Haplogroupe D-M174 - Haplogroup D-M174

Haplogroupe D-M174
Distribution des haplogroupes D (Y-DNA).png
Heure d'origine possible 50 000 - 60 000 ans PA

65 200 [IC à 95 % 62 100 <-> 68 300] ans pb
Âge de coalescence 46 300 [IC à 95 % 43 500 <-> 49 100] pb
Lieu d'origine possible Asie (éventuellement Asie de l' Est et centrale ou Asie du Sud-Est )
Ancêtre D (D-CTS3946)
Descendance D-Z27276 (D1a1)
D-M55 (D1a2a)
D-Y34637 (D1a2b)
Définition des mutations M174, IMS-JST021355, PAGES00003

L'haplogroupe D1 ou D-M174 est une sous-clade de l' haplogroupe D-CTS3946 . Cet haplogroupe mâle se trouve principalement en Asie de l'Est et dans les îles Andaman , bien qu'on le trouve aussi régulièrement avec une faible fréquence en Asie centrale et en Asie du Sud-Est continentale . On le trouve également jusqu'en Europe et au Moyen-Orient dans des fréquences plus basses.

Origines

Route de migration probable de l'haplogroupe D
Carte de migration des haplogroupes en Eurasie orientale. Haplogroupe D et ses sous-clades représentés en turquoise.

On pense que l'haplogroupe D-M174 est originaire d' Asie quelque 60 000 ans avant le présent. Alors que l'haplogroupe D-M174 avec l' haplogroupe E contient le polymorphisme YAP distinctif (qui indique leur ascendance plus proche que C), aucun chromosome de l'haplogroupe D-M174 n'a été trouvé en dehors de l'Asie. L'haplogroupe D1 est souvent associé aux populations « d'Asie du Nord ».

Plusieurs études (Hammer et al. 2006, Shinoda 2008, Matsumoto 2009, Cabrera et al. 2018) suggèrent que l'haplogroupe paternel D-M174 est originaire d'Asie centrale . Selon Hammer et al., l'haplogroupe D-M174 est originaire du Tibet et des montagnes de l'Altaï. Il suggère qu'il y a eu plusieurs vagues en Eurasie orientale.

Une étude de 2017 de Mondal et al. constate que le peuple Riang (une population tibéto-birmane) et les Andamanais partagent le même clade D (D1a3 également connu sous le nom de D2a2b), et ont leurs lignées les plus proches avec d'autres clades en Asie de l'Est. Les Jarawa et les Onge ont partagé ce D1a2b entre eux au cours des ~7000 dernières années. Le D1a2b d'Asie de l'Est avait divergé de la lignée japonaise D1a2a il y a environ 53 000 ans. Les auteurs ont conclu que : « Cela suggère fortement que l'haplogroupe D n'indique pas une ascendance distincte pour les populations andamanaises. Au contraire, l'haplogroupe D faisait partie de la variation permanente portée par l'expansion orientale de l'OOA, et plus tard perdu de la plupart des populations sauf à Andaman et partiellement au Japon et au Tibet ».

Une étude réalisée en 2019 par Haber et al a montré que l'haplogroupe D-M174 est originaire d'Asie centrale et a évolué au fur et à mesure de sa migration vers différentes directions du continent. Un groupe de population a migré vers la Sibérie, d'autres vers le Japon et le Tibet, et un autre groupe a migré vers les îles Andaman.

Aperçu

On le trouve aujourd'hui à une fréquence élevée parmi les populations du Tibet , du nord du Myanmar , du Qinghai , de l' archipel japonais et des îles Andaman , mais curieusement pas autant dans le reste de l' Inde . Les Aïnous du Japon et divers peuples tibéto-birmans (comme le peuple Tripuri ) sont connus pour posséder presque exclusivement des chromosomes de l'haplogroupe D-M174. Les chromosomes de l'haplogroupe D-M174 se trouvent également à des fréquences faibles à modérées chez les Bai , les Dai , les Han , les Hui , les Mandchous , les Miao , les Tujia , les Xibe , les Yao et les Zhuang de Chine et parmi plusieurs populations minoritaires du Sichuan et du Yunnan qui parlent tibéto- Les langues birmanes et résident à proximité des Tibétains, tels que le Jingpo , le Jino , le Mosuo , le Naxi , le Pumi , le Qiang et le Yi .

