelque chose de grand intérêt pour les maladies à médiation DQ de Scandinavie et d'Europe du Nord. DQ8 se trouve également dans la péninsule ibérique et les endroits où le flux de gènes d'est en ouest par d'autres marqueurs génétiques ne peuvent pas être corroborés, et les niveaux au sein de la population africaine ou du Moyen-Orient sont des sources possibles, la péninsule ibérique a un équilibrage A1/B1 considérable suggérant des sources indépendantes d'Afrique.

Propagation mondiale de DQ8

DQ8 avec quelques autres haplotypes semble être divisé NW/SE en Eurasie et avec les preuves de DQ2.5 et d'autres haplotypes suggèrent qu'une ancienne population d'Asie centrale a été déplacée par une migration africaine plus récente. Il existe de nombreux marqueurs communs trouvés en France, Allemands, Danois, Suédois, Tibétains, fleuve Amour, Japonais et Coréens qui sont des indicateurs potentiels de cette propagation bilatérale. Les haplotypes DQ8 se trouvent à hautes fréquences dans le !Kung , bien qu'on s'attende à plus de DQ8 en Austronésie, il est omniprésent si tantôt à basses fréquences, tantôt à fréquences plus élevées (thaï). La voie de propagation de DQ8 vers le Nouveau Monde est énigmatique, certes le Japon et le fleuve Amour sont de puissantes sources, mais d'autres populations déplacées ne peuvent être exclues. Si le mode de déplacement était à travers le corridor de la Béringie tel que proposé par l'archéologue, la très faible fréquence de DQ8 à l'heure actuelle est une découverte très inhabituelle en ce qui concerne les preuves d'un déplacement complet ailleurs dans le monde. Les marqueurs qui sont partagés entre les Japonais et les aborigènes TW ont tendance à diminuer en fréquence à mesure que l'on s'approche de la Sibérie, les marqueurs d'ADNmt déclinent dans la chaîne Kuril. Au cours de la période Jōmon au Japon, il semble qu'il y aurait eu un déplacement des ancêtres Ninhvet/Ainu et une dépression de DQ8 dans tout le nord du Japon, mais le déclin dans toute la région est quelque peu inexplicable en dehors d'un événement climatique catastrophique entre la colonisation du Nouveau Monde et le heure actuelle.

Un modèle alternatif est qu'il y avait plusieurs sources de DQ8 dans le peuplement de l'Asie du Nord-Est, certaines sources provenaient d'Asie centrale et d'autres de la région indochinoise, certaines des DQ8 trouvées dans le nord-ouest de l'Eurasie pourraient provenir d'un mélange de la rive ouest du Pacifique et du centre de sources asiatiques, et ont été déplacés des régions plus centrales mais pas des régions plus orientales.

DQ8 et sélection

Comme DQ2.5, DQ8 pourrait avoir été sélectionné pour les peuples côtiers et maritimes qui se nourrissent et en particulier pour les peuples adaptés à la situation climat/habitat à l'extrémité nord de la bordure pacifique ouest habitable au dernier maximum glaciaire. La culture des triticées peut appliquer une sélection négative sur DQ8. Alors qu'il y avait de nombreux membres d' espèces de Triticeae similaires aux Triticeae sauvages du Moyen-Orient dans les Amériques, et un grand nombre de plantes domestiquées dans le nouveau monde, aucune espèce de Triticeae ne semble avoir été domestiquée dans le Nouveau Monde, et aucun exemple clair dans des tribus de graminées étroitement apparentées. Parmi les espèces de graminées du nouveau monde à l'époque post-colombienne, une espèce d' Elymus a été domestiquée pour la consommation humaine et une autre comme cultivar pastoral. Cela peut être interprété de 2 manières. Premièrement, les niveaux de DQ8 inhibaient négativement la domestication des souches de Triticeae . Deuxièmement, que l'absence de tels cultivars plus adaptés que les cultivars déjà développés a permis à DQ8 d'augmenter ou de rester élevé, tandis que les niveaux de DQ2.5 dans le NW sous une sélection à beaucoup plus long terme ont baissé, ou un peu des deux. La plupart des cultivars américains ont été domestiqués au sud du Rio Grande (à l'exception du riz Caddo et de la courge Texas panachée, etc.). Le blé, en particulier l'orge et le seigle, sont des cultivars préférentiels dans les climats plus froids, alors que Zea est plus adaptatif dans les climats tropicaux et certains cultivars sont relativement tolérants à la sécheresse, Zea manque cependant de certains acides aminés qui doivent être complétés par d'autres aliments pour prévenir la malnutrition. La proximité de la néolithisation à l'équateur dans le Nouveau Monde peut avoir beaucoup à voir avec la sélection négative inapparente de DQ8 par rapport à la néolithisation de l'Eurasie occidentale.

Rendu de HLA-DQ8 avec le peptide d'insuline dans la poche de liaison en regardant vers le bas au-dessus du sillon de liaison

DQ8 et maladie

En Europe , le DQ8 est associé au diabète de type 1 et à la maladie cœliaque (également appelée maladie cœliaque). Le facteur de risque le plus élevé pour le diabète de type 1 est le phénotype HLA DQ8/DQ2.5. Dans certaines parties de l'est de la Scandinavie, les DQ2.5 et DQ8 sont à la fois des augmentations élevées des fréquences de diabète de type I à apparition tardive et de diabète de type I/II ambigu. Le DQ8 est également présent chez de nombreux peuples autochtones d' Asie , il a été détecté très tôt dans la population bédoine d'Arabie où le DQ2.5 est fréquemment absent, et dans ces cas, le DQ8 est uniquement associé au HLA dans la maladie cœliaque.

Aux États-Unis , cependant, il semble y avoir un changement dans le risque de maladie auto-immune pour les immigrants du Mexique. L'immunoréactivité accrue des Hispaniques à Houston semble être associée à DR4-DQ8. L'haplotype peut présenter le risque le plus élevé de polyarthrite rhumatoïde.

Au Japon, DQ3 (DQ7, DQ8, DQ9) est associé à la myasthénie grave dans la population féminine à apparition précoce, bien qu'il ne semble pas que DQ8 ait le plus grand rôle, il existe des similitudes entre la myasthénie grave au Japon et celle détectée dans la population hispanique de Houston, avec DQ8 associé à des femmes plus jeunes par rapport aux associations de tous les autres types HLA DQ. La maladie cœliaque est en augmentation au Japon, et il est clair que les changements alimentaires en sont la raison, mais il n'y a pas non plus de DQ2.5 au Japon alors que les niveaux de DQ8 sont modérés.

La tringlerie DR4

De nombreuses maladies associées à DQ8 ont un double lien avec DR4, et certaines DR4 (*0405) ont une association de risque indépendante et dépendante avec DQ8, par exemple avec le diabète de type 1.

Les références

Liens externes

La maladie coeliaque

• Coeliaque Royaume-Uni (organisme de bienfaisance)
• La Fondation de la maladie coeliaque (États-Unis)
• La coeliaque Sprue Association (États-Unis)
• Centre national d'information sur les maladies digestives - page sur la maladie cœliaque
• Fondation nationale pour la sensibilisation à la maladie coeliaque (États-Unis)
• Centre de recherche sur la maladie cœliaque de l'Université du Maryland

Diabète de type 1

• Enfants diabétiques
• Diabète de type 1 à l' American Diabetes Association