Pharmacogénomique - Pharmacogenomics

  (Redirigé de la pharmacogénétique )

La pharmacogénomique est l'étude du rôle du génome dans la réponse aux médicaments . Son nom ( pharmaco- + génomique ) reflète sa combinaison de pharmacologie et de génomique . La pharmacogénomique analyse comment la constitution génétique d'un individu affecte sa réponse aux médicaments. Il traite de l'influence de la variation génétique acquise et héritée sur la réponse médicamenteuse chez les patients en corrélant l'expression génique ou les polymorphismes mononucléotidiques avec la pharmacocinétique ( absorption , distribution , métabolisme et élimination des médicaments ) et la pharmacodynamique (effets médiés par les cibles biologiques d' un médicament ). Le terme pharmacogénomique est souvent utilisé de manière interchangeable avec la pharmacogénétique . Bien que les deux termes se rapportent à la réponse médicamenteuse basée sur des influences génétiques, la pharmacogénétique se concentre sur les interactions médicamenteuses uniques , tandis que la pharmacogénomique englobe une approche d'association plus large du génome, intégrant la génomique et l' épigénétique tout en traitant les effets de plusieurs gènes sur la réponse médicamenteuse.

La pharmacogénomique vise à développer des moyens rationnels pour optimiser la pharmacothérapie , par rapport au génotype des patients , pour assurer une efficacité maximale avec des effets indésirables minimes . Grâce à l'utilisation de la pharmacogénomique, on espère que les traitements médicamenteux pharmaceutiques pourront s'écarter de ce que l'on appelle l'approche «une dose pour tous». La pharmacogénomique tente également d'éliminer la méthode de prescription par essais et erreurs, permettant aux médecins de prendre en considération les gènes de leur patient, la fonctionnalité de ces gènes, et comment cela peut affecter l'efficacité des traitements actuels ou futurs du patient (et le cas échéant, expliquer l’échec des traitements antérieurs). De telles approches promettent l'avènement de la médecine de précision et même de la médecine personnalisée , dans laquelle les médicaments et les combinaisons de médicaments sont optimisés pour des sous-ensembles étroits de patients ou même pour la constitution génétique unique de chaque individu. Qu'il soit utilisé pour expliquer la réponse d'un patient ou son absence à un traitement, ou pour servir d'outil prédictif, il espère obtenir de meilleurs résultats thérapeutiques, une plus grande efficacité, une minimisation de la survenue de toxicités médicamenteuses et d'effets indésirables (EI). Pour les patients qui n'ont pas de réponse thérapeutique à un traitement, des thérapies alternatives peuvent être prescrites qui correspondent le mieux à leurs besoins. Afin de fournir des recommandations pharmacogénomiques pour un médicament donné, deux types d'intrants possibles peuvent être utilisés: le génotypage ou le séquençage de l'exome ou du génome entier . Le séquençage fournit beaucoup plus de points de données, y compris la détection de mutations qui terminent prématurément la protéine synthétisée ( codon d'arrêt précoce ).

Histoire

La pharmacogénomique a été reconnue pour la première fois par Pythagore vers 510 avant JC quand il a fait un lien entre les dangers de l'ingestion de fèves avec l'anémie hémolytique et le stress oxydatif. Cette identification a ensuite été validée et attribuée à une carence en G6PD dans les années 1950 et appelée favisme . Bien que la première publication officielle remonte à 1961, les années 1950 ont marqué les débuts officieux de cette science. Des rapports de paralysie prolongée et de réactions mortelles liées à des variantes génétiques chez des patients dépourvus de butyryl-cholinestérase (`` pseudocholinestérase '') après l'administration d'une injection de succinylcholine pendant l'anesthésie ont été rapportés pour la première fois en 1956. Le terme pharmacogénétique a été inventé pour la première fois en 1959 par Friedrich Vogel de Heidelberg, Allemagne (bien que certains articles suggèrent que c'était en 1957 ou 1958). À la fin des années 1960, des études jumelles ont soutenu la déduction de l'implication génétique dans le métabolisme des médicaments, avec des jumeaux identiques partageant des similitudes remarquables avec la réponse aux médicaments par rapport aux jumeaux fraternels. Le terme pharmacogénomique a commencé à apparaître vers les années 1990.