L'haplogroupe D se trouve également dans les populations de Chine proprement dite et de Corée, mais avec une fréquence beaucoup plus faible que dans les populations du Tibet et du Japon. Une étude publiée en 2011 a trouvé du D-M174 chez 2,49% (43/1729) des hommes chinois Han, avec des fréquences de cet haplogroupe tendant à être plus élevées que la moyenne vers le nord et vers l'ouest du pays (5/56 = 8,9% D-M174 Shaanxi Han, 13/221 = 5,9% D-M174 Gansu Han, 6/136 = 4,4% D-M174 Yunnan Han, 1/27 = 3,7% D-M174 Guangxi Han, 2/61 = 3,3% D- M174 Hunan Han, 2/62 = 3,2% D-M174 Sichuan Han). Dans une autre étude sur l'ADN-Y chinois Han publiée en 2011, l'haplogroupe D-M174 a été observé dans 1,94 % (7/361) d'un échantillon de volontaires masculins chinois Han non apparentés à l'Université Fudan à Shanghai, avec les origines de la plupart des volontaires. remontant à l'est de la Chine (Jiangsu, Zhejiang, Shanghai et Anhui). En Corée, l'haplogroupe D-M174 a été observé dans 3,8% (5/133) d'un échantillon de Daejeon, 3/85 = 3,5% d'un échantillon de Séoul, 3,3% (3/90) d'un échantillon de Jeolla, 2,4 % (2/84) d'un échantillon de Gyeongsang, 2,3% (13/573) d'un autre échantillon de Séoul, 1,4% (1/72) d'un échantillon de Chungcheong, 1,1% (1/87) d'un échantillon de Jeju , et 0,9% (1/110) d'un troisième échantillon de Séoul-Gyeonggi. Dans d'autres études, l'haplogroupe D-M174 a été observé dans 6,7% (3/45) et 4,0% (3/75) des échantillons de Corée sans aucune autre spécification de la zone d'échantillonnage. Peu de données à haute résolution concernant la position phylogénétique des membres chinois Han et coréens de l'haplogroupe D à ADN-Y ont été publiées, mais les données disponibles suggèrent que la plupart des membres chinois Han de l'haplogroupe D devraient appartenir à des clades fréquemment rencontrés chez les Tibétains (et en particulier les Clade D-M15, également présent chez les locuteurs de certaines langues lolo-birmane et hmong-mien), alors que la plupart des membres coréens de l'haplogroupe D devraient appartenir au clade D-M55, que l'on trouve fréquemment chez les Ainu , les Ryukyuan et les Japonais .

L'haplogroupe D Y-ADN a été trouvé (bien qu'avec une faible fréquence) parmi les populations modernes de la steppe eurasienne , telles que les Altaïens du Sud (6/96 = 6,3% D-M174(xM15), 6/120 = 5,0% D-P47) , Kazakhs (1/54 = 1,9% D-M174, 6/1294 = 0,5% D), Nogais (4/76 = 5,3% D-M174 Kara Nogai, 1/87 = 1,1% D-M174 Kuban Nogai), Khalkhas (1/24 = 4,2 % D-M174, 3/85 = 3,5 % D-M174, 2/149 D-M15 + 2/149 D-P47 = 4/149 = 2,7 % D-M174 au total), Zakhchin (2 /60 = 3,3% D-M174), Uriankhai (1/60 = 1,7% D-M174) et Kalmouks (5/426 = 1,2% D-M174). Il a également été trouvé parmi les populations modernes linguistiquement similaires ( turc ou mongolique ) de la ceinture désertique et oasienne au sud de la steppe, telles que les Yugurs , les Bao'an , les Monguors , les Ouïghours et les Ouzbeks . Lors d'essais commerciaux, des membres ont été trouvés aussi loin à l'ouest que la Roumanie en Europe et l' Irak en Asie occidentale.

Contrairement à l'haplogroupe C-M217, l'haplogroupe D-M174 ne se trouve pas dans le Nouveau Monde ; il n'est présent dans aucune population amérindienne moderne (nord, centre ou sud). Bien qu'il soit possible qu'il ait voyagé dans le Nouveau Monde comme l'haplogroupe C-M217, ces lignées se sont apparemment éteintes.

