Oomycète - Oomycete
Oomycètes | |
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Structures reproductives asexuées (A : sporanges, B : zoospores, C : chlamydospores) et sexuées (D : oospores) de Phytophthora infestans ( Peronosporales ) | |
Classement scientifique | |
Clade : | DAS |
Infraroyaume : | Heterokonta |
Phylum: |
Oomycota Arx, 1967 |
Classer: |
Oomycètes G. Hiver, 1880 |
Ordres et familles | |
Synonymes | |
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Oomycètes ou oomycètes ( / ˌ oʊ ə m aɪ s i t s / ) forment un distinct phylogénétique lignée de champignon -comme eucaryotes microorganismes . Ils sont filamenteux et hétérotrophes , et peuvent se reproduire de manière sexuée et asexuée. La reproduction sexuée d'une oospore est le résultat d'un contact entre les hyphes d' anthéridies mâles et d' oogones femelles ; ces spores peuvent passer l'hiver et sont appelées spores au repos. La reproduction asexuée implique la formation de chlamydospores et de sporanges , produisant des zoospores mobiles . Les oomycètes ont des modes de vie à la fois saprophytes et pathogènes , et incluent certains des agents pathogènes les plus notoires des plantes, provoquant des maladies dévastatrices telles que le mildiou de la pomme de terre et la mort subite du chêne . Un oomycète, le mycoparasite Pythium oligandrum , est utilisé pour la lutte biologique , attaquant les champignons phytopathogènes. Les oomycètes sont également souvent appelés moisissures aquatiques (ou moisissures aquatiques ), bien que la nature préférant l'eau qui a conduit à ce nom ne soit pas vraie pour la plupart des espèces, qui sont des agents pathogènes terrestres.
Les oomycètes étaient à l'origine regroupés avec les champignons en raison de similitudes de morphologie et de mode de vie. Cependant, des études moléculaires et phylogénétiques ont révélé des différences significatives entre les champignons et les oomycètes, ce qui signifie que ces derniers sont désormais regroupés avec les straménopiles (qui comprennent certains types d' algues ). Les Oomycota ont des archives fossiles très clairsemées ; un possible oomycète a été décrit à partir de l' ambre crétacé .
Étymologie
Oomycota vient du grec ωόν (oon, « œuf ») et μύκητας (mykitas, « champignon »), faisant référence aux grands oogones ronds , structures contenant les gamètes femelles, qui sont caractéristiques des oomycètes.
Le nom « moisissure d'eau » fait référence à leur classification antérieure en tant que champignons et à leur préférence pour des conditions d'humidité élevée et d'eau de surface courante, caractéristiques des taxons basaux des oomycètes.
Morphologie
Les oomycètes ont rarement des septa (voir hyphe ), et s'ils en ont, ils sont rares, apparaissant à la base des sporanges, et parfois dans les parties plus anciennes des filaments. Certains sont unicellulaires, tandis que d'autres sont filamenteux et ramifiés.
Classification
Auparavant, le groupe était organisé en six ordres.
- Les Saprolegniales sont les plus répandus. Beaucoup décomposent la matière en décomposition; d'autres sont des parasites.
- Les Leptomitales ont des épaississements de paroi qui donnent à leur corps cellulaire continu l'apparence d'une cloison. Ils portent de la chitine et se reproduisent souvent de manière asexuée.
- Les Rhipidiales utilisent des rhizoïdes pour attacher leur thalle au lit des plans d'eau stagnants ou pollués.
- Les Albuginales sont considérés par certains auteurs comme une famille (Albuginaceae) au sein des Peronosporales, bien qu'il ait été démontré qu'ils sont phylogénétiquement distincts de cet ordre.
- Les Peronosporales sont également principalement saprophytes ou parasites des plantes et ont une forme aseptée et ramifiée. Bon nombre des parasites agricoles les plus nuisibles appartiennent à cet ordre.
- Les Lagenidiales sont les plus primitifs ; certains sont filamenteux, d'autres unicellulaires ; ils sont généralement parasites.
Cependant, plus récemment, cela a été considérablement élargi.
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Anisolpidiales Dick 2001
- Anisolpidiacées Karling 1943
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Lagenismatales Dick 2001
- Lagenismataceae Dick 1995
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Salilagénidiales Dick 2001
- Salilagénidiaceae Dick 1995
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Rozellopsidales Dick 2001
- Rozellosidacées Dick 1995
- Pseudosphaeritacées Dick 1995
- Ectrogelales
- Haptoglosventes
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Eurychasmales
- Eurychasmatacées Petersen 1905
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Haliphtorales
- Haliphtoracées Vishniac 1958
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Olpidiopsidales
- Sirolpidiacées Cejp 1959
- Pontismatacées Petersen 1909
- Olpidiopsidacées Cejp 1959
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Atkinsielles
- Atkinisellacées
- Crypticolacées Dick 1995
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Saprolégniales
- Achlyacées
- Verrucalvacées Dick 1984
- Saprolégniacées Chaud. 1884 [Leptolégniacées]
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Leptomitales
- Leptomitacées Kuetz. 1843 [Apodachlyellaceae Dick 1986 ]
- Leptolegniellaceae Dick 1971 [Ducellieriaceae Dick 1995 ]
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Rhipidiales
- Rhipidiaceae Cejp 1959
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Albuginales
- Albuginaceae Schroet. 1893
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Peronosporales [Pythiales; Sclérosporales ; Lagenidiales]
- Salsapiliaceae
- Pythiaceae Schroet. 1893 [Pythiogétonacées; Lagenaceae Dick 1994 ; Lagenidiaceae; Péronophythoracées; Myzocytiopsidacées Dick 1995 ]
- Péronosporacées Chaud. 1884 [Sclérosporacées Dick 1984 ]
Relations phylogénétiques
Interne
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Externe
Ce groupe a été à l'origine classé parmi les champignons (le nom "oomycota" signifie "champignon de l'œuf") et plus tard traité comme des protistes , sur la base de la morphologie générale et du mode de vie. Une analyse cladistique basée sur les découvertes modernes sur la biologie de ces organismes soutient une relation relativement étroite avec certains organismes photosynthétiques, tels que les algues brunes et les diatomées . Une classification taxonomique commune basée sur ces données, place la classe Oomycota avec d'autres classes telles que Phaeophyceae (algues brunes) dans le phylum Heterokonta .