La première approbation par la FDA d'un test pharmacogénétique remonte à 2005 (pour les allèles du CYP2D6 et du CYP2C19).

Enzymes métabolisant les médicaments

Il existe plusieurs gènes connus qui sont en grande partie responsables des variations du métabolisme et de la réponse aux médicaments. L'objectif de cet article restera sur les gènes qui sont plus largement acceptés et utilisés en clinique pour des raisons de brièveté.

  • Cytochrome P450s
  • VKORC1
  • TPMT

Cytochrome P450

Les enzymes de métabolisation des médicaments (DME) les plus répandues sont les enzymes du cytochrome P450 (CYP). Ces enzymes introduisent des groupes réactifs ou polaires dans les xénobiotiques tels que les médicaments. Le terme Cytochrome P450 a été inventé par Omura et Sato en 1962 pour décrire la protéine contenant de l'hème, liée à la membrane, caractérisée par un pic spectral de 450 nm lorsqu'elle est complexée avec du monoxyde de carbone . La famille CYP humaine comprend 57 gènes, 18 familles et 44 sous-familles. Les protéines CYP sont commodément arrangées dans ces familles et sous-familles sur la base des similitudes identifiées entre les séquences d'acides aminés. Les enzymes qui partagent 35 à 40% d'identité sont attribuées à la même famille par un chiffre arabe , et celles qui partagent 55 à 70% constituent une sous-famille particulière avec une lettre désignée. Par exemple, CYP2D6 fait référence à la famille 2, à la sous-famille D et au gène numéro 6.

D'un point de vue clinique, les CYP les plus couramment testés comprennent: CYP2D6 , CYP2C19 , CYP2C9 , CYP3A4 et CYP3A5 . Ces gènes représentent le métabolisme d'environ 70 à 90% des médicaments d'ordonnance actuellement disponibles. Le tableau ci-dessous présente un résumé de certains des médicaments qui empruntent ces voies.

Métabolisme médicamenteux des principaux CYP
Enzyme Fraction du métabolisme du médicament (%) Exemples de médicaments
CYP2C9 dix Tolbutamide, ibuprofène, acide méfénamique, tétrahydrocannabinol, losartan, diclofénac
CYP2C19 5 S-méphénytoïne, amitriptyline, diazépam, oméprazole, proguanil, hexobarbital, propranolol, imipramine
CYP2D6 20-30 Débrisoquine, métoprolol, spartéine, propranolol, encaïnide, codéine, dextrométhorphane, clozapine, désipramine, halopéridol, amitriptyline, imipramine
CYP3A4 40-45 Érythromycine, éthinylestradiol, nifédipine, triazolam, cyclosporine, amitriptyline, imipramine
CYP3A5 <1 Érythromycine, éthinylestradiol, nifédipine, triazolam, cyclosporine, amitriptyline, aldostérone

CYP2D6

Aussi connu sous le nom de débrisoquine hydroxylase (du nom du médicament qui a conduit à sa découverte), le CYP2D6 est le gène CYP le plus connu et le plus étudié. C'est un gène d'un grand intérêt également en raison de sa nature hautement polymorphe et de son implication dans un grand nombre de métabolismes médicamenteux (à la fois comme voie majeure et mineure). Plus de 100 variantes génétiques du CYP2D6 ont été identifiées.

CYP2C19

Découvert au début des années 1980, le CYP2C19 est le deuxième gène le plus étudié et le mieux compris en pharmacogénomique. Plus de 28 variantes génétiques ont été identifiées pour le CYP2C19, dont elles affectent le métabolisme de plusieurs classes de médicaments, tels que les antidépresseurs et les inhibiteurs de la pompe à protons .

CYP2C9

Le CYP2C9 constitue la majorité de la sous-famille des CYP2C, représentant environ 20% du contenu hépatique. Il est impliqué dans le métabolisme d'environ 10% de tous les médicaments, qui comprennent des médicaments à fenêtre thérapeutique étroite comme la warfarine et le tolbutamide . Il existe environ 57 variantes génétiques associées au CYP2C9.