L'haplogroupe D-M174 est également remarquable pour sa différenciation géographique plutôt extrême, avec un sous-ensemble distinct de chromosomes de l'haplogroupe D-M174 se trouvant exclusivement dans chacune des populations qui contient un grand pourcentage d'individus dont les chromosomes Y appartiennent à l'haplogroupe D-M174 : haplogroupe D-M15 parmi les Tibétains (ainsi que , entre autres Asie de l' Est et d' Asie du Sud - Est des populations qui affichent les basses fréquences de haplogroupe D-M174 Y chromosomes), haplogroupe D-M55 entre les différentes populations de l'archipel japonais et à basse fréquence entre Coréens , Haplogroupe D-P99 parmi les habitants du Tibet et d'autres parties de l'Eurasie centrale ( par exemple la Mongolie et l' Altaï ). D-M174* sans test positif des sous-clades D-M15 ou D-M55 se trouve à des fréquences élevées chez les insulaires d'Andaman et récemment la sous-clade andamanaise est le D-Y34637 (D1a2b). Un autre type (ou types) de paragroupe D-M174* sans sous-clades testées positives de D-M15, D-P47 ou D-M55 se trouve à une très faible fréquence parmi les populations turques et mongoles d' Asie centrale , s'élevant à pas plus de 1% au total. Cette diversification apparemment ancienne de l'haplogroupe D-M174 suggère qu'il pourrait peut-être être mieux caractérisé en tant que "super-haplogroupe" ou "macro-haplogroupe".

Dans une étude, la fréquence de l'haplogroupe D-M174 sans sous-clades testées positives trouvées chez les Thaïlandais était de 10 %. Su et al. (2000) ont trouvé DE-YAP/DYS287(xM15) dans 11,1% (5/45) d'un ensemble de trois échantillons de Thaïlande (dont 20% (4/20) North Thai, 20% (1/5) So , et 0% (0/20) Northeast Thai) et dans 16,7% (1/6) d'un échantillon de Guam . Pendant ce temps, les auteurs ont trouvé D-M15 dans 15% d'une paire d'échantillons de Yao (dont 30% (3/10) Yao Jinxiu et 0% (0/10) Yao Nandan ), 14,3% (2/14) d'un échantillon de Yi , 3,8% (1/26) d'un échantillon de Cambodgiens , et 3,6% (1/28) d'un échantillon de Zhuang . Dong et al. (2002) ont trouvé des chromosomes Y DE-YAP dans 12,5% (2/16) d'un échantillon de Jingpo de Luxi City, Yunnan , 10,0% (2/20) d'un échantillon de Dai de Luxi City, Yunnan , et 1,82% (1/55) d'un échantillon de Nu des comtés de Gongshan et Fugong du Yunnan.

Distribution et sous-clades

Les chromosomes Y de l'haplogroupe D-M174 que l'on trouve chez les populations tibéto-birmanes ainsi que chez les habitants de l'archipel japonais (haplogroupe D1a2b, D1a2a et D1a1). D-M55 (D1a2a) sont particulièrement distinctifs, portant un complexe d'au moins cinq mutations individuelles le long d'une branche interne de la phylogénie de l'haplogroupe D-M174 , les distinguant ainsi clairement des autres chromosomes de l'haplogroupe D-M174 que l'on trouve chez les Tibétains et insulaires d'Andaman et fournissant la preuve que l'haplogroupe D-M55 du chromosome Y était l'haplogroupe modal de la population ancestrale qui a développé la culture préhistorique Jōmon dans les îles japonaises.

Il est suggéré que la majorité des porteurs du chromosome Y D-M174 ont migré de l'Asie centrale vers l'Asie de l'Est . Un groupe a migré vers les îles Andaman , formant ainsi ou aidant à former le peuple andamanais . Un autre groupe est resté au Tibet moderne et au sud de la Chine (aujourd'hui peuples tibéto-birmans ) et un autre groupe a migré vers le Japon, peut-être via la péninsule coréenne ( peuple pré- Jōmon ).

