Division candidate SR1 et code gracilibactéries - Candidate division SR1 and gracilibacteria code

La division candidate SR1 et le code gracilibactéries (tableau de traduction 25) sont utilisés dans deux groupes de bactéries (jusqu'à présent) non cultivées présentes dans les environnements marins et d'eau douce et dans les intestins et la cavité buccale des mammifères entre autres. La différence par rapport à la norme et au code bactérien est que UGA représente un codon glycine supplémentaire et ne code pas pour la terminaison.

Le code

   AAs = FFLLSSSSYY**CCGWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSRRVVVVAAAADDEEGGGG
Starts = ---M-------------------------------M---------------M------------
 Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
 Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
 Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

Bases : adénine (A), cytosine (C), guanine (G) et thymine (T) ou uracile (U).

Acides aminés : Alanine (Ala, A), Arginine (Arg, R), Asparagine (Asn, N), Acide aspartique (Asp, D), Cystéine (Cys, C), Acide glutamique (Glu, E), Glutamine (Gln , Q), Glycine (Gly, G), Histidine (His, H), Isoleucine (Ile, I), Leucine (Leu, L), Lysine (Lys, K), Méthionine (Met, M), Phénylalanine (Phe, F), Proline (Pro, P), Sérine (Ser, S), Thréonine (Thr, T), Tryptophane (Trp, W), Tyrosine (Tyr, Y) et Valine (Val, V).

Différence avec le code standard

codon d'ADN ARN codon Ce code (25) Code standard (1)
ATG UGA Gly (G) STOP = Ter (*)

Codons d'initiation

  • AOT, GUG, UUG

Gamme systématique

Voir également

Les références

Cet article incorpore du texte de la National Library of Medicine des États-Unis , qui est dans le domaine public .

Liens externes