CYP3A4 et CYP3A5

La famille CYP3A est la plus abondante dans le foie, le CYP3A4 représentant 29% du contenu hépatique. Ces enzymes couvrent également entre 40 et 50% des médicaments d'ordonnance actuels, le CYP3A4 représentant 40 à 45% de ces médicaments. CYP3A5 a plus de 11 variantes génétiques identifiées au moment de cette publication.

VKORC1

La sous-unité 1 du complexe de vitamine K époxyde réductase ( VKORC1 ) est responsable de la pharmacodynamique de la warfarine. VKORC1 associé au CYP2C9 sont utiles pour identifier le risque de saignement lors de l'administration de warfarine. La warfarine agit en inhibant le VKOR, qui est codé par le gène VKORC1. Les personnes atteintes de polymorphisme ont une réponse affectée au traitement par la warfarine.

TPMT

La thiopurine méthyltransférase (TPMT) catalyse la S-méthylation des thiopurines, régulant ainsi l'équilibre entre le nucléotide thioguanine cytotoxique et les métabolites inactifs dans les cellules hématopoïétiques. Le TPMT est fortement impliqué dans le métabolisme 6-MP et l'activité TMPT et le génotype TPMT est connu pour affecter le risque de toxicité. Des niveaux excessifs de 6-MP peuvent provoquer une myélosuppression et une myélotoxicité. Un litige en matière de brevets connexe est survenu dans Mayo Collaborative Services v. Prometheus Laboratories, Inc. , dans lequel la Cour suprême des États-Unis a conclu que le brevet concernant la mesure des doses du médicament était admissible au brevet.

Codéine , clopidogrel , tamoxifène et warfarine, quelques exemples de médicaments qui suivent les voies métaboliques ci-dessus.

Prescription prédictive

Les génotypes des patients sont généralement classés dans les phénotypes prédits suivants:

  • Métaboliseur ultra-rapide: patients ayant une activité métabolique considérablement accrue;
  • Métaboliseur extensif: activité métabolique normale;
  • Métaboliseur intermédiaire: patients ayant une activité métabolique réduite; et
  • Faible métaboliseur: patients avec peu ou pas d'activité métabolique fonctionnelle.

Les deux extrêmes de ce spectre sont les métaboliseurs lents et les métaboliseurs ultra-rapides. L'efficacité d'un médicament n'est pas seulement basée sur les statuts métaboliques ci-dessus, mais également sur le type de médicament consommé. Les médicaments peuvent être classés en deux groupes principaux: les médicaments actifs et les promédicaments. Les médicaments actifs désignent les médicaments inactivés au cours du métabolisme et les promédicaments sont inactifs jusqu'à ce qu'ils soient métabolisés.

Un processus global du fonctionnement de la pharmacogénomique dans une pratique clinique. À partir des résultats bruts du génotype, cela est ensuite traduit en trait physique, le phénotype. Sur la base de ces observations, un dosage optimal est évalué.

Par exemple, nous avons deux patients qui prennent de la codéine pour soulager la douleur. La codéine est une prodrogue, elle nécessite donc une conversion de sa forme inactive à sa forme active. La forme active de la codéine est la morphine, qui fournit l'effet thérapeutique du soulagement de la douleur. Si la personne A reçoit un allèle * 1 chacun de la mère et du père pour coder le gène CYP2D6, alors cette personne est considérée comme ayant un phénotype métaboliseur extensif (EM), car l'allèle * 1 est considéré comme ayant une fonction normale (ce serait être représenté par CYP2D6 * 1 / * 1). Si la personne B en revanche avait reçu un allèle * 1 de la mère et un allèle * 4 du père, cet individu serait un métaboliseur intermédiaire (IM) (le génotype serait CYP2D6 * 1 / * 4). Bien que les deux individus prennent la même dose de codéine, la personne B pourrait ne pas bénéficier des avantages thérapeutiques de la codéine en raison de la diminution du taux de conversion de la codéine en son homologue actif, la morphine.