Sous-clades :

D-Z27276 (D1a1)

L'haplogroupe D-Z27276 est l'ancêtre commun de D-M15 et D-P99, qui sont communs au Tibet (Chine).

D-M15 (D1a1a)

D-M15 a été signalé pour la première fois dans un échantillon du Cambodge et du Laos (1/18 = 5,6%) et dans un échantillon du Japon (1/23 = 4,3%) dans une enquête mondiale préliminaire sur la variation de l'ADN-Y dans populations humaines existantes.

Par la suite, l'ADN-Y qui appartient à l'haplogroupe D-M15 a été trouvé fréquemment parmi les populations de langue tibéto-birmane du sud-ouest de la Chine (dont environ 23 % de Qiang , environ 12,5 % de Tibétains et environ 9 % de Yi ) et parmi les Yao. personnes habitant le nord-est du Guangxi (6/31 = 19,4 % des basses terres Yao, 5/41 = 12,2 % des Mien indigènes, 3/41 = 7,3 % des plaines Kimmun) avec une répartition modérée dans toute l'Asie centrale , l'Asie de l'Est et l'Asie du Sud-Est continentale ( Indochine ) .

Une étude publiée en 2011 a retrouvé du D-M15 dans 7,8% (4/51) d'un échantillon de Hmong Daw et dans 3,4% (1/29) d'un échantillon de Xinhmul du nord du Laos .

D-P47 (D1a1b1)

Trouvé avec une fréquence élevée parmi les Pumi , les Naxi et les Tibétains , avec une distribution modérée en Asie centrale . Selon une étude, les Tibétains ont une fréquence d'environ 41,31% d'haplogroupe D-P47. L'haplogroupe D-P47 a été trouvé dans 9% de Xi'an Han.

D-Z3660 (D1a2)

Pendant environ 7 000 ans, les indigènes des îles Andaman ont partagé une ascendance commune les uns avec les autres. La lignée la plus proche des Andamanais est l'haplogroupe japonais D, avec lequel il entretient une relation très ancienne, remontant à environ 53 000 ans.

D-M55 (D1a2a)

Précédemment connu sous le nom de D-M55 , D-M64.1/Page44.1 (D1a2a) se trouve avec une fréquence élevée chez les Aïnous et avec une fréquence moyenne chez les Japonais et les Ryukyuans .

Kim et al. (2011) ont trouvé l'haplogroupe D-M55 dans 2,0% (1/51) d'un échantillon de Beijing Han et dans 1,6% (8/506) d'un pool d'échantillons de Corée du Sud, dont 3,3% (3/90) du Région de Jeolla, 2,4% (2/84) de la région de Gyeongsang, 1,4% (1/72) de la région de Chungcheong, 1,1% (1/87) de la région de Jeju, 0,9% (1/110) de Séoul- région de Gyeonggi, et 0% (0/63) de la région de Gangwon. Hammer et al. (2006) ont trouvé l'haplogroupe D-P37.1 dans 4,0% (3/75) d'un échantillon de Corée du Sud.

De faibles niveaux de D-M116.1 (une sous-clade de D-M55) chez les hommes du Timor actuel (0,2 % des hommes), on le trouve chez 9,5 % des hommes de Micronésie（Hammer et al. 2006, est censé refléter un mélange récent du Japon. C'est-à-dire que D-M116.1 (D1a2a1) est généralement considéré comme une sous-clade principale de D-M64.1 (D1a2a), probablement en raison de l' occupation militaire japonaise de l'Asie du Sud-Est pendant la Seconde Guerre mondiale .

Selon Mitsuru Sakitani , l'haplogroupe D1 est arrivé d'Asie centrale au nord de Kyushu via les montagnes de l' Altaï et la péninsule coréenne plus de 40 000 ans avant le présent, et l'haplogroupe D-M55 (D1a2a) est né dans l'archipel japonais.

D-Y34637 (D1a2b)

D1a2b (anciennement l'un des D*) se trouve à des fréquences élevées chez les insulaires d'Andaman, en particulier Onge (23/23 = 100 %), Jarawa (4/4 = 100 %).

D-L1378 (D1b)

D1b (L1378, M226.2) a été exclusivement trouvé dans des tests commerciaux dans deux familles de l'île de Mactan dans la région de Cebu aux Philippines .

