Code mitochondrial de la ptérobranchie - Pterobranchia mitochondrial code

Le code mitochondrial de la ptérobranchie (table de traduction 24 ) est un code génétique utilisé par le génome mitochondrial de Rhabdopleura compacta ( Pterobranchia ). Les Pterobranchia sont l'un des deux groupes des Hemichordata qui, avec les Echinodermata et Chordata, forment les trois principales lignées de deutérostomes . AUA se traduit par isoleucine dans Rhabdopleura comme il le fait dans les échinodermes et Enteropneusta tandis que AUA code la méthionine dans le Chordata. L'attribution de l'AGG à la lysine ne se trouve pas ailleurs dans les mitochondries de deutérostomes mais elle se produit dans certains taxons d' Arthropoda . Ce code partage avec de nombreux autres codes mitochondriaux la réaffectation de l'UGA STOP au tryptophane , et de l'AGG et de l'AGA à un acide aminé autre que l' arginine . Les codons d' initiation dans Rhabdopleura compacta sont ATG et GTG.

Le code 24 est très similaire au code mitochondrial 33 pour la ptérobranchie.

Le code

   AAs = FFLLSSSSYY**CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSSKVVVVAAAADDEEGGGG
Starts = ---M---------------M---------------M---------------M------------
 Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
 Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
 Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

Bases: adénine (A), cytosine (C), guanine (G) et thymine (T) ou uracile (U).

Acides aminés: Alanine (Ala, A), Arginine (Arg, R), Asparagine (Asn, N), Acide aspartique (Asp, D), Cystéine (Cys, C), Acide glutamique (Glu, E), Glutamine (Gln , Q), Glycine (Gly, G), Histidine (His, H), Isoleucine (Ile, I), Leucine (Leu, L), Lysine (Lys, K), Méthionine (Met, M), Phénylalanine (Phe, F), Proline (Pro, P), Serine (Ser, S), Threonine (Thr, T), Tryptophane (Trp, W), Tyrosine (Tyr, Y), Valine (Val, V)

Différences par rapport au code standard

Codons d'ADN Codons ARN Ce code (24) Code standard (1)
AGA AGA Ser (S) Arg (R)
AGG AGG Lys (K) Arg (R)
TGA UGA Trp (W) STOP = Ter (*)

Voir également

Les références

Cet article incorpore le texte de la Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis , qui est dans le domaine public .

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