Chaque phénotype est basé sur la variation allélique au sein du génotype individuel. Cependant, plusieurs événements génétiques peuvent influencer un même trait phénotypique, et l'établissement de relations génotype-phénotype peut donc être loin d'être consensuel avec de nombreux schémas enzymatiques. Par exemple, l'influence du variant allélique CYP2D6 * 1 / * 4 sur les résultats cliniques chez les patients traités par Tamoxifen reste débattue aujourd'hui. En oncologie, les gènes codant respectivement pour DPD , UGT1A1 , TPMT , CDA impliqués dans la pharmacocinétique du 5-FU / capécitabine , de l' irinotécan , de la 6-mercaptopurine et de la gemcitabine / cytarabine , ont tous été décrits comme hautement polymorphes. Un solide corpus de preuves suggère que les patients affectés par ces polymorphismes génétiques connaîtront des toxicités sévères / mortelles lors de la prise de médicaments, et que le dépistage pré-thérapeutique aide à réduire le risque de toxicités liées au traitement grâce à des stratégies de dosage adaptatives.

Applications

La liste ci-dessous fournit quelques applications plus connues de la pharmacogénomique:

  • Améliorer la sécurité des médicaments et réduire les effets indésirables;
  • Adapter les traitements pour répondre à la prédisposition génétique unique des patients, en identifiant le dosage optimal;
  • Améliorer la découverte de médicaments ciblant les maladies humaines; et
  • Améliorer la preuve de principe pour les essais d'efficacité.

La pharmacogénomique peut être appliquée à plusieurs domaines de la médecine, notamment la gestion de la douleur , la cardiologie , l' oncologie et la psychiatrie . Il peut également exister une place dans la médecine légale , dans laquelle la pharmacogénomique peut être utilisée pour déterminer la cause de décès dans les décès liés à la drogue où aucun résultat ne ressort de l' autopsie .

Dans le traitement du cancer , des tests pharmacogénomiques sont utilisés pour identifier les patients les plus susceptibles de répondre à certains médicaments anticancéreux . En santé comportementale, les tests pharmacogénomiques fournissent des outils aux médecins et aux soignants pour mieux gérer la sélection des médicaments et l'amélioration des effets secondaires. La pharmacogénomique est également connue sous le nom de diagnostic compagnon, ce qui signifie que les tests sont associés à des médicaments. Les exemples incluent le test KRAS avec le cetuximab et le test EGFR avec le géfitinib . Outre l'efficacité, la pharmacogénétique germinale peut aider à identifier les patients susceptibles de subir des toxicités graves lorsqu'ils sont administrés avec des cytotoxiques présentant une désintoxication altérée en relation avec un polymorphisme génétique, comme le 5-FU canonique. En particulier, les dérégulations génétiques affectant les gènes codant pour DPD , UGT1A1 , TPMT , CDA et CYP2D6 sont désormais considérées comme des problèmes critiques pour les patients traités respectivement par 5-FU / capécitabine, irinotécan, mercaptopurine / azathioprine, gemcitabine / capécitabine / AraC et tamoxifène.

Dans les troubles cardiovasculaires , la principale préoccupation est la réponse aux médicaments tels que la warfarine , le clopidogrel , les bêtabloquants et les statines . Chez les patients atteints du CYP2C19, qui prennent du clopidogrel, le risque cardiovasculaire est élevé, ce qui entraîne des mises à jour de la notice du médicament par les régulateurs. Chez les patients atteints de diabète de type 2 , le génotypage de l' haptoglobine (Hp) montre un effet sur les maladies cardiovasculaires, avec Hp2-2 à risque plus élevé et une supplémentation en vitamine E réduisant le risque en affectant le HDL .

En psychiatrie, à partir de 2010, les recherches se sont particulièrement concentrées sur le 5-HTTLPR et le DRD2 .

Implémentation clinique

Les initiatives visant à stimuler l'adoption par les cliniciens comprennent le programme Ubiquitous Pharmacogenomics en Europe et le Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) aux États-Unis. Dans une enquête menée en 2017 auprès de cliniciens européens, au cours de l'année précédente, les deux tiers n'avaient pas commandé de test pharmacogénétique.

En 2010, le centre médical de l'Université Valderbilt a lancé la ressource pharmacogénomique pour l'amélioration des décisions en matière de soins et de traitement (PREDICT); dans l'enquête de 2015, les deux tiers des cliniciens avaient commandé un test pharmacogénétique.

Aux États-Unis, la FDA a mis à jour les notices des médicaments sur la base de preuves génomiques.