D-M174*

D-M174 (xM15,P99,M55) se trouve dans certaines tribus minoritaires tibétaines du nord-est de l'Inde (dont les taux varient de zéro à 65%).

Le D-M174 basal (xM15,P47,M55) a été retrouvé chez environ 5% des Altaïens . Kharkov et al. ont trouvé l'haplogroupe D*(xD-M15) dans 6,3% (6/96) d'un pool d'échantillons d'Altaians du Sud provenant de trois localités différentes, en particulier à Kulada (5/46 = 10,9%) et Kosh-Agach (1/7 = 14%), bien qu'ils n'aient testé aucun marqueur de la sous-clade D-M55 ou D-P99. Kharkov et al. ont également signalé la découverte de l'ADN-Y de l'haplogroupe DE-M1 (xD-M174) chez un individu de l'Altaian du Sud de Beshpeltir (1/43 = 2,3 %).

Phylogénétique

Histoire phylogénétique

Article principal: table de conversion pour les haplogroupes du chromosome Y

Avant 2002, il y avait dans la littérature académique au moins sept systèmes de nommage pour l'arbre phylogénétique du chromosome Y. Cela a conduit à une confusion considérable. En 2002, les principaux groupes de recherche se sont réunis et ont formé le Y-Chromosome Consortium (YCC). Ils ont publié un article commun qui a créé un nouvel arbre unique que tous ont accepté d'utiliser. Ce dernier, un groupe de scientifiques citoyens s'intéressant à la génétique des populations et à la généalogie génétique a formé un groupe de travail pour créer un arbre amateur visant avant tout à être ponctuel. Le tableau ci-dessous rassemble l'ensemble de ces travaux au point de l'arbre YCC 2002 de référence. Cela permet à un chercheur examinant la littérature publiée plus ancienne de passer rapidement d'une nomenclature à l'autre.

YCC 2002/2008 (abréviation) (α) (β) (γ) (δ) (ε) (ζ) (η) YCC 2002 (Longhand) YCC 2005 (Longhand) YCC 2008 (Longhand) YCC 2010r (Longhand) ISOGG 2006 ISOGG 2007 ISOGG 2008 ISOGG 2009 ISOGG 2010 ISOGG 2011 ISOGG 2012
D-M174 * * * * * * * * ré ré ré ré ré ré ré ré ré ré
D-M15 4 IV 3G 12 Eu5 H3 B D1 D1 D1 D1 D1 D1 D1 D1 D1 D1 D1
D-M55 * * * * * * * * D2 D2 D2 D2 D2 D2 D2 D2 D2 D2
D-P12 4 IV 3G 11 Eu5 H2 B D2a D2a D2a1a1 D2a1a1 D2 D2 D2a1a1 D2a1a1 D2a1a1 supprimé supprimé
D-M116.1 4 IV 3G 11 Eu5 H2 B D2b* D2a D2a D2a D2a D2a D2a D2a D2a supprimé supprimé
D-M125 4 IV 3G 11 Eu5 H2 B D2b1 D2a1 D2a1 D2a1 D2a1 D2a1 D2a1 D2a1 D2a1 D2a1 D2a1
D-M151 4 IV 3G 11 Eu5 H2 B D2b2 D2a1 D2a2 D2a2 D2a2 D2a2 D2a2 D2a2 D2a2 D2a2 D2a2

Publications de recherche

Les équipes de recherche suivantes par leurs publications ont été représentées dans la création de l'arbre YCC.

Arbres phylogénétiques

Par arbre ISOGG（Version : 14.151）.


Voir également

La génétique

Sous-clades Y-ADN D-M174

Arborescence de l'ADN-Y

Arbre phylogénétique des haplogroupes d'ADN du chromosome Y humain
" Adam Y-chromosomique "
A00 A0-T 
A0 A1 
A1a A1b
A1b1 BT
B CT
DE FC
ré E C F
F1  F2  F3  GHIJK
g HIJK
IJK H
IJ K
je   J     LT        K2 
L     T    K2a         K2b      K2c     K2d K2e   
K-M2313      K2b1  P 
NON   S   M     P1     P2
N O Q R

Les références

Liens externes