Division candidate SR1 et code gracilibactéries - Candidate division SR1 and gracilibacteria code
La division candidate SR1 et le code gracilibactéries (tableau de traduction 25) sont utilisés dans deux groupes de bactéries (jusqu'à présent) non cultivées présentes dans les environnements marins et d'eau douce et dans les intestins et la cavité buccale des mammifères entre autres. La différence par rapport à la norme et au code bactérien est que UGA représente un codon glycine supplémentaire et ne code pas pour la terminaison.
Le code
AAs = FFLLSSSSYY**CCGWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSRRVVVVAAAADDEEGGGG
Starts = ---M-------------------------------M---------------M------------
Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Bases : adénine (A), cytosine (C), guanine (G) et thymine (T) ou uracile (U).
Acides aminés : Alanine (Ala, A), Arginine (Arg, R), Asparagine (Asn, N), Acide aspartique (Asp, D), Cystéine (Cys, C), Acide glutamique (Glu, E), Glutamine (Gln , Q), Glycine (Gly, G), Histidine (His, H), Isoleucine (Ile, I), Leucine (Leu, L), Lysine (Lys, K), Méthionine (Met, M), Phénylalanine (Phe, F), Proline (Pro, P), Sérine (Ser, S), Thréonine (Thr, T), Tryptophane (Trp, W), Tyrosine (Tyr, Y) et Valine (Val, V).
Différence avec le code standard
codon d'ADN | ARN codon | Ce code (25) | Code standard (1) | |
---|---|---|---|---|
ATG | UGA | Gly (G) | STOP = Ter (*) |
Codons d'initiation
- AOT, GUG, UUG
Gamme systématique
Voir également
Les références
Cet article incorpore du texte de la National Library of Medicine des États-Unis , qui est dans le domaine public .