En 2019, le plus grand assureur de santé privé, UnitedHealthcare, a annoncé qu'il paierait des tests génétiques pour prédire la réponse aux médicaments psychiatriques; à compter de 2019, il est le seul assureur privé à offrir une telle couverture.

Exemples d'études de cas

Cas A - Réaction indésirable antipsychotique

Le patient A souffre de schizophrénie. Leur traitement comprenait une combinaison de ziprasidone, d'olanzapine, de trazodone et de benztropine. Le patient a présenté des étourdissements et une sédation, de sorte qu'ils ont cessé progressivement de prendre de la ziprasidone et de l'olanzapine et sont passés à la quétiapine. Trazodone a été arrêté. Le patient a alors présenté une transpiration excessive, une tachycardie et des douleurs au cou, a pris du poids considérable et a eu des hallucinations. Cinq mois plus tard, la quétiapine a été diminuée et arrêtée, avec la réintroduction de la ziprasidone dans leur traitement en raison de la prise de poids excessive. Bien que le patient ait perdu le poids excessif qu'il gagnait, il a ensuite développé une raideur musculaire, des rouages , des tremblements et des sueurs nocturnes. Lorsque la benztropine a été ajoutée, ils ont eu une vision floue. Après cinq mois supplémentaires, le patient est passé de la ziprasidone à l'aripiprazole. Au cours de 8 mois, le patient A a progressivement connu une prise de poids plus importante, une sédation, des difficultés de démarche, une raideur, des mouvements oculaires à crémaillère et dyskinétiques. Un test pharmacogénomique a prouvé plus tard que le patient avait un CYP2D6 * 1 / * 41, qui a un phénotype prédit de IM et CYP2C19 * 1 / * 2 avec un phénotype prédit de IM également.

Cas B - Gestion de la douleur

La patiente B est une femme qui a accouché par césarienne. Son médecin lui a prescrit de la codéine pour la douleur post-césarienne. Elle a pris la dose standard prescrite, mais a eu des nausées et des étourdissements pendant qu'elle prenait de la codéine. Elle a également remarqué que son bébé allaité était léthargique et se nourrissait mal. Lorsque la patiente a mentionné ces symptômes à son médecin, ils lui ont recommandé d'arrêter l'utilisation de codéine. En quelques jours, les symptômes de la patiente et de son enfant n'étaient plus présents. On suppose que si la patiente avait subi un test pharmacogénomique, cela aurait révélé qu'elle pourrait avoir eu une duplication du gène CYP2D6 la plaçant dans la catégorie des métaboliseurs ultra-rapides (UM), expliquant ses effets indésirables à l'utilisation de la codéine.

Cas C - Avertissement de la FDA sur le surdosage de codéine chez les nourrissons

Le 20 février 2013, la FDA a publié une déclaration répondant à une grave préoccupation concernant le lien entre les enfants connus sous le nom de CYP2D6 UM et les réactions mortelles à la codéine après une amygdalectomie et / ou une adénoïdectomie (chirurgie pour enlever les amygdales et / ou les végétations adénoïdes). Ils ont publié leur plus fort avertissement encadré pour élucider les dangers des UM CYP2D6 consommant de la codéine. La codéine est convertie en morphine par le CYP2D6, et ceux qui ont des phénotypes UM risquent de produire de grandes quantités de morphine en raison de la fonction accrue du gène. La morphine peut atteindre des quantités potentiellement mortelles ou mortelles, comme cela est devenu évident avec le décès de trois enfants en août 2012.

Polypharmacie

Un rôle potentiel que pourrait jouer la pharmacogénomique serait de réduire la survenue de la polypharmacie . Il est théorisé qu'avec des traitements médicamenteux adaptés, les patients n'auront pas besoin de prendre plusieurs médicaments destinés à traiter la même affection. Ce faisant, ils pourraient potentiellement minimiser la survenue des effets indésirables, améliorer les résultats du traitement et réduire les coûts en évitant d'acheter des médicaments étrangers. Un exemple de ceci peut être trouvé en psychiatrie , où les patients ont tendance à recevoir plus de médicaments que les patients non psychiatriques du même âge. Cela a été associé à un risque accru de prescription inappropriée.