Cette relation est étayée par un certain nombre de différences observées entre les caractéristiques des oomycètes et des champignons. Par exemple, les parois cellulaires des oomycètes sont composées de cellulose plutôt que de chitine et n'ont généralement pas de cloisons . De plus, à l'état végétatif, ils ont des noyaux diploïdes , tandis que les champignons ont des noyaux haploïdes . La plupart des oomycètes produisent des zoospores auto-mobiles avec deux flagelles . Un flagelle a une morphologie en « coup de fouet », et l'autre une morphologie en « clinquant » ramifié. Le flagelle « clinquant » est unique au Royaume Heterokonta. Les spores des quelques groupes fongiques qui conservent les flagelles (comme les Chytridiomycètes ) n'ont qu'un seul flagelle de coup du lapin. Les oomycota et les champignons ont des voies métaboliques différentes pour synthétiser la lysine et ont un certain nombre d'enzymes qui diffèrent. L'ultrastructure est également différente, les oomycota ayant des crêtes mitochondriales tubulaires et les champignons ayant des crêtes aplaties.
Malgré cela, de nombreuses espèces d'oomycètes sont encore décrites ou répertoriées comme des types de champignons et peuvent parfois être appelées pseudochampignons ou champignons inférieurs.
La biologie
la reproduction
La plupart des oomycètes produisent deux types distincts de spores. Les principales spores dispersifs sont asexués, l' auto-motiles spores appelées zoospores , qui sont capables de chimiotaxie (mouvement vers ou à l' écart d'un signal chimique, tels que ceux qui sont libérés par les sources potentielles de nourriture) dans l' eau de surface (y compris la précipitation sur la surface des plantes). Quelques oomycètes produisent des spores aériennes asexuées qui sont distribuées par le vent. Ils produisent également des spores sexuées, appelées oospores , qui sont des structures sphériques à double paroi translucides utilisées pour survivre à des conditions environnementales défavorables.
Écologie et pathogénicité
De nombreuses espèces d'oomycètes sont des algues et des phytopathogènes agressifs d'importance économique . Certaines espèces peuvent provoquer des maladies chez les poissons , et au moins une est un agent pathogène des mammifères. La majorité des espèces phytopathogènes peuvent être classées en quatre groupes, bien qu'il en existe d'autres.
- Le groupe Phytophthora est un genre paraphylétique qui provoque des maladies telles que le dépérissement , le mildiou de la pomme de terre (la cause de la Grande Famine des années 1840 qui a ravagé l' Irlande et d'autres parties de l'Europe), la mort subite du chêne , la pourriture des racines du rhododendron et la maladie de l'encre dans la châtaigne d'Europe
- Le groupe paraphylétique Pythium est plus répandu que Phytophthora et les espèces individuelles ont des gammes d'hôtes plus larges, bien qu'elles causent généralement moins de dégâts. La fonte des semis par Pythium est un problème très courant dans les serres, où l'organisme tue les semis nouvellement émergés. Les membres mycoparasites de ce groupe (par exemple P. oligandrum ) parasitent d'autres oomycètes et champignons et ont été utilisés comme agents de lutte biologique. Une espèce de Pythium , Pythium insidiosum , provoque également la pythiose chez les mammifères.
- Le troisième groupe est le mildiou , qui est facilement identifiable par l'apparition de "mildiou" blanc, brunâtre ou olive sur le dessous des feuilles (bien que ce groupe puisse être confondu avec les oïdiums fongiques non apparentés ).
- Le quatrième groupe est constitué des rouilles blanches , Albuginales , qui causent la maladie des vésicules blanches sur une variété de plantes à fleurs. Les rouilles vésiculeuses blanches sporulent sous l' épiderme de leurs hôtes, provoquant des cloques remplies de spores sur les tiges, les feuilles et l' inflorescence . Les Albuginales sont actuellement divisés en trois genres, Albugo parasite à prédominance de Brassicales , Pustula , parasite à prédominance d' Asterales , et Wilsoniana , à prédominance de parasite de Caryophyllales . Comme le mildiou , les rouilles blanches sont des biotrophes obligatoires , ce qui signifie qu'elles sont incapables de survivre sans la présence d'un hôte vivant.
Les références
Liens externes
- Description du Phylum Oomycota – Biologie Systématique
- Introduction à l'Oomycota - University of California Museum of Paleontology (UCMP)
- Séquence du génome et analyse du pathogène de la famine de la pomme de terre en Irlande Phytophthora infestans