HDAC1 - HDAC1

HDAC1
Structures disponibles
APD	Recherche orthologue : PDBe RCSB
Liste des codes d'identification PDB
	4BKX , 5ICN
Identifiants
Alias	HDAC1 , GON-10, HD1, RPD3, RPD3L1, histone désacétylase 1, KDAC1
Identifiants externes	OMIM : 601241 MGI : 108086 HomoloGene : 68426 GeneCards : HDAC1
Emplacement du gène ( humain )
Chr.	Chromosome 1 (humain)
Finir	32 333 635 pb
Emplacement du gène ( souris )
Chr.	Chromosome 4 (souris)
Finir	129 542 713 pb
Modèle d' expression de l'ARN
	Plus de données d'expression de référence
ontologie du gène
Fonction moléculaire	• GO:0000980 ARN polymérase II cis-regulatory region liaison à l'ADN spécifique à la séquence ; • Activité histone désacétylase NAD-dépendante (spécifique H3-K14) ; • GO:0001106 activité corépresseur de transcription ; • activité histone désacétylase ; • liaison N-terminale de la protéine ; • GO:0001131 , GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 Activité facteur de transcription de liaison à l'ADN ; • Activité protéine désacétylase ; • Liaison histone désacétylase ; • GO:0000975 Liaison à la région cis-régulatrice de transcription ; • Liaison NF-kappaB ; • Activité désacétylase ; • GO:0001948 Liaison protéine ; • ADN nucléosomique liaison ; • enzyme liaison ; • activité hydrolase ; • liaison à l' ADN spécifique de la séquence promoteur de base ; • p53 liaison ; • facteur de transcription liant ; • ARN polymerase II de l' ADN de séquence spécifique au promoteur core de liaison ; • liaison à l' ADN ; • liaison chromatine ; • domaine de boîte associé Krueppel liaison ; • Liaison E-box ; • Liaison de la chromatine spécifique au promoteur;
Composant cellulaire	• cytoplasme ; • NuRD complexe ; • cytosol ; • histone désacétylase complexe ; • complexe Sin3 ; • nucléoplasme ; • noyau ; • chromatine ; • hétérochromatine ; • complexe régulateur transcription ; • transcription répresseur complexe ; • complexe contenant des protéines ; • corps de cellule neuronale ; • complexe de type Sin3;
Processus biologique	• formation de placode du follicule pileux ; • différenciation des cellules épidermiques ; • remodelage de la chromatine ; • régulation de la transcription, modèle d'ADN ; • processus rythmique ; • régulation négative de la voie de signalisation des récepteurs androgènes ; • morphogenèse des doigts embryonnaires ; • régulation négative du processus apoptotique ; • coagulation sanguine ; • régulation négative de la transcription par ARN polymérase II ; • développement des paupières dans un œil de type caméra ; • régulation circadienne de l'expression des gènes ; • régulation négative de l'expression des gènes ; • remodelage de la chromatine ATP-dépendant ; • régulation positive de la transcription, modèle d'ADN ; • odontogenèse de la dent contenant la dentine ; • désacétylation des protéines ; • histone Désacétylation H4 ; • formation de papilles fongiformes ; • régulation négative de la différenciation des myotubes ; • GO:0022415 processus viral ; • désacétylation des histones ; • régulation négative de la voie de signalisation Wnt canonique ; • régulation positive de la transcription par l'ARN polymérase II ; • transcription, ADN-template ; • régulation de la transduction du signal par p53 c médiateur lass ; • Assemblée hétérochromatine dépendante de la méthylation de l' ADN ; • bêta-caténine-TCF assemblage complexe ; • modification de la chromatine covalente ; • organisation chromatine ; • régulation positive de la prolifération de la population cellulaire ; • régulation négative de la transcription, matrice d' ADN ; • histone H3 désacétylation ; • régulation de la différenciation des mégacaryocytes ; • régulation de la transcription par l'ARN polymérase II ; • développement de l'endoderme ; • rythme circadien ; • développement de l'hippocampe ; • différenciation neuronale ; • régulation négative de la I-kappaB kinase/signalisation NF-kappaB ; • régulation positive de la différenciation des oligodendrocytes ; • régulation de l'activité endopeptidase ; • régulation de la clairance bêta-amyloïde ; • régulation négative de la voie de signalisation apoptotique intrinsèque;
	Sources : Amigo / QuickGO
Orthologues
	3065
	433759
	ENSG00000116478
	ENSMUSG00000028800
	Q13547
	O09106
	NM_004964
	NM_008228
	NP_004955
	NP_032254
	Wikidata
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L' histone désacétylase 1 ( HDAC1 ) est une enzyme qui , chez l' homme , est codée par le gène HDAC1 .

Fonction

L'acétylation et la désacétylation des histones , catalysées par des complexes multi-sous-unités, jouent un rôle clé dans la régulation de l'expression des gènes eucaryotes . La protéine codée par ce gène appartient à la famille des histones désacétylases/acuc/apha et est un composant du complexe des histones désacétylases. Il interagit également avec la protéine suppresseur de tumeur du rétinoblastome et ce complexe est un élément clé dans le contrôle de la prolifération et de la différenciation cellulaire. Avec la protéine 2 MTA2 associée aux métastases , il désacétyle p53 et module son effet sur la croissance cellulaire et l'apoptose.

Organismes modèles

*Phénotype de* souris knock-out *Hdac1*
Caractéristique	Phénotype
Viabilité des homozygotes	Anormal
Étude létale récessive	Anormal
La fertilité	Normal
Poids	Normal
Anxiété	Normal
Évaluation neurologique	Normal
Force de préhension	Normal
Plat chaud	Normal
Dysmorphologie	Normal
Calorimétrie indirecte	Normal
Test de tolérance au glucose	Normal
Réponse auditive du tronc cérébral	Normal
DEXA	Normal
Radiographie	Normal
Température corporelle	Normal
Morphologie des yeux	Normal
Chimie clinique	Normal
Hématologie	Normal
Lymphocytes du sang périphérique	Normal
Test du micronoyau	Normal
Poids du coeur	Normal
Histopathologie cérébrale	Normal
Histopathologie oculaire	Normal
Infection à la salmonelle	Normal
Infection à Citrobacter	Normal
Tous les tests et analyses de

Des organismes modèles ont été utilisés dans l'étude de la fonction HDAC1. Une lignée de souris knock-out conditionnelle , appelée Hdac1 ^{tm1a(EUCOMM)Wtsi, a} été générée dans le cadre du programme International Knockout Mouse Consortium – un projet de mutagenèse à haut débit pour générer et distribuer des modèles animaux de maladies aux scientifiques intéressés – au Wellcome Trust Sanger Institute . Les animaux mâles et femelles ont subi un criblage phénotypique standardisé pour déterminer les effets de la délétion. Vingt-cinq tests ont été effectués et deux phénotypes ont été rapportés. Un nombre réduit d' embryons mutants homozygotes a été identifié pendant la gestation et aucun n'a survécu jusqu'au sevrage . Les autres tests ont été effectués sur des souris adultes mutantes hétérozygotes et aucune anomalie significative n'a été observée chez ces animaux.

Interactions

Il a été démontré que HDAC1 interagit avec :

récepteur aux androgènes ,
BCL6 ,
BTG2 ,
BUB1B ,
BUB1 ,
BUB3 ,
CBFA2T3 ,
CDC20 ,
CDH1 ,
CHD3 ,
CHD4 ,
COUP-TFII ,
CTBP1 ,
DDX17 ,
DDX5 ,
DNMT3A ,
DNMT3L ,
Protéine associée à la mort 6 ,
DEED ,
EVI1 ,
EZH2 ,
FKBP3 ,
GATA1 ,
HMG20B ,
HSPA4 ,
HUS1 ,
Histone désacétylase 2 ,
Homeobox protéine TGIF1 ,
Facteur de cellule hôte C1 ,
IFRD1 ,
IKZF1 ,
ING1 ,
MBD3 ,
MIER1 ,
MLL ,
MTA1 ,
MTA2 ,
Mad1 ,
Mdm2 ,
Protéine du domaine de liaison méthyl-CpG 2 ,
Mères contre homologue décapentaplégique 2 ,
MyoD ,
NFKB1 ,
Co-répresseur du récepteur nucléaire 2 ,
P21 ,
PCNA ,
PHF21A ,
Interdiction ,
Protéine leucémique promyélocytaire ,
RAD9A ,
RBBP4 ,
RBBP7 ,
RCOR1 ,
RELA ,
RFC1 ,
Protéine de rétinoblastome ,
Protéine de type rétinoblastome 1 ,
Protéine de type rétinoblastome 2 ,
SAP30 ,
SATB1 ,
SIN3A ,
SIN3B ,
SPEN ,
SUDS3 ,
SUV39H1 ,
facteur de transcription Sp1 ,
TOP2A ,
TOP2B , et
Doigt de zinc et protéine contenant le domaine BTB 16 .

Voir également

Les références

Lectures complémentaires

Wolffe AP (avril 1996). « Histone désacétylase : un régulateur de la transcription » . Sciences . 272 (5260) : 371-2. Bibcode : 1996Sci ... 272..371W . doi : 10.1126/science.272.5260.371 . PMID 8602525 . S2CID 27257723 .
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Liens externes

HDAC1+protéine,+humain à la National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH) des États-Unis

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