Le besoin de thérapies médicamenteuses adaptées à la pharmacogénomique peut être le plus évident dans une enquête menée par le Slone Epidemiology Center de l'Université de Boston de février 1998 à avril 2007. L'étude a révélé qu'une moyenne de 82% des adultes aux États-Unis prennent au moins un médicaments (médicaments sur ordonnance ou en vente libre, vitamines / minéraux, suppléments à base de plantes / naturels) et 29% en prennent cinq ou plus. L'étude suggère que les personnes âgées de 65 ans ou plus continuent d'être les plus gros consommateurs de médicaments, 17 à 19% de ce groupe d'âge prenant au moins dix médicaments par semaine. La polypharmacie a également augmenté depuis 2000 de 23% à 29%.

Étiquetage des médicaments

La Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis semble être très investie dans la science de la pharmacogénomique, comme le démontrent les 120 médicaments et plus approuvés par la FDA qui incluent des biomarqueurs pharmacogénomiques dans leurs étiquettes. Ce nombre augmenté varie au fil des années. Une étude des étiquettes des médicaments approuvés par la FDA au 20 juin 2014 a révélé qu'il y avait 140 médicaments différents avec un biomarqueur pharmacogénomique dans leur étiquette. Comme un médicament peut avoir différents biomarqueurs, cela correspond à 158 paires médicament-biomarqueur. Seulement 29% ont déclaré une exigence ou une recommandation pour les tests de biomarqueurs génétiques, mais cela était plus élevé pour les médicaments oncologiques (62%). Le 22 mai 2005, la FDA a publié son premier Guide pour l'industrie: Soumissions de données pharmacogénomiques , qui clarifiait le type de données pharmacogénomiques devant être soumises à la FDA et quand. Les experts ont reconnu l'importance de la reconnaissance de la FDA selon laquelle les expériences de pharmacogénomique n'entraîneront pas de conséquences réglementaires négatives. La FDA a publié son dernier guide Clinical Pharmacogenomics (PGx): Premarket Evaluation in Early-Phase Clinical Studies and Recommendations for Labelling en janvier 2013. Le guide est destiné à traiter de l'utilisation des informations génomiques pendant le développement de médicaments et les processus d'examen réglementaire.

Défis

Phases consécutives et défis associés en pharmacogénomique.

Bien qu'il semble y avoir une acceptation générale du principe de base de la pharmacogénomique parmi les médecins et les professionnels de la santé, plusieurs défis existent qui ralentissent l'adoption, la mise en œuvre et la normalisation de la pharmacogénomique. Certaines des préoccupations soulevées par les médecins comprennent:

  • Limitation sur la façon d'appliquer le test aux pratiques cliniques et au traitement;
  • Un sentiment général de manque de disponibilité du test;
  • La compréhension et l'interprétation de la recherche factuelle; et
  • Questions éthiques, juridiques et sociales.

Les problèmes liés à la disponibilité du test incluent:

  • Le manque de disponibilité des données scientifiques : bien qu'il existe un nombre considérable de DME impliqués dans les voies métaboliques des médicaments, seule une fraction dispose de données scientifiques suffisantes pour valider leur utilisation dans un cadre clinique; et
  • Démonstration du rapport coût-efficacité de la pharmacogénomique : les publications sur la pharmacoéconomie de la pharmacogénomique sont rares, il n'existe donc pas à l'heure actuelle de preuves suffisantes pour valider le rapport coût-efficacité et les conséquences en termes de coût du test.

Bien que d'autres facteurs contribuent à la lente progression de la pharmacogénomique (comme l'élaboration de lignes directrices pour une utilisation clinique), les facteurs ci-dessus semblent être les plus courants.

Controverses

Certains allèles dont la fréquence varie entre les populations spécifiques se sont avérés être associés à des réponses différentielles à des médicaments spécifiques . Le bêta - bloquant aténolol est un anti - hypertenseur des médicaments qui apparaît plus nettement abaisser la pression artérielle de race blanche patients que d' Afro - américain patients aux États-Unis. Cette observation suggère que les populations caucasiennes et afro-américaines ont des allèles différents gouvernant la biochimie de l'acide oléique , qui réagissent différemment avec l'aténolol. De même, l' hypersensibilité au médicament antirétroviral abacavir est fortement associée à un polymorphisme mononucléotidique dont la fréquence varie d'une population à l'autre.

