Code plastidique bactérien, archéologique et végétal - Bacterial, archaeal and plant plastid code

Le code plaste bactérien, archéen et végétal (table de traduction 11 ) est le code ADN utilisé par les bactéries , les archées , les virus procaryotes et les protéines chloroplastiques . C'est essentiellement le même que le code standard , mais il existe quelques variantes dans les codons de départ alternatifs .

Le code

Propriétés biochimiques des acides aminés Non polaire Polaire De base Acide Terminaison: stop codon
Code génétique standard
1ère
base 		2ème base 3e
base
U C UNE g
U UUU (Phe / F) Phénylalanine UCU (Ser / S) Serine UAU (Tyr / Y) Tyrosine UGU (Cys / C) Cystéine U
UUC UCC UAC UGC C
UUA (Leu / L) Leucine UCA UAA Stop ( ocre ) UGA Stop ( Opale ) UNE
UUG UCG UAG Stop ( Ambre ) UGG (Trp / W) Tryptophane g
C CUU CCU (Pro / P) Proline CAU (His / H) Histidine CGU (Arg / R) Arginine U
CUC CCC CAC CGC C
CUA CCA CAA (Gln / Q) Glutamine CGA UNE
CUG CCG CAG CGG g
UNE AUU (Ile / I) Isoleucine ACU (Thr / T) Thréonine AUA (Asn / N) Asparagine AGU (Ser / S) Serine U
AUC ACC AAC AGC C
AUA ACA AAA (Lys / K) Lysine AGA (Arg / R) Arginine UNE
AOÛT (Met / M) Méthionine ACG AAG AGG g
g GUU (Val / V) Valine GCU (Ala / A) Alanine GAU (Asp / D) Acide aspartique GGU (Gly / G) Glycine U
GUC GCC GAC GGC C
GUA GCA GAA (Glu / E) Acide glutamique GGA UNE
GUG GCG GAG GGG g
A Le codon AUG code à la fois pour la méthionine et sert de site d'initiation: le premier AUG dans la région codante d' unARNmest l'endroit où la traduction en protéine commence. Les autres codons de départ répertoriés par GenBank sont rares chez les eucaryotes et codent généralement pour Met / fMet.
B ^ ^ ^ La base historique pour désigner les codons d'arrêt comme ambre, ocre et opale est décrite dans une autobiographie de Sydney Brenner et dans un article historique de Bob Edgar.

Comme dans le code standard, l'initiation est plus efficace à AUG. De plus, les démarrages de GUG et d'UUG sont documentés chez les archées et les bactéries. Chez Escherichia coli , on estime que l'UUG sert d'initiateur pour environ 3% des protéines de la bactérie. Le CUG est connu pour fonctionner en tant qu'initiateur d'une protéine codée par un plasmide (RepA) dans E. coli . En plus des initiations NUG, dans de rares cas, les bactéries peuvent initier la traduction à partir d'un codon AUU comme par exemple dans le cas de la poly (A) polymérase PcnB et du gène InfC qui code pour le facteur d'initiation de la traduction IF3 . Les affectations internes sont les mêmes que dans le code standard à travers les codes UGA à faible efficacité pour le tryptophane chez Bacillus subtilis et, vraisemblablement, chez Escherichia coli .

Voir également

Les références

Cet article incorpore le texte de la Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis , qui est dans le domaine public .