L'approbation par la FDA du médicament BiDil (dinitrate d'isosorbide / hydralazine) avec une étiquette spécifiant les Afro-Américains souffrant d'insuffisance cardiaque congestive, a provoqué une tempête de controverse sur la médecine raciale et les craintes de stéréotypes génétiques, même si l'étiquette de BiDil n'a pas précisé toutes les variantes génétiques mais était basée sur l'auto-identification raciale.

Futur

Les progrès informatiques ont permis un séquençage moins cher et plus rapide. La recherche s'est concentrée sur la chimie combinatoire , l'exploitation minière génomique, les technologies omiques et le criblage à haut débit .

À mesure que le coût par test génétique diminue, le développement de thérapies médicamenteuses personnalisées augmentera. La technologie permet maintenant l'analyse génétique de centaines de gènes cibles impliqués dans le métabolisme et la réponse des médicaments en moins de 24 heures pour moins de 1 000 $. Il s'agit d'un grand pas en avant vers l'intégration de la technologie pharmacogénétique dans les décisions médicales quotidiennes. De même, des sociétés comme deCODE Genetics , MD Labs Pharmacogenetics , Navigenics et 23andMe proposent des analyses génomiques. Les sociétés utilisent les mêmes puces de génotypage que celles utilisées dans les études GWAS et fournissent aux clients un récapitulatif du risque individuel pour divers traits et maladies et testent 500 000 SNP connus. Les coûts varient de 995 $ à 2 500 $ et comprennent des mises à jour avec de nouvelles données d'études au fur et à mesure qu'elles deviennent disponibles. Les forfaits les plus chers comprenaient même une séance téléphonique avec un conseiller en génétique pour discuter des résultats.

Éthique

La pharmacogénétique est devenue une question controversée dans le domaine de la bioéthique . La vie privée et la confidentialité sont des préoccupations majeures. Les preuves du bénéfice ou du risque d'un test génétique peuvent n'être que suggestives, ce qui pourrait entraîner des dilemmes pour les prestataires. Le développement de médicaments peut être affecté, avec de rares variantes génétiques faisant peut-être moins l'objet de recherches. L'accès et l'autonomie des patients sont également ouverts à la discussion.

Ressources Web

Ressources Web pour la pharmacogénomique
La source de données Utilisation principale URL
PharmVar Un référentiel central pour la variation pharmacogène qui se concentre sur la structure de l'haplotype et la variation allélique https://www.pharmvar.org
Outil de bioinformatique SuperCYP Contenant 1170 médicaments avec plus de 3800 interactions et environ 2000 SNP connus. Ces SNP sont répertoriés et classés en fonction de leur effet sur l'expression et / ou l'activité http://bioinformatics.charite.de/supercyp/
PharmGKB La base de connaissances sur la pharmacogénomique (PharmGKB) est un outil interactif destiné aux chercheurs qui étudient comment la variation génétique affecte la réponse aux médicaments https://www.pharmgkb.org/
base de données dbSNP Un référentiel de SNP et d'autres variantes qui ont été signalés après la découverte, compilés et officiellement nommés. Ce sont des SNP à tous les niveaux https://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/
FINDbase Répertoire des fréquences alléliques des marqueurs pharmacogénétiques dans différentes populations http://www.findbase.org/
Biomarqueurs pharmacogénomiques dans l'étiquetage des médicaments Un tableau qui identifie les médicaments approuvés par la FDA qui ont des étiquettes d'avertissement liées à la pharmacogénomique https://www.fda.gov/drugs/scienceresearch/researchareas/pharmacogenetics/ucm083378.htm
SNPedia Une base de données bioinformatique basée sur un wiki de SNP http://www.snpedia.com/index.php/SNPedia
Réseau de recherche en pharmacogénomique (PGRN) Le PGRN héberge des ressources et des informations pour stimuler la recherche collaborative en pharmacogénomique et en médecine de précision. http://www.pgrn.org/

Voir également

Les références

Lectures complémentaires

Liens externes

